Генетика, 2024, № 6
научный журнал
Покупка
Новинка
Тематика:
Общая генетика. Общая цитология
Издательство:
Наука
Наименование: Генетика
Год издания: 2024
Кол-во страниц: 126
Дополнительно
Тематика:
ББК:
УДК:
ОКСО:
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов
Российская академия наук ГЕНЕТИКА Том 60 № 6 2024 Июнь Основан в апреле 1965 r. ISSN: 0016-6758 Ежемесячный журнал Журнал издается под руководством Отделения биологических наук РАН Главный редактор Н.К. Янковский Редакционная коллегия: А.П. Рысков (зам. главного редактора), С.К. Абилев (зам. главного редактора), С.А. Брускин (ответственный секретарь), А.М. Боронин, А.В. Васильев, В.А. Гвоздев, Е.К. Гинтер, Т.А. Ежова, И.А. Захаров-Гезехус, С.Г. Инге-Вечтомов, Н.А. Колчанов, А.М. Кудрявцев, Л.А. Лутова, А.С. Миронов, Н.С. Мюге, Д.В. Политов, В.П. Пузырев, А.Ю. Ржецкий (США), Н.Б. Рубцов, М.В. Холодова, Э.К. Хуснутдинова Редакционный совет: В.Г. Дебабов, А.В. Кильчевский (Беларусь), С.В. Костров, К. Крутовский (Германия), С.А. Лимборская, И.А. Тихонович, Д. Уотсон (США), С.В. Шестаков, В. К. Шумный Зав. редакцией Е.В. Тихомирова Адрес редакции: 119991, ГСП-1, Москва ул. Губкина, д. 3, тел.: 8-499-135-50-45 e-mail: genetika@vigg.ru Сайт журнала: http://www.vigg.ru/genetika/ Москва ФГБУ «Издательство «Наука» © Российская академия наук, 2024 © Редколлегия журнала «Генетика» (составитель), 2024
СОДЕРЖАНИЕ Том 60, номер 6, 2024 Обзорные и теоретические статьи Метилирование ДНК при аневризме аорты различной локализации А. Н. Кучер, С. А. Шипулина, И. А. Гончарова, М. С. Назаренко 3 Молекулярная генетика L31-транспозоны шестилучевых кораллов (Hexacorallia): распространение, разнообразие и эволюция Л. В. Пузакова, М. В. Пузаков, П. М. Пузакова 22 Генетика животных Динамика системы В-хромосом в популяции восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae (Mammalia, Rodentia) северного региона Прителецкой тайги Горного Алтая за 36-летний период И. А. Жигарев, Ю. М Борисов 31 Влияние хронического социального стресса на экспрессию генов, ассоциированных с нейротрансмиттерными системами в гипоталамусе самцов мышей И. Л. Коваленко, А. Г. Галямина, Д. А. Смагин, Н. Н. Кудрявцева 44 Генетическое разнообразие пяти пород крупного рогатого скота по SNP-маркерам, ассоциированным с состоянием здоровья М.В. Бытов, В.Д. Зубарева, С.В. Вольская, А.Г. Исаева, Д.Ю. Нохрин, Ю.А. Осипова, О.В. Соколова 55 Хромосомный полиморфизм малярийных комаров Карелии и расширение северных границ видовых ареалов А. В. Москаев, А. Г. Бега, В. И. Панов, В. П. Перевозкин, М. И. Гордеев 62 Генетическая диагностика предполагаемых гибридов волка и обыкновенного шакала П. А. Казимиров, Ю. С. Белоконь, М. М. Белоконь, А. С. Мишин, В. В. Стахеев, Ю. А. Яровенко, А. Ю. Яровенко, Д. В. Политов 72
Генетика человека Палеоазиатский субстрат в генофонде коряков по данным о полиморфизме аутосомных SNP и гаплогруппам Y-хромосомы В. Н. Харьков, Н. А. Колесников, А. А. Зарубин, Л. В. Валихова, И. Ю Хитринская, М. И. Воевода, М. А. Губина, А. Л. Сухомясова, В. А. Степанов 81 Генетико-антропологическое исследование погребения 93 Тольёнского могильника. Удмуртия, поломская археологическая культура Е. В. Веселовская, Ю. В. Рашковская, А. С. Демин, Х. Х. Мустафин, И. Э. Альборова 92 Ассоциированный с гипертрофической кардиомиопатией новый вариант со сдвигом рамки считывания в гене MYBPC3 определяет значительное снижение уровня транскрипта этого гена в миокарде И. С. Киселев, М. С. Козин, Н. М. Баулина, М. Б. Шарипова, А. С. Зотов, Е. А. Степанова, Э. В. Курилина, Г. Ж. Абдуллаева, Д. А. Затейщиков, О. О. Фаворова, О. С. Чумакова 106 Краткие сообщения Анализ эффективности CRISPR/CAS9-редактирования рибонуклеопротеидными комплексами гена GEX2 в протопластах кукурузы Е. М. Моисеева , В. В Фадеев, Ю. В. Фадеева, Ю. С. Гусев, М. И. Чумаков 117
ГЕНЕТИКА, 2024, том 60, № 6, с. 3–21 ОБЗОРНЫЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ СТАТЬИ УДК 577.21:616.132-007.64 МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК ПРИ АНЕВРИЗМЕ АОРТЫ РАЗЛИЧНОЙ ЛОКАЛИЗАЦИИ © 2024 г. А. Н. Кучер1, С. А. Шипулина1, И. А. Гончарова1, М. С. Назаренко1, * 1Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск 634050 Россия *e-mail: maria.nazarenko@medgenetics.ru Поступила в редакцию 30.11.2023 г. После доработки 28.12.2023 г. Принята к публикации 25.01.2023 г. Аневризма аорты (АА) – жизнеугрожающее патологическое состояние, осложнение которого в виде разрыва аорты в отсутствие экстренного хирургического вмешательства приводит к летальному исходу. В развитие АА вносят вклад генетические (чаще при торакальной АА – ТАА) и средовые (при ТАА и абдоминальной АА – ААА) факторы. В настоящем обзоре обобщены данные научных публикаций, посвященных изучению метилирования ДНК при воздействии факторов риска АА, а также в клетках различных отделов аорты (грудной, брюшной) в норме и при патологических состояниях. Изменение метилирования ДНК наблюдается в клетках аорты и/или крови при наличии факторов риска АА (артериальная гипертензия, курение, возраст, наличие сопутствующих заболеваний). Исследования метилирования ДНК при ТАА и ААА немногочисленны, проводились с использованием различных подходов к формированию выборок, выбору образцов клеток и экспериментальных методов. Однако они убедительно свидетельствуют об измененном статусе метилирования ДНК генов, выбранных для исследования с использованием кандидатного подхода (при исследовании ААА), а также различных регионов генома при проведении широкогеномного анализа метилирования ДНК (преимущественно при исследовании ТАА). Гены, локализованные в дифференциально-метилированных регионах, связаны с функционированием сердечно-сосудистой системы, вовлечены в клеточные и метаболические процессы, патогенетически значимые для развития АА. В ряде случаев установлена связь уровней метилирования ДНК с клиническими параметрами при АА. Эти результаты указывают на перспективность расширения исследований метилирования ДНК при АА, в том числе и с целью выявления новых патогенетически значимых звеньев при развитии АА. Ключевые слова: аневризма аорты, грудная аорта, брюшная аорта, метилирование ДНК, эпигенетика, эпигенетические модификации. DOI: 10.31857/S0016675824060018 EDN: BYFOJE Аневризма аорты (АА) – жизнеугрожающая патология, при которой могут поражаться различные сегменты аорты [1–3]. По локализации выделяют аневризму грудной (торакальная АА – ТАА), брюшной (абдоминальная АА – ААА) аорты и аневризму смешанного типа, когда патологический процесс затрагивает и грудной, и брюшной отделы аорты (торокаабдоминальная АА – TAAA) [4]. Согласно данным мета-анализа популяционных исследований, во всем мире совокупная частота и распространенность ТАА составляют 5.3 на 100 000 человек в год (95% CI: 3.0; 8.3) и 0.16% (95% CI: 0.12; 0.20) соответственно [2]. По данным скрининговых исследований частота выявления ААА в разных популяциях варьирует от 3.3 до 7.7% у лиц в возрастной когорте 64–83 года [5]. АА могут длительное время формироваться бессимптомно до разрыва аорты, при котором смертность достигает 80–90% [2, 6]. В развитие АА вносят вклад как генетические, так и средовые факторы, в том числе и факторы внутренней среды, формирующиеся при развитии патологических состояний (инфекционных заболеваний, болезней сердечно-сосудистой системы) [4, 7, 8]. Генетические причины выявляют в 20–30% случаев развития ТАА и в настоящее время молекулярно-генетическое обследование рекомендовано для формирования групп риска и оптимизации тактики ведения пациентов, а также каскадного скрининга членов их семей [4, 9]. 3
КУЧЕР и др. МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК И ФАКТОРЫ РИСКА РАЗВИТИЯ АНЕВРИЗМЫ АОРТЫ У пациентов с ААА также выявляют патогенные варианты, характерные для ТАА [10], несмотря на то, что генетические факторы не рассматриваются в качестве основных факторов риска развития аневризмы брюшной аорты [4, 11]. В отличие от генетических факторов, которые информативны для оценки риска развития заболевания, прогноза характера его течения и определения тактики ведения пациентов в зависимости от их генетических особенностей [11], эпигенетические модификации, с одной стороны, могут являться маркерами развития патологии и/или стадии патологического процесса, а с другой, – будучи в ряде случаев обратимыми рассматриваются в качестве перспективных молекулярных маркеров для терапевтического воздействия [12–16]. То, что эпигенетические события могут быть вовлечены в патогенез АА подтверждают клинические и экспериментальные наблюдения [15, 17]. У пациентов с АА также регистрируют различные эпигенетические изменения (на уровне метилирования ДНК, модификации гистонов, ремоделирования хроматина, а также экспрессии различных регуляторных РНК), в том числе и при генетически обусловленных аортопатиях [12, 13, 18–25]. Выявление молекулярно-клеточных механизмов, включая эпигенетические события, в сложном патогенезе АА приобретает все большее значение, в том числе и с целью поиска новых фармакологических возможностей блокады ключевых путей патогенеза данного заболевания [8, 26, 27]. Метилирование ДНК – один из основных механизмов эпигенетических модификаций генома, в отношении которого на сегодняшний день собрано существенное количество информации. Тем не менее из-за немногочисленности тематических исследований, а также высокой гетерогенности выборок и различий в используемой методологии анализ результатов этих исследований является нетривиальной задачей. В связи с этим цель настоящего обзора заключалась в обобщении данных исследования метилирования ДНК при аневризме аорты различной локализации. Поиск научных публикаций проводился в отечественной (Научная электронная библиотека – eLIBRARY.RU) и зарубежной (PubMed) электронных библиотеках. Для поиска публикаций использовали следующие слова (и их сочетания): аневризма аорты, аневризма грудной аорты, аневризма брюшной аорты, факторы риска, распространенность/эпидемиология, метилирование ДНК, эпигенетика, эпигенетические модификации (aneurysm, thoracic aortic aneurysm, abdominal aortic aneurysm, risk factors, prevalence/ epidemiology, DNA methylation, epigenetics, epigenetic modifications). ТАА и ААА различаются по ключевым факторам риска и основным клеточным механизмам [4, 27, 28], несмотря на некоторую схожесть патологического процесса (характерны прогрессирующая дилатация стенки сосуда, чему способствуют апоптоз гладкомышечных клеток (ГМК) сосудов (ГМКС) и ограниченная пролиферация, а также нарушение синтеза и деградации компонентов внеклеточного матрикса, в том числе и вследствие воспаления, разрушающе действующего на стенку сосуда) [28]. Актуальность рассмотрения факторов риска АА в связи с целью заявленного обзора обусловлена тем, что многие как внешне-средовые воздействия (курение, прием лекарственных препаратов, особенности диеты и др.), так и изменения вследствие происходящих в организме физиологических и патологических процессов (старение, воспалительный процесс, атеросклероз, физическая активность и др.) могут сопровождаться эпигенетическими модификациями, в том числе и на уровне метилирования ДНК. Уровень метилирования ДНК изменяется в различных тканях при артериальной гипертензии, атеросклерозе (противоречивые данные о значении данной патологии в детерминации риска развития АА), сахарном диабете (рассматривается как протективный фактор развития АА), дислипидемиях, воспалении, с возрастом, у курящих и т.д. [29–38]. Так, показано, что общий уровень метилирования ДНК снижен в клетках крови у пациентов с артериальной гипертензией, являющейся важным фактором риска развития АА, по сравнению со здоровыми индивидами [39]. Более того, однонуклеотидные варианты (SNP), ассоциированные с уровнем артериального давления, располагаются в регионах, обогащенных CpG-сайтами, в том числе рядом с генами, являющимися важными для работы гладкомышечных клеток сосудов (IGFBP3, KCNK3, PDE3A, PRDM6), и в генах, связанных с функцией почек (ARHGAP24, OSR1, SLC22A7, TBX2) [40]. Измененный статус метилирования ДНК в клетках крови и сосудов (в том числе аорты) зарегистрирован у пациентов с атеросклерозом [32, 34], причем уровень метилирования ДНК при атеросклерозе коррелирует с патогенетическими процессами [41]. Рассматривают разные механизмы, посредством которых запускается патогенез при атеросклерозе, среди которых есть значимые для развития АА, такие как воспаление, эндотелиальная дисфункция, пролиферация гладкомышечных клеток сосудов и др. [41]. Действительно, установлено, что модификация метилирования ДНК контролирует функцию ГМКС, регулируя экспрессию генов, участвующих в атерогенезе [42]. Среди чувствительных к статусу метилирования ДНК ГЕНЕТИКА том 60 № 6 2024
МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК ПРИ АНЕВРИЗМЕ АОРТЫ 5 Таким образом, связь метилирования ДНК с факторами риска развития АА, а также измененный уровень экспрессии генов, продукты которых вовлечены в процесс метилирования ДНК, указывают на потенциальную значимость данной эпигенетической модификации в развитии патологии. МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК ПРИ АНЕВРИЗМЕ ГРУДНОЙ И АБДОМИНАЛЬНОЙ АОРТЫ функций ГМКС – переключение с сократительного на синтетический фенотип, дифференцировка, пролиферация и миграция, т.е. те процессы, которые выступают в качестве критических и при развитии АА [4, 27, 28, 43]. В атеросклеротически пораженных артериях по сравнению с непораженными сосудами зарегистрировано изменение уровня метилирования CpG-сайтов генов микроРНК [32], среди которых и микроРНК, вовлеченные в различные этапы атерогенеза [44]. С возрастом, который рассматривается в качестве риска развития АА, регистрируют изменения, с одной стороны, статуса метилирования ДНК [45], а с другой, – функционального состояния ГМКС [46]. Показано, что у лиц с нормальным (трехстворчатым) аортальным клапаном возраст сам по себе способен негативно влиять на гладкомышечные клетки в стенке восходящей аорты, в результате чего ГМКС с возрастом переключаются с сократительного фенотипа на дезадаптивные синтетические или стареющие состояния [46]. Такие функциональные изменения могут выступать в качестве одного из факторов, способствующих развитию АА при других неблагоприятных условиях. Внешнесредовые факторы риска развития АА также связаны с изменением метилирования ДНК. Курение оказывает существенное влияние на уровень метилирования ДНК [44, 47, 48]. Например, регулярное курение способствует повышению метилирования ДНК клеток крови в области промоторного региона гена NOS1AP, причем более высокое метилирование данного региона также наблюдали у пациентов с внутричерепной аневризмой по сравнению с группой лиц с артериовенозной мальформацией сосудов (АМС) головного мозга [47]. Кроме того, гендерные различия по уровню метилирования данного гена установлены в контрольной группе (у мужчин выше, чем у женщин) и в группе пациентов с АМС головного мозга (у женщин выше, чем у мужчин) [47]. При этом мужской пол рассматривается в качестве фактора риска развития ААА [4], а мужчины и женщины различаются по частоте регистрации синхронной и метахронной ТАА у пациентов с ААА [2]. Обобщению результатов исследований, посвященных изучению эпигенетических модификаций, сопровождающих различные факторы риска (артериальная гипертензия, курение, возраст), этапы и метаболические пути, значимые для патогенеза АА (воспаление, гомоцистеинемия, поляризация моноцитов/макрофагов, протеолиз), посвящен ряд обзоров [18, 49, 50]. Кроме того, выявлена вовлеченность ферментов, участвующих в эпигенетических процессах (в том числе и на молекулярном уровне), в патогенетически значимые в отношении АА события [25, 51, 52]. Публикации, посвященные анализу метилирования ДНК при развитии АА, немногочисленны (табл. 1), особенно с учетом полиэтиологичности и высокой клинической гетерогенности данных аортопатий. Всего в доступной литературе обнаружено семь исследований, посвященных изучению метилирования ДНК при ТАА [33, 53–58] и восемь работ – при ААА [20, 21, 59–64]. Исследования метилирования ДНК при ТАА проводились в образцах цельной ткани аорты или в эндотелиальных и гладкомышечных клетках аорты (при проведении исследований по оценке влияния in vitro колебательного и ламинарного потоков на статус метилирования ДНК), в срезах правого предсердия и в одном исследовании оценивался статус метилирования внеклеточной ДНК в плазме крови (табл. 1). При ААА, напротив, преобладали исследования по оценке статуса метилирования ДНК в клетках крови, и лишь в трех сообщениях приводятся данные по уровню метилирования ДНК в тканях/клетках брюшной аорты. В целом, несмотря на меньшее число исследований, изученные выборки пациентов с ТАА оказались более гетерогенными по клиническим показателям, чем таковые с ААА. Анализируемые выборки различались по половозрастному составу, статусу курения, наличию сопутствующих патологий (включая двухстворчатый аортальный клапан), что могло сказаться на оценках метилирования ДНК, но это не всегда и не по всем параметрам принималось во внимание при описании полученных данных. Гетерогенность в критериях формирования выборок, разные подходы к выбору тканей для анализа, клеточная гетерогенность образцов тканей, а также отличия по использованным экспериментальным методам оценки уровня метилирования ДНК (от изучения отдельных генов до полногеномного анализа) и подходам к обработке данных (табл. 1), делают проблематичным прямое сопоставление результатов разных исследований. В то же время на основании анализа публикаций можно сделать некоторые заключения. Прежде всего следует отметить, что при развитии АА вне зависимости от ее локализации происходит изменение метилирования ДНК на уровне отдельных CpG-сайтов (и не-CpG-сайтов), отдельных генов и регионов генома (табл. 1). Статус метилирования ДНК различен между образцами ГЕНЕТИКА том 60 № 6 2024
КУЧЕР и др. Между ДАК-Р и ТАК-Р метилирование различалось по 39 984 CpG-сайтам; при ТАК-Р чаще регистрировали гипер-М CpG; в аорте ДАК-Р средний уровень метилирования ниже, гипо-М ДМР в ДАК-Р связаны с 3 052 генами Между ДАК-НР и ТАК-НР не выявлено отдельных ДМ CpG-сайтов (ДМС), но зарегистрирован 681 геномный кластер ДМС (ДМР), относящихся к 894 генам. Для 540 ДМГ различия метилирования наблюдались в пределах ± 10%, из них в ДАК-НР 154 генов были гипер-М, а 398 гипо-М Степень гипо-М выше в аорте ДАК-Р, чем в аорте TAК-Р (в т.ч. и для транскрипционно-значимых CpG-сайтов внутри CpG-островков в пределах первых экзонов). Всего между ДАК-Р и ТАК-Р зарегистрировано 3 170 ДМР, содержащих 12 234 CpG-сайта и охватывающих 2 638 генов. В ДАК-Р метилирование 8 355 (68%) CpG-сайтов снижено Illumina 450K ДМ установлено для 27 СpG-сайтов в 9 генах; наибольшие различия по уровню метилирования выявлены для гена PTPN22 (гипер-М); ген ACTA2 также был ДМ. Illumina 450K АНЕВРИЗМА ГРУДНОЙ АОРТЫ Ткани аневризмы восходящей аорты Образцы интима-медиа восходящей аорты Образцы интима-медиа восходящей аорты Образцы интима-медиа восходящей аорты и правой внутренней грудной артерии Основная группа // контрольная группа Ткань / клетки Метод Основные заключения Пациенты с ДАК // пациенты с ТАК [53] Пациенты с ДАК-Р ( ДА >45 мм) (n = 14; 61 год; 11 муж., 3 жен.) // пациенты с ТАК-Р (ДА > 45 мм) (n = 13; 63 года; 7 муж., 6 жен.)* {A} [56] Пациенты с ДАК-НР (ДА < 40 мм) (n = 7; 60 лет; 4 муж., 3 жен.) // пациенты с ТАК-НР (ДА < 40 мм) (n = 10; 72 года, 6 муж., 4 жен.)* {A} [56] Таблица 1. Уровень метилирования ДНК в клетках аорты и крови у пациентов с аневризмой аорты различной локализации, а также в клетках аорты у модельных животных ГЕНЕТИКА том 60 № 6 2024
МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК ПРИ АНЕВРИЗМЕ АОРТЫ 7 15 из 200 наиболее ДМР локализованы в кластерах Hox-генов, включая кластер HOXA (на хромосоме 7), кластер HOXB (на хромосоме 17), кластер HOXC (на хромосоме 12) и кластер HOXD Между пациентами с РГА и здоровыми индивидами идентифицировано 51 468 ДМР (22 318 гипер-М и 29 150 гипо-М в РГА, из них 3 314 (6.44%) расположены в промоторных областях (от 1 до 2 500 пн выше сайта начала транскрипции). 300 ДМР (включали 14 365 CpG со средней длиной 1 648 пн; большинство расположены в межгенных областях, медиана расстояния до ближайшего гена – 58 305 п.н.) дифференцируют группу РГА от здоровых индивидов 3 982 ДМР вкДНК (8.8%) перекрываются с ДМР, идентифицированными в ткани аорты (tДМР); 2 326 ДМР вкДНК (12 856 ДМ сайтов) имели тот же паттерн метилирования, что и tДМР; из них 34 ДМР общие с 300 ДМР в tДМР Полногеномное бисульфитное секвенирование (WGBS) АНЕВРИЗМА ГРУДНОЙ АОРТЫ Плазма крови Образцы интима-медиа восходящей аорты Основная группа // контрольная группа Ткань / клетки Метод Основные заключения Пациенты с РГА (тип А), без семейной отягощенности (ДА = 52/57 мм) (n = 6; 41.8 лет; 5 муж., 1 жен.) {B} // здоровые индивиды (n = 4; 36.5 лет; 3 муж., 1 жен.) [33] Пациенты с РГА (тип А), без семейной отягощенности (ДА = 52/57 мм) (n = 6; 45.3 лет; 5 муж., 1 жен.) {B}// здоровые индивиды (n = 6; 42.8 лет; 6 муж.) [33] Пациенты с РГА (тип А) без семейной отягощенности (ДА = 52/57 мм) (n = 7; 51 год; 6 муж., 1 жен.) {B} //здоровые индивиды (n = 4; 49.3 лет; 3 муж., 1 жен.) [33] Таблица 1 (продолжение) ГЕНЕТИКА том 60 № 6 2024
КУЧЕР и др. Профили метилирования ДНК РГА больше отклоняются от профилей метилирования AoSMC (ENCODE), чем профили метилирования контрольной группы. Профили метилирования ДНК ДАК не отличаются значимо от метилирования ДНК AoSMC При остром разрыве аорты изменяется метилирование ДНК в сайтах, отличных от CpG. Между РГА и контрольной выборкой выявлено 706 ДМ цитозинов (ДМЦ) (396 или 56% гипер-М при РА), между ДАК и контрольной выборкой – 3 775 ДМЦ (1 979 или 52% гипер-М при ДАК); между ДАК и РГА – 12 817 ДМЦ (75% гипер-М при ДАК) Illumina 450K АНЕВРИЗМА ГРУДНОЙ АОРТЫ AoSMC (ENCODE) Ткани восходящей аорты Ткани восходящей аорты Illumina 450K Обнаружено 589 ДМС (315 гипо-М и 274 гипер-М) Основная группа // контрольная группа Ткань / клетки Метод Основные заключения Пациенты с острым РГА (n = 10 муж., 52.4 лет) //; здоровые доноры органов (n = 6 муж.; 36.7 лет) [55] Пациенты с острым РГА (n = 4 муж.; 49,1 лет) {B}// здоровые доноры органов (n = 4 муж.; 47,92 лет) {B} [58] Пациенты с ДАК, связанным с аневризматической дилатацией (ДА > 45 мм) (n = 5 муж.; 53.8 лет) * {БСО} // здоровые доноры органов (n = 6 муж.; 36.7 лет)* {БСО} [55] Таблица 1 (продолжение) ГЕНЕТИКА том 60 № 6 2024
МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК ПРИ АНЕВРИЗМЕ АОРТЫ 9 Уровень метилирования в среднем и для 13-ти из 16-ти изученных CpG в регионе промотора гена SCN5A ниже в срезах миокарда с вариантом H558R+, чем в срезах H558R- (0.7% vs. 1.6%) При воздействии колебательного потока изменялось метилирование 4 707 генов в ЭКА ДАК-Р и 5 999 генов в ЭКА ТАК-Р Ламинарный и колебательный потоки по-разному влияли на метилирование ДНК в клетках EA.hy926. При колебательном потоке зарегистрировано 1 644 гипер-М и 169 гипо-М региона. Профиль ДМ ДНК в аорте ДАК-НР в большей степени схож с профилем метилирования колебательного (207, или 23% общих ДМГ), чем ламинарного (163 или 18% общих ДМГ) потока Illumina 450K Таргетное бисульфитное секвенирование АНЕВРИЗМА ГРУДНОЙ АОРТЫ Срезы правого предсердия Первичные эндотелиальные клетки аорты (ЭКА) из большой кривизны аневризмы грудной аорты Эндотелиальные клетки человека (EA.hy926) Основная группа // контрольная группа Ткань / клетки Метод Основные заключения Пациенты с синдромом Бругада (n = 30; 67 лет; 17 муж., 13 жен.) с разными генотипами по H558R гена SCN5A [54] Пациенты с ДАК и расширенной (ДА > 45 мм) аортой (ДАК-Р; n = 14; 61 год; 11 муж., 3 жен.) {A} // пациенты с ТАК и расширенной (ДА > 45 мм) аортой (ТАК-Р; n = 13; 63 года; 7 муж., 6 жен.) * {A} [56] Воздействие колебательного (двунаправленного, 12 дин/см2) или ламинарного (12 дин/см2) потока на эндотелиальные клетки EA.hy926 (n = 9) [56] Таблица 1 (продолжение) ГЕНЕТИКА том 60 № 6 2024