Стволовые клетки: биолого-физиологические закономерности развития, функции и механизмы
Покупка
Новинка
Год издания: 2023
Кол-во страниц: 212
Дополнительно
Вид издания:
Монография
Уровень образования:
ВО - Специалитет
ISBN: 978-5-8064-3240-8
Артикул: 822910.03.99
В монографии приведены основные биолого-физиологические закономерности развития, функции, механизмы и виды дифференцировки стволовых клеток, их способность к размножению и генерации потомства на уровне популяции. Дается краткое обоснование двух принципиально разных типов стволовых клеток: плюрипотентных, которые существуют только in vitro, и тканевых, существующих in vivo в послеродовом организме. Показано, что плюрипотентные клетки могут приводить к появлению широкого спектра типов клеток, в отличие от тканевых, которые в нормальных условиях не генерируют клетки, характерные для других типов тканей. Представлены этапы развития плюрипотентных стволовых клеток. Обсуждается роль ключевых маркеров плюрипотентности и факт того, что самым надежным способом идентификации стволовых клеток является определение их фенотипа in vivo. Это свидетельствует о том, что стволовые клетки не несут универсального молекулярного маркера, позволяющего дифференцировать стволовые клетки от нестволовых. Рассмотрены объекты и современные методы редактирования генома. Охарактеризована иммунная система прокариот и их защитные механизмы, препятствующие целевому редактированию генома в интересах исследователя. Описаны фазы развития эмбриона, начиная с формирования гамет и зародышевых линий, различия в отборе зародышевых и соматических клеток, рассматривается образование истинных зародышевых клеток, их типы, факторы, обеспечивающие их дифференцировку и миграцию. Представлены проб лемные и перспективные сведения по использованию стволовых клеток в трансплан тологии и другие не менее интересные вопросы, касающиеся стволовых клеток. Монография предназначена биологам, физиологам, врачам, научным работникам, будет полезна преподавателям, аспирантам и студентам биологических и медицинских факультетов университетов, академий и институтов, а также широкому кругу читателей.
Тематика:
ББК:
УДК:
ОКСО:
- ВО - Магистратура
- 06.04.01: Биология
- ВО - Специалитет
- 30.05.01: Медицинская биохимия
- 30.05.02: Медицинская биофизика
- 31.05.01: Лечебное дело
- 32.05.01: Медико-профилактическое дело
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов
РОССИЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ПЕДАГОГИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ им. А. И. ГЕРЦЕНА В. Я. Апчел, А. В. Москалёв, Е. А. Никитина СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ: БИОЛОГО-ФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ РАЗВИТИЯ, ФУНКЦИИ И МЕХАНИЗМЫ МОНОГРАФИЯ Санкт-Петербург Издательство РГПУ им. А. И. Герцена 2023
Печатается по решению редакционноиздательского совета РГПУ им. А. И. Герцена УДК 611-013.3:576.3 ББК 28.03 С78 Р е ц е н з е н т ы: Лопатина Екатерина Валентиновна, доктор биологических наук (Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И. П. Павлова); Сайфитдинова Алсу Фаритовна, доктор биологических наук (Российский государственный педагогический университет им. А. И. Герцена) С78 Стволовые клетки: биолого-физиологические закономерности развития, функции и механизмы : монография / В. Я. Апчел, А. В. Москалёв, Е. А. Никитина. — Санкт-Петербург : Изд-во РГПУ им. А. И. Герцена, 2023. — 212 с. ISBN 978-5-8064-3240-8 В монографии приведены основные биолого-физиологические закономерности развития, функции, механизмы и виды дифференцировки стволовых клеток, их способность к размножению и генерации потомства на уровне популяции. Дается краткое обоснование двух принципиально разных типов стволовых клеток: плюрипотентных, которые существуют только in vitro, и тканевых, существующих in vivo в послеродовом организме. Показано, что плюрипотентные клетки могут приводить к появлению широкого спектра типов клеток, в отличие от тканевых, которые в нормальных условиях не генерируют клетки, характерные для других типов тканей. Представлены этапы развития плюрипотентных стволовых клеток. Обсуждается роль ключевых маркеров плюрипотентности и факт того, что самым надежным способом идентификации стволовых клеток является определение их фенотипа in vivo. Это свидетельствует о том, что стволовые клетки не несут универсального молекулярного маркера, позволяющего дифференцировать стволовые клетки от нестволовых. Рассмотрены объекты и современные методы редактирования генома. Охарактеризована иммунная система прокариот и их защитные механизмы, препятствующие целевому редактированию генома в интересах исследователя. Описаны фазы развития эмбриона, начиная с формирования гамет и зародышевых линий, различия в отборе зародышевых и соматических клеток, рассматривается образование истинных зародышевых клеток, их типы, факторы, обеспечивающие их дифференцировку и миграцию. Представлены проб лемные и перспективные сведения по использованию стволовых клеток в трансплан тологии и другие не менее интересные вопросы, касающиеся стволовых клеток. Монография предназначена биологам, физиологам, врачам, научным работникам, будет полезна преподавателям, аспирантам и студентам биологических и медицинских факультетов университетов, академий и институтов, а также широкому кругу читателей. УДК 611-013.3:576.3 ББК 28.03 В оформлении обложки использована репродукция картины Сальвадора Дали «Аврора». © В. Я. Апчел, А. В. Москалёв, Е. А. Никитина, 2023 © О. В. Гирдова, оформление обложки, 2023 © Издательство РГПУ им. А. И. Герцена, 2023 ISBN 978-5-8064-3240-8
ОГЛАВЛЕНИЕ Введение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 Гл а в а 1. Стволовые клетки и их физиологические эффекты . . . . . . . . 8 1.1. Основные вехи истории исследования стволовых клеток . . . . . . 8 1.2. Классификация стволовых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.3. Размножение, созревание и дифференцировка стволовых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 1.4. Источники получения стволовых клеток и их пролиферативная активность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 1.5. Маркеры дифференцировки эмбриональных стволовых клеток и стволовых кроветворных клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 Гл а в а 2. Стволовые клетки, происхождение и маркировка . . . . . . . . . 29 2.1. Общие положения происхождения стволовых клеток и их маркировок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 2.2. Концепция ниши стволовых клеток и трансдифференцировки . . 35 2.3. Физиологические возможности стволовых клеток . . . . . . . . . . . 36 Гл а в а 3. Проблемы и перспективы использования стволовых клеток в трансплантологии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 3.1. Общие вопросы использования стволовых клеток в трансплантологии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 3.2. Пути поддержания жизнедеятельности клеток, микроорганизмов вне организма . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 3.3. Задачи тканевой биоинженерии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52 3.4. Отторжение трансплантатов и иммунологическая толерантность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Гл а в а 4. Трансдифференциация стволовых клеток до организма плода . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 4.1. Общие положения технологии получения тканей и органов для пересадки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 4.2. Фазы развития эмбриона млекопитающих . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64 4.3. Процеcс капацитации и последующие этапы оплодотворения . . 67 3
Гл а в а 5. Дифференцировка и варианты технологии получения плюрипотентных стволовых клеток. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76 5.1. Основные теоретические положения получения плюрипотентных стволовых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76 5.2. Перепрограммирование плюрипотентности соматических клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82 5.3. Эмбриональные стволовые клетки человека . . . . . . . . . . . . . . . . 87 Гл а в а 6. Этапы развития плюрипотентных стволовых клеток . . . . . . 93 6.1. Основные механизмы превращения плюрипотентных стволовых клеток в мышь . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93 6.2. Гены, сигнальные системы и факторы, контролирующие ранние периоды развития . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98 6.3. Формирование первичного плана тела и последующие этапы развития эмбриона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103 6.4. Поведение стволовых клеток в постнатальном периоде . . . . . . . 108 Гл а в а 7. Клеточные механизмы регуляции и защиты . . . . . . . . . . . . . 124 7.1. Интерференция РНК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 7.2. Молекулярные шапероны . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.3. Редактирование генома . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 7.3.1. Система ZFN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 7.3.2. Система TALEN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 7.3.3. СRISP-Cas-система — адаптированная иммунная система бактерий и архей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 7.3.4. Ключевые особенности ферментного белка Cas9 . . . . . . . 156 Гл а в а 8. Методы изучения генетических модификаций . . . . . . . . . . . 159 8.1. Изучение генетических модификаций с помощью трансгенных мышей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159 8.2. Линия клеток, карта развития клетки и клональный анализ . . . 165 8.3. Создание панелей изогенных плюрипотентных стволовых клеток человека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 Заключение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 182 Список сокращений . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184 Литература . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189
ВВЕДЕНИЕ В монографии в доступной и лаконичной форме изложены обобщенные данные, посвященные развитию, дифференцировке, функционированию и использованию стволовых клеток (СК). Представлена характеристика различных популяций СК. Рассмотрены физиологические особенности дифференцировки, дедифференцировки, трансдифференцировки, пластичности, а также факторы, способствующие их проявлению. Дана подробная сравнительная характеристика эмбриональных (ЭСК) и соматических стволовых клеток (ССК), наиболее важных с точки зрения практического применения. Показано, что ЭСК дифференцируются в три различных типа тканей: эндодерму, дающую начало внутренним органам; мезодерму, из которой развиваются соединительная, мышечная и костная ткани, а также формируется система кровообращения; эктодерму, из которой образуются кожа, органы чувств и нервные клетки. Из-за способности дифференцироваться в различные типы тканей ЭСК называют мультипотентными (Zabriskie, 2009). ССК также способны к дифференциации, однако более ограниченной, чем эмбриональные. ССК одного типа способны давать начало другим типам клеток. Это свойство делает возможным применение ССК для терапии и репарации больных и поврежденных тканей. Использование ССК ограничивает тот факт, что они труднее поддаются дифференциации и культивируются в лабораторных условиях хуже, чем ЭСК. Поскольку линии СК изолированы от внезародышевых тканей, их происхождение и развитие остаются не до конца раскрытыми. Тем не менее современные исследования подтвердили возможность получения клонов из ядер ранних бластомеров эмбрионов (Москалев и др., 2019; Zabriskie, 2009). Установлено, что одним из самых ярко выраженных признаков способности клетки к пролонгированной пролиферативной активности является величина клеточной теломеры, непосредственно 5
связанная с активностью фермента теломеразы. Чем активнее теломераза и длиннее теломера, тем к более длительной пролиферативной активности и к более длительному самоподдержанию способна данная клетка. Рассмотрены и охарактеризованы достоинства, недостатки и перспективы различных методов выделения и обогащения стволовых кроветворных клеток (СКК) из периферической крови, костного мозга и пуповинной крови новорожденных, являющейся наиболее перспективным источником получения СКК (Valina et al., 2007; Zabriskie, 2009). Описаны объекты и современные методы редактирования генома, иммунная система прокариот и их защитные механизмы, препятствующие целевому редактированию генома в интересах исследователя. Показано, что таким механизмом у прокариот являются кластерные регулятивные межпространственные короткие палиндромные повторы. Число таких повторов у различных объектов отличается, что в итоге не позволяет получить идеальную стандартную модель. Охарактеризованы белки, которые в настоящее время чаще всего используются для редактирования генома и выявления участков протоспейсерных соседних мотивов. Дана подробная характеристика организации иммунной системы прокариот и фаз ее активности. Кроме того, рассмотрены различные методы биотехнологических исследований, позволяющие оценить варианты внедрения новых генов в клетки и даже целые организмы, а также методы контроля их экспрессии во времени и пространстве, их активацию, дифференцировку и снижение функциональной активности, экспрессию нескольких целевых генов (Gilbert et al., 2013; McDonald et al., 2016; Sternberg et al., 2014; Zabriskie, 2009). Сравниваются варианты с мультицистронными векторами, кодирующими несколько белков, варианты внедрения генов с использованием плазмид, электропорации, их недостатки и преимущества. Важным аспектом биотехнологических методов являются способы контроля экспрессии трансгенов. Сегодня достаточно эффективным является управление экспрессией с помощью фактора, присутствующего в самом векторе доставки гена и активного только в определенном типе клеток (Sternberg et al., 2014). Для регулирования экспрессии трансгена используется эндонуклеаза бактериофага P1, которая разрезает дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) только на конкретных 6
участках. Данная система внедрена как в эукариотических, так и в прокариотических системах. Монография может служить кратким руководством для молекулярных и клеточных биологов, физиологов, генетиков, иммунологов, врачей общей практики, преподавателей, аспирантов и студентов биологических и медицинских факультетов университетов, академий и институтов, занимающихся исследованием и изучением различных популяций эмбриональных и соматических стволовых клеток, а также методов редактирования генома.
Гл а в а 1 СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ И ИХ ФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ 1.1. Основные вехи истории исследования стволовых клеток Интерес к стволовым клеткам проявился в начале XX в. Отрадно, что первым, кто предложил термин «стволовые клетки», был профессор Военно-медицинской академии — Александр Александрович Максимов. А. А. Максимов (04.02.1874 — 04.12.1928) — выдающийся русский ученый, один из создателей унитарной теории кроветворения. Александр Александрович родился в СанктПетербурге, где в 1896 г. с отличием окончил Военно-медицинскую академию. С 1903 по 1922 г. А. А. Максимов занимал пост профессора кафедры гистологии Военно-медицинской академии. Термин «стволовая клетка» А. А. Максимов предложил еще в 1908 г. в Берлине на съезде гематологов, где он выступил с новой теорией кроветворения для объяснения механизма быстрого самообновления крови. Именно этот год можно по праву считать началом истории развития исследований СК. А. А. Максимов первый пришел к выводу, что обновление клеток крови — это особая технология, отличная от простых клеточных делений. Если бы клетки крови самообновлялись простым клеточным делением, это потребовало бы гигантских размеров костного мозга (Москалев и др., 2020; Трактуев и др., 2006). Первые эксперименты по практическому использованию СК были начаты еще в начале 1950-х гг. Именно тогда было доказано, что с помощью трансплантации костного мозга (основного источника СК) можно спасти животных, получивших смертельную дозу радиоактивного облучения. Однако поистине огромный интерес к СК возник в конце XX — начале XXI в. Это представляется вполне оправданным, так как при целом ряде патологий, прежде всего 8
при гемобластозах, трансплантация СКК является не альтернативным способом лечения больного, а его единственной и реальной надеждой. СКК обладают двумя ключевыми характеристиками: одна — неопределенная способность к самообновлению в культуре, вторая — очень широкий потенциал дифференциации для генерации всех типов клеток. Следовательно, если можно эффективно вывести такие клетки и затем успешно провести им генную терапию для исправления всех основных мутаций, вызывающих заболевание, то полученные клетки, теоретически, могут служить неисчерпаемым источником здоровых СК. Впоследствии они могут быть направлены на дифференцировку в любой необходимый тип клеток, который в конечном итоге может служить для восстановления поврежденной или пораженной ткани (Владимирская и др., 2007; Трактуев и др., 2006; Jeon et al., 2006). Известно, что СКК являются уникальным банком биологической информации. СК могут копировать как построение органов и тканей (эмбриогенез), так и созревание специализированных линий соматических клеток (дифференцировка). В настоящее время под термином «стволовые клетки» понимают клетки тканей, обладающих как минимум способностью к длительному самоподдержанию и продукции дифференцированных клеток, образующих данную ткань (Ярилин, 2010; Dominici et al., 2006; Schaffl er, Buchler, 2007). Основные вехи истории исследования СК можно представить следующим образом. 1988 г. — СК были впервые использованы для трансплантации. 1992 г. — получена первая именная коллекция СК. Профессор Дэвид Харрис заморозил СК пуповинной крови своего первенца. Сегодня Дэвид Харрис — директор крупнейшего в мире банка стволовых клеток пуповинной крови. 1996 г. — начало трансплантации аутологичных СК (за период с 1996 по 2004 г. были выполнены 392 трансплантации аутологичных СК). 1997 г. — в 45 медицинских центрах мира проведено 143 трансплантации пуповинной крови. В России проведена первая операция онкологическому больному по пересадке СК из пуповинной крови младенцев. 1998 г. — первая в мире трансплантация СК пуповинной крови девочке с диагностированной нейробластомой. Общее число 9
проведенных трансплантаций пуповинной крови превышает 600. В этом же году американским ученым Д. Томсону и Д. Беккеру удалось выделить человеческие эмбриональные СК и получить их первые линии. Ученые нашли способ выращивать стволовые клетки в искусственной питательной среде. 1999 г. — журнал Science признал открытие эмбриональных СК (ЭСК) третьим по значимости событием в биологии после расшифровки двойной спирали ДНК и программы «Геном человека». 2000 г. — в мире проведено 1200 трансплантаций СК пуповинной крови, из них двести родственных. 2001 г. — опубликованы первые официальные данные о возможности применения трансплантации СК пуповинной крови у взрослых пациентов, из них более 90% с положительным результатом. В этом же году показана способность взрослых гемопоэтических и СК костного мозга человека дифференцироваться в кардиомиоциты и гладкомышечные клетки, эта способность используется в регенеративной кардиологии. 2003 г. — журнал Proceedings of the National Academy of Science USA опубликовал сообщение о том, что через 15 лет хранения в жидком азоте СК пуповинной крови полностью сохраняют свои биологические свойства. Мировая коллекция СК, хранящихся в банках, достигла 72 000 образцов. В мире произведено уже 2592 трансплантации СК пуповинной крови, из них 1012 — взрослым пациентам. 2004 г. — общая мировая коллекция СК пуповинной крови приближается к 400 000 образцов. В мире произведено около 5000 трансплантаций пуповинной крови. Для сравнения, число трансплантаций костного мозга за тот же период составило около 85 000. 2005 г. — перечень заболеваний, при лечении которых может быть успешно применена трансплантация СК, достигает нескольких десятков. Основное внимание уделяется лечению злокачественных новообразований, различных форм лейкозов и других болезней крови. Разработаны международные протоколы лечения рассеянного склероза. Проводятся многоцентровые исследования при лечении инфаркта миокарда и сердечной недостаточности. Разрабатываются подходы к лечению инсульта, болезни Паркинсона и Альцгеймера. В основе многих патологий лежат количественные изменения СК. Так, соотношение СК с другими клетками организма с возрастом 10