Химические основы биологических процессов : задачник
Покупка
Новинка
Издательство:
Омский государственный университет
Автор:
Шувалов Владислав Юрьевич
Соавтор:
Воронцова Марина Артуровна
Год издания: 2024
Кол-во страниц: 108
Дополнительно
Вид издания:
Практическое пособие
Уровень образования:
ВО - Бакалавриат
ISBN: 978-5-7779-2711-8
Артикул: 851874.01.99
Включает задачи и упражнения по курсу «Химические основы биологических процессов». Составлен в соответствии с программой курса и является учебно-методическим руководством для решения задач.
Для студентов направлений подготовки бакалавров 04.03.01 «Химия» и 05.03.06 «Урбоэкология», изучающих дисциплину «Химические основы биологических процессов».
Тематика:
ББК:
УДК:
ОКСО:
- ВО - Бакалавриат
- 04.03.01: Химия
- 05.03.06: Экология и природопользование
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования ОМСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ им. Ф.М. ДОСТОЕВСКОГО В. Ю. Шувалов, М. А. Воронцова ХИМИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ Задачник © Шувалов В. Ю., Воронцова М. А., 2024 © ФГАОУ ВО «ОмГУ им. Ф.М. Достоевского», 2024 ISBN 978-5-7779-2711-8 Омск 2024
УДК 577.1(024) ББК 54:56я73я05 Ш952 Рецензенты: канд. биол. наук, доцент, доцент кафедры химии ОмГМУ О. В. Атавина; канд. биол. наук, ведущий научный сотрудник Института теоретической и экспериментальной биофизики РАН Ю. В. Шаталин; канд. хим. наук, доцент, доцент кафедры органической и аналитической химии ОмГУ им. Ф.М. Достоевского А. К. Куратова Шувалов, В. Ю. Ш952 Химические основы биологических процессов : задачник / В. Ю. Шувалов, М. А. Воронцова. – Омск : Издательство Омского государственного университета им. Ф.М. Достоевского, 2024. – 1 CD-ROM. – Загл. с титул. экрана. ISBN 978-5-7779-2711-8 Включает задачи и упражнения по курсу «Химические основы биологических процессов». Составлен в соответствии с программой курса и является учебнометодическим руководством для решения задач. Для студентов направлений подготовки бакалавров 04.03.01 «Химия» и 05.03.06 «Урбоэкология», изучающих дисциплину «Химические основы биологических процессов». УДК 577.1(024) ББК 54:56я73я05 Текстовое электронное издание Самостоятельное электронное издание Минимальные системные требования: PC, процессор с частотой 1,3 ГГц или выше; ОЗУ 512 MБ; Microsoft Windows XP/Vista/7/8/10 и выше; Adobe Acrobat Reader 8.0 и выше; CD-ROM; мышь © Шувалов В. Ю., Воронцова М. А., 2024 © ФГАОУ ВО «ОмГУ им. Ф.М. Достоевского», 2024
Редактор Д.С. Нерозник Технический редактор Т.Н. Чечуков Программно-техническая реализация Т.Н. Чечукова Дата выпуска: 30.09.2024. 1 электрон. опт. диск (CD-ROM); 12 см. Тираж 9 копий. Объем 3,8 Мb. Издательство Омского государственного университета им. Ф.М. Достоевского 644077, г. Омск, пр. Мира, 55а тел.: 8 (3812) 22-25-71, 22-25-61, 64-13-07
Оглавление Введение ................................................................................................6 Тема 1. Аминокислоты ........................................................................7 Тема 2. Пептиды и белки ...................................................................11 Тема 3. Углеводы ................................................................................16 Тема 4. Нуклеозиды. Нуклеотиды и нуклеиновые кислоты...........23 Тема 5. Омыляемые липиды ..............................................................31 Тема 6. Неомыляемые липиды. Стероиды и гормоны ....................34 Тема 7. Строение клеточной мембраны ...........................................39 Тема 8. Витамины ...............................................................................45 Тема 9. Макро- и микроэлементы .....................................................49 Тема 10. Ферменты .............................................................................52 Тема 11. Биосинтез белка ..................................................................67 Тема 12. Метаболизм .........................................................................70 Индивидуальные задачи по ферментативной кинетике .................78 Рекомендуемая литература ................................................................88 Приложение 1. Структурные формулы и тривиальные названия аминокислот........................................................................89 Приложение 2. Кислотно-основные свойства важнейших α-аминокислот и их сокращенные обозначения ..............................90 Приложение 3. Основные представители D-альдоз ........................92 Приложение 4. Основные представители D-кетоз ..........................93 Приложение 5. Важнейшие представители моносахаридов ..........94 Приложение 6. Пуриновые и пиримидиновые азотистые основания ............................................................................................96 Приложение 7. Важнейшие нуклеотиды, входящие в состав нуклеиновых кислот ............................................................97 Приложение 8. Структурные формулы основных нуклеотидов ........................................................................................98 Приложение 9. Генетический код.....................................................99 Приложение 10. Наиболее распространенные природные жирные кислоты ...............................................................................100 Приложение 11. Гликолиз ...............................................................102 Приложение 12. Пентозофосфатный путь окисления глюкозы .............................................................................................103 4
Приложение 13. Цикл Кноопа–Линена ......................................... 104 Приложение 14. Цикл трикарбоновых кислот (цикл Кребса) ..... 105 Приложение 15. Дыхательная цепь митохондрий и ее компоненты .............................................................................. 106 Приложение 16. Орнитиновый цикл ............................................. 108 5
ВВЕДЕНИЕ Настоящий задачник предназначен для студентов, обучающихся по направлениям подготовки бакалавров 04.03.01 «Химия» и 05.03.06 «Урбоэкология», изучающих дисциплину «Химические основы биологических процессов», и позволяет им сформировать необходимые профессиональные компетенции. Курс «Химические основы биологических процессов» объединяет введение в структуру и функции биомолекул (как макромолекул, так и низкомолекулярных соединений), основы молекулярной биологии и биохимический подход к клеточным функциям. Цель дисциплины: сформировать у студентов системные представления о строении и функциях биомолекул, процессах биокатализа и метаболизма, а также познакомить с современным уровнем и перспективах развития биохимии и молекулярной биологии. В задачник включены задания и упражнения различного уровня сложности, охватывающие все разделы дисциплины, включая химические, биохимические и биофизические процессы. В темах, посвященных функциям белков, рассматривается ферментативная кинетика, характеристика основных метаболических путей и их взаимосвязь, а также возможность управления активностью ферментов и влияния на метаболические пути с помощью методов генной инженерии и лекарственных препаратов. При изучении ферментативных реакций и метаболических процессов рассматривается влияние на них витаминов, микроэлементов и гормонов. В приложениях приводятся справочные данные и схемы основных метаболических путей, которые способствуют процессу понимания, усвоения, запоминания и творческого применения теоретических знаний в решении конкретных практических задач. 6
ТЕМА 1 Аминокислоты 1. Изобразите проекционные формулы Фишера для следующих аминокислот (Приложение 1): А. D-аланин; Б. L-треонин; В. L-изолейцин; Г. D-серин; Д. L-серин. 2. Назовите аминокислоты по систематической и тривиальной номенклатуре и изобразите для них возможные относительные и абсолютные конфигурации: 3. Напишите схему синтеза 2-амино-3,3-диметилбутановой кислоты, используя метод Штреккера–Зелинского. 4. Напишите схему синтеза аминокислоты аланин из фталимида калия и диэтил броммалоната, используя метод Габриэля. 5. Напишите схему синтеза лизина из малонового эфира. Будет ли обладать оптической активностью полученная аминокислота? 7
6. Напишите схему разделения рацемической смеси аминокислоты лейцин, используя энзиматический метод разделения аминокислот. 7. Напишите уравнение взаимодействия α-аланина с бензил хлорформиатом и сравните основность аминогруппы в исходной аминокислоте и продукте ацилирования. 8. Из какой аминокислоты в результате биохимических процессов образуется нейромедиатор серотонин? Напишите схему этого превращения. 9. В результате in vitro монодекарбоксилирования какой α-аминокислоты образуется β-аланин? Объясните причины, по которым при декарбоксилировании этого субстрата не образуется α-аланин? 10. В результате декарбоксилирования какой аминокислоты образуется биогенный амин – путресцин? 11. Напишите реакцию in vitro декарбоксилирования гистидина и лизина. Какие функции выполняют продукты этих реакций? 12. Напишите полное уравнение реакции трансаминирования тирозина с 2-оксопентандиовой кислотой. Укажите роль витамина В6 в этом процессе. 13. Ацетоуксусная кислота образуется у больных сахарным диабетом из пировиноградной кислоты, которая может синтезироваться в организме в результате реакции трансаминирования. Напишите уравнение этой реакции трансаминирования. 14. Какое соединение образуется при обработке L-α-аланина азотистой кислотой? Обладает ли продукт этой реакции оптической активностью? 15. Напишите уравнение реакции in vitro дезаминирования α-амино-β-фенилпропионовой кислоты. Назовите продукт этой реакции. 16. Напишите реакцию взаимодействия аспарагиновой кислоты с HNO2. Назовите продукт этой реакции. 17. Назовите продукт и напишите схему реакции окислительного дезаминирования аланина, которое протекает in vivo. 18. Одной из качественных реакций на аминокислоту триптофан является ее реакция с реактивом Эрлиха (солянокислый 8
раствор 4-диметиламинобензальдегида в этаноле) с образованием красно-фиолетового продукта. Напишите уравнение протекающей реакции. 19. Для качественного определения аминокислот, содержащих ароматические ядра, используют реакцию Мульдера (ксантопротеиновая реакция). Напишите данную реакцию на примере аминокислоты тирозин и укажите, какие изменения при этом происходят. 20. Известно, что качественной реакцией на цистеин является реакция Фоля. Напишите уравнение этой реакции. Подходит ли эта реакция для обнаружения метионина? 21. Почему реакция α-аминокислот с нингидрином является общей качественной реакцией для этих соединений? Напишите уравнение протекающей реакции. 22. Какая из аминогрупп лизина будет взаимодействовать с фенилизотиоцианатом (C6H5NCS)? Напишите уравнение этой реакции. 23. Напишите уравнение взаимодействия N-ацетилметионина с этилхлорформиатом. Имеет ли эта реакция прикладное применение? 24. Дайте определение термину изоэлектрическая точка аминокислоты. Сравните значения рН водных растворов глицина, лизина и гистидина. 25. В качестве профилактики и лечения некоторых заболеваний печени врачи назначают аминокислоту метионин в виде различных пероральных лекарственных форм. В какой форме существует эта аминокислота в растворенном состоянии в различных биологических жидкостях (желудочном соке (рН 1,5–2,0) и слюне (рН 6,8–7,4))? Объясните полученные результаты. 26. Если изменить рН водного раствора аминокислоты до сильнощелочного значения, то она будет содержать две основные группы (–СОO– и –NH2). Сравните основность этих двух групп. У какой из них она будет выше? Какая из этих двух групп будет протонироваться первой при добавлении кислоты к этому раствору? 9
27. Можно ли с помощью лакмусовой бумаги (область перехода к красной окраске 5,0–8,0) различить водные растворы аспарагиновой кислоты и аспарагина? 28. Если к сильнокислому водному раствору α-аминокислоты, содержащей –СООН и –NH3+ группы, добавить раствор основания, то какая из этих двух групп будет депротонироваться легче? Ответ поясните на примере одной из аминокислот. 29. Напишите уравнение электролитической диссоциации следующих α-аминокислот, используя Приложение 2: А. Валин; Б. Лизин; В. Пролин; Г. Цистеин; Д. Тирозин; Е. Аспарагиновая кислота; Ж. Аргинин. 30. Электрофорез на бумаге является одним из методов разделения аминокислот в различных биохимических лабораториях. Укажите, какая из аминокислот: аргинин, серин, глицин, глутаминовая кислота, аланин и лизин – будет двигаться к катоду, аноду или оставаться на месте при рН 6,0 при использовании этого метода (Приложение 2)? 10