Вестник Российской академии наук, 2024, № 1

ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ 
АКАДЕМИИ НАУК
научный и общественно-политический журнал
том 94   № 1   2024   Январь
Основан в 1931 г. 
Выходит 12 раз в год 
ISSN: 0869-5873
Журнал издаётся под руководством 
Президиума РАН
Главный редактор
В.Я. Панченко
РЕДАКЦИОННАЯ КОЛЛЕГИЯ
А.В. Адрианов, В.П. Анаников, А.Л. Асеев, А.Р. Бахтизин, 
С.И. Безродных, В.В. Бражкин, Ф.Г. Войтоловский,
 А.В. Гавриленко, А.Д. Гвишиани, Ю.Г. Горбунова,
В.И. Данилов-Данильян, Л.М. Зелёный, Н.А. Зиновьева, 
Н.И. Иванова, В.С. Комлев, С.Н. Кочетков, С.В. Кривовичев, 
А.П. Кулешов, Ю.Ф. Лачуга, Я.П. Лобачевский, А.В. Лопатин, 
Г.Г. Матишов, А.М. Молдован, О.С. Нарайкин, В.В. Наумкин,
С.А. Недоспасов, А.Д. Некипелов, Р.И. Нигматулин, 
Н.Э. Нифантьев, М.А. Островский, В.В. Полонский,
И.В. Решетов, Г.Н. Рыкованов, А.В. Сиренов, В.А. Сойфер, 
О.Н. Соломина, Г.Т. Сухих, И.А. Тайманов, В.А. Тишков, 
В.А. Ткачук, А.В. Торкунов, И.В. Тункина, М.А. Федонкин, 
Т.Я. Хабриева, В.Ю. Хомич, В.И. Цетлин, В.А. Черешнев,
М.Ф. Черныш, В.П. Чехонин, А.П. Шкуринов, И.А. Щербаков, 
А.В. Юревич
Заместитель главного редактора
Г.А. Заикина
Заведующая редакцией
О.Н. Смола
E-mail: vestnik.ran@yandex.ru, vestnik@pleiadesonline.com
Москва
ФГБУ «Издательство «Наука»
© Российская академия наук, 2024
© Редколлегия журнала
     “Вестник РАН” (составитель), 2024

СОДЕРЖАНИЕ
Том 94, номер 1, 2024
С кафедры президиума РАН
М. А. Пирадов
Вступительное слово
3
В. Г. Акимкин
Национальная система микробиологического мониторинга микроорганизмов, устойчивых 
к противомикробным препаратам
4
Р. С. Козлов, А. Ю. Кузьменков, А. Г. Виноградова
Антибиотикорезистентность как медицинская проблема
11
А. М. Гулюкин, А. В. Капустин, А. В. Мищенко
Антибиотикорезистентность как фактор, препятствующий борьбе с инфекционными 
заболеваниями животных
19
С. В. Шабунин, Г. А. Востроилова, Д. И. Шабанов, И. Ю. Буракова,  
Ю. Д. Смирнова, М. В. Грязнова, М. Ю. Сыромятников
Гены антибиотикорезистентности у возбудителей болезней открытых полостей
25
Организация исследовательской деятельности
Д. В. Косяков, И. В. Селиванова, А. Е. Гуськов
Два контура оценки результативности научных организаций в России: текущее состояние 
и перспективы развития с точки зрения международного опыта
32
Проблемы экологии
К. Н. Кулик, А. И. Беляев, А. М. Пугачёва, А. А. Зыкова
Глобальные проекты агролесомелиорации и их реализация
55
Обозрение
В. И. Чернов
Инновационные радиофармпрепараты в диагностике и радионуклидной терапии  
злокачественных новообразований
66
Из рабочей тетради исследователя
Ю. С. Мардынский, И. А. Гулидов, К. Б. Гордон, С. Н. Корякин, А. Н. Соловьёв, В. О. Сабуров, 
С. А. Иванов, А. Д. Каприн, Т. К. Лобжанидзе, Н. В. Марков, И. М. Железнов, Д. И. Юрков, 
О. А. Герасимчук, А. Ю. Пресняков, В. И. Зверев, В. П. Смирнов
Дистанционная нейтронная терапия: первый отечественный медицинский комплекс
80

CONTENTS
Vol. 94, No. 1, 2024
From the Rostrum of the RAS Presidium
M. A. Piradov
Introduction
3
V. G. Akimkin
National system for microbiological monitoring of microorganisms resistant to antimicrobial drugs
4
R. S. Kozlov, A. Yu. Kuzmenkov, A. G. Vinogradova
Antibiotic resistance as a medical problem
11
A. M. Gulyukin, A. V. Kapustin, A. V. Mishchenko
Antibiotic resistance as a factor, hindering the fight against infectious animal diseases
19
S. V. Shabunin, G. A. Vostroilova, D. I. Shabanov, I. Yu. Burakova,  
Yu. D. Smirnova, M. V. Gryaznova, M. Yu. Syromyatnikov
Antibiotic resistance genes in pathogens of open cavities
25
Organisation of research activity
D. V. Kosyakov, I. V. Selivanova, A. E. Guskov
Two circuit assessments of the performance of scientific organizations in Russia: current state  
and development prospects from the point of view of international experience
32
Problems of Ecology
K. N. Kulik, A. I. Belyaev, A. M. Pugacheva, A. A. Zykova
Global agroforestry projects and their implementation
55
Review
V. I. Chernov
Innovative radiopharmaceuticals in cancer diagnostics and radionuclide therapy
66
From the Researcher’s Notebook
Yu. S. Mardynsky, I. A. Gulidov, K. B. Gordon, S. N. Koryakin, A. N. Solovyov, V. O. Saburov, S. A. Ivanov, 
A. D. Kaprin, T. K. Lobzhanidze, N. V. Markov, I. M. Zhelezhnov, D. I. Yurkov, O. A. Gerasimchuk, 
A. Yu. Presnyakov, V. I. Zverev, V. P. Smirnov
Remote neutron therapy: the first domestic medical complex
80 

ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК,  2024, том 94, № 1,  с.  3–3
С КАФЕДРЫ ПРЕЗИДИУМА РАН
DOI: 10.31857/S0869587324010011, EDN: HBKXJF
ВСТУПИТЕЛЬНОЕ СЛОВО
была признана одной из 10 главных глобальных 
угроз человечеству. Сегодня рост антибиотикорезистентности идёт на фоне постоянно растущего 
потребления этих препаратов. В 2019 г. вследствие 
развившейся устойчивости к антибиотикам в мире 
умерло около 5 млн человек, причём при сохранении темпов роста антибиотикорезистетности только материнская смертность от бактериальных инфекций может увеличиться в 50 раз. По прогнозам 
экспертов, уже через 25 лет смертность вследствие 
антибиотикорезистентности превысит смертность 
от онкологических заболеваний.
В настоящее время наблюдается сокращение времени развития устойчивости к новым антибиотикам 
при одновременном уменьшении количества новых 
их типов, а также падение числа ранее эффективных антибиотиков, используемых при различных 
заболеваниях. Многие крупные фармацевтические 
компании перестают разрабатывать эти препараты 
из-за высокой их стоимости и длительного времени 
возврата затраченных средств. По данным ВОЗ, уже 
через 10–15 лет человечество столкнётся с проблемой полной резистентности к антибиотикам.
Что учёные и практики могут предложить людям в складывающихся условиях? Прежде всего 
это создание гибридных препаратов — ​
антибиотиков с ингибиторами бактериальных ферментов, 
участвующих в биосинтезе клеточной стенки бактерий, поиск антибактериальных соединений с новыми механизмами действия, разработка новых 
вакцин против наиболее опасных возбудителей 
инфекционных болезней, создание препаратов на 
основе бактериофагов и адьювантов (соединения, 
используемые для усиления иммунного ответа).
В нашей стране проблеме антибиотикорезистентности уделяется пристальное внимание на всех 
уровнях государственного управления. Этот вопрос 
нашёл отражение и  в  Указе Президента России 
№ 254 от 06.06.2019, и в федеральном законе № 492 
от 30.12.2020, и в распоряжениях Правительства РФ, 
и в работе профильных министерств и ведомств. 
Полагаю, что нынешнее заседание Президиума 
РАН станет важным импульсом к проведению совместных исследований антибиотикорезистентности специалистами медицинского, сельскохозяйственного, биологического, химического, математического и других отделений нашей академии.
М.А. ПИРАДОВ, академик РАН, 
 
вице-президент РАН
3 октября 2023 г. заседание Президиума РАН 
было посвящено антибиотикорезистентности как 
одной из глобальных проблем цивилизации, которая представляет реальную угрозу для человечества. 
В прозвучавших докладах вопрос об устойчивости 
к антибиотикам обсуждался в контексте здравоохранения и сельского хозяйства, но совершенно 
очевидно, что всеобъемлющее решение этой проблемы предполагает самое активное участие биологов, химиков и специалистов целого ряда других 
научных дисциплин.
Прежде всего следует вспомнить, как всё начиналось. В 1928 г. британский микробиолог А. Флеминг открыл Penicillium notatum, спустя десять лет 
Э. Чейн выделил чистый пенициллин. Первое клиническое применение пенициллина произошло 
в 1941 г., а в 1945 г. А. Флеминг, Э. Чейн и Г. Флори получили Нобелевскую премию по физиологии 
и медицине “за открытие пенициллина и его целебного воздействия при различных инфекционных заболеваниях”. В нашей стране первые клинические 
испытания отечественного пенициллина, честь создания которого принадлежит З.В. Ермольевой и её 
коллегам, были проведены в 1943 г. С 1944 г. началось его промышленное производство в СССР, 
что позволило сократить смертность наших солдат 
и офицеров от ран и инфекций почти на 80%.
Внедрение антибиотиков в клиническую медицину продлило среднюю продолжительность жизни людей начиная со второй половины ХХ в. более 
чем на 20 лет. Только благодаря антибиотикам стали возможны лечение рака, развитие трансплантологии, операций на открытом сердце, снижение 
детской и материнской смертности и т.п. Применение этих препаратов в сельском хозяйстве обеспечило потребности человечества в пищевом белке.
Однако широкое, часто неконтролируемое применение антибиотиков населением привело к снижению иммунитета, резкому повышению аллергических реакций, развитию антибиотикорезистентности. Резистентность к  пенициллину в  1950 г. 
выявлялась у примерно 60% заболевших, а спустя 
40 лет — ​
уже у более чем 90%. Следует отметить, 
что так называемая золотая эра антибиотиков, когда открывались всё новые их классы и виды, продолжалась с 1945 по 1970-е годы, последний новый 
их класс был открыт почти 40 лет назад.
В докладе Всемирной организации здравоохранения за 2019 г. антибиотикорезистентность 
3

ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК,  2024, том 94, № 1,  с.  4–10
С КАФЕДРЫ ПРЕЗИДИУМА РАН
НАЦИОНАЛЬНАЯ СИСТЕМА МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО 
МОНИТОРИНГА МИКРООРГАНИЗМОВ, УСТОЙЧИВЫХ 
К  ПРОТИВОМИКРОБНЫМ ПРЕПАРАТАМ
© 2024 г.    В. Г. Акимкинa,*
aЦентральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия
*E-mail: vgakimkin@yandex.ru
Поступила в редакцию 25.11.2023 г.
После доработки 30.12.2023 г.
Принята к публикации 07.12.2023 г.
Устойчивость патогенов к противомикробным препаратам – ​
глобальная проблема, с которой связаны 
миллионы дополнительных смертей в год. Помимо рисков для здоровья людей, животных и окружающей среды, это явление подрывает функционирование агропродовольственных систем. Роспотребнадзор всеми силами противодействует распространению антибиотикорезистентности в России как 
через медицинские организации, так и через пищевые продукты. В ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора установлена гетерогенность популяций ESKAPE-патогенов. Показано, что даже в пределах 
одной линии патогенные изоляты могут иметь свои отличительные особенности, сформировавшиеся 
в процессе эволюции. Клональная схожесть штаммов, выделенных из продуктов питания, а также 
циркуляция в пищевой цепи трансмиссивных генов KPC, NDM, MBLBS, обусловливающих мультирезистентность бактерий, несут угрозу для здоровья населения.
Для своевременной и адекватной диагностики, проведения эпидемиологического надзора и предупреждения широкого распространения антимикробной резистентности специалисты института разрабатывают наборы реагентов, которые позволяют оперативно обнаруживать единичные гены, ассоциированные с резистентностью, непосредственно в биологическом материале. В настоящее время 
отечественные учёные работают над созданием системы мониторинга устойчивых штаммов и генетических детерминант резистентности (геномный эпидемиологический надзор).
Ключевые слова: антимикробная резистентность, устойчивость возбудителей инфекционных заболеваний к лекарственным средствам, микробиологический мониторинг, эпидемиология, инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи.
DOI: 10.31857/S0869587324010026, EDN: HBHAGL
Распространение антимикробной резистентности – ​
одна из самых острых проблем современности, представляющая биологическую и экономическую угрозу для всех стран. Главные факторы 
формирования устойчивости к противомикробным 
АКИМКИН Василий Геннадьевич – академик РАН, 
 
директор ЦНИИЭ Рос- 
потребнадзора.
препаратам – ​
ненадлежащее и чрезмерное их использование в медицине, ветеринарии, сельском 
хозяйстве, а  также неадекватная профилактика 
инфекций, особенно за последние 20 лет. По данным Генеральной Ассамблеи ООН на 22 сентября 
2022 г., устойчивость бактерий стала повсеместной 
бедой, которая влечёт за собой 5 млн смертей в год 
и в большей степени затрагивает страны с низким 
и средним уровнем дохода. Под угрозой оказались 
не только здоровье людей, животных, растений 
и благополучие окружающей среды, но и работа 
агропродовольственного сектора [1].
В рамках борьбы с устойчивостью патогенов 
к антибиотикам организовано партнёрство четырёх 
организаций (Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ), Всемирная организация по охране 
здоровья животных (ВООЗЖ), Продовольственная 
4

НАЦИОНАЛЬНАЯ СИСТЕМА МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО МОНИТОРИНГА

5
и сельскохозяйственная организация ООН (ФАО), 
Программа ООН по окружающей среде (ЮНЕП)), 
составляющих основу общемировой концепции 
“Единое здоровье” (One Health), которая подчёркивает взаимосвязь между людьми, животными, 
сельскохозяйственными культурами и их общей 
средой обитания (экосистемой) и направлена на 
стабильное поддержание баланса их здоровья на 
местном, региональном, национальном и глобальном уровне [2].
Согласно оценкам экспертов ВОЗ, антимикробная резистентность ежегодно служит причиной более 700 тыс. дополнительных смертей 
в мире, в том числе 22 тыс. приходится на страны Европы. К 2050 г. прогнозируется увеличение 
этого показателя до 10 млн человек в год, что превысит смертность от онкологических заболеваний и приведёт к сокращению мирового ВВП на 
2–3.5% (100 трлн долл.). Реальные же последствия 
непредсказуемы [3].
Глобальное распространение в 2020 г. новой 
коронавирусной инфекции, сопровождавшееся 
большим количеством заболевших, значительно 
усугубило проблему устойчивости микроорганизмов к противомикробным препаратам. Так, при совершенно чёткой рекомендации ВОЗ не назначать 
антибиотики пациентам с лёгким и среднетяжёлым 
течением COVID-19 при отсутствии клинического 
подозрения на бактериальную инфекцию, по данным Европейского регионального бюро ВОЗ, антибиотики всё же получают 75% больных, тогда как 
сопутствующая инфекция развивается примерно 
у 15% пациентов с тяжёлой формой заболевания. 
Эти цифры полностью согласуются с “Временными методическими рекомендациями по профилактике COVID-19” Минздрава России, где отмечено, 
что вторичные бактериальные инфекции осложняли течение болезни у 14.3–15% пациентов [4]. 
При этом, по данным Минздрава России, 68.9% 
пациентов с COVID-19 сообщили о применении 
антибиотиков до госпитализации (доля самолечения – ​
33%), а продажи препаратов для системного использования в 2020 г. возросли по сравнению 
с 2019 г. почти на 50% в денежном выражении [5].
Нерациональное применение антибиотиков в  период пандемии привело к  доминированию микроорганизмов группы ESKAPE 
1 (69.8%), 
в  частности, Staphylococcus (17.5%), Klebsiella 
spp. (12.1%), Escherichia coli (6.8%) и Acinetobacter 
spp. (5.9%), выделенных в госпиталях при лечении больных с COVID-19 (из окружающей среды, 
биологического и аутопсийного материала). При 
1 ESKAPE(E) – ​
аббревиатура, объединяющая научные 
названия высоковирулентных и  устойчивых к  антибиотикам бактериальных патогенов: Enterococcus faecium, 
Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter 
baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp., 
Escherichia coli.
этом у пациентов с пневмонией были выявлены 
дрожжевые грибы рода Candida в диагностически 
значимых количествах, отмечен значительный 
рост non-albicans-видов, в первую очередь C. auris 
(до 23%) [6]. Видовой состав патогенов разнообразен и включает плесневые грибы рода Aspergillus 
(до 70%), наиболее часто вызывающие инвазивный 
микоз у пациентов с COVID-19 [7].
Исследования и разработки ЦНИИЭ Роспотребнадзора. В 2013 г. Президент РФ утвердил “Основы 
государственной политики в области обеспечения 
химической и биологической безопасности РФ на 
период до 2025 года и дальнейшую перспективу” 
[8]. Распоряжением Правительства РФ от 25 сентября 2017 г. утверждена “Стратегия предупреждения и преодоления стойкости микроорганизмов 
и вредных организмов растений к лекарственным 
препаратам, химическим и биологическим средствам на период до 2030 года и дальнейшую перспективу” [9]. В этих документах распространение 
устойчивости патогенных микроорганизмов отнесено к числу основных причин, обусловливающих 
негативное воздействие биологических факторов 
на территории страны. В рамках исполнения плана мероприятий на 2019–2024 гг. по реализации 
упомянутой стратегии (Распоряжение Правительства РФ от 30.03.2019 г. № 604-р) Роспотребнадзор 
проводит работу по противодействию распространению устойчивости патогенов на национальном 
и международном уровне. На базе Центрального 
научно-исследовательского института эпидемиологии Роспотребнадзора (ЦНИИЭ Роспотребнадзора) создан референс-центр по мониторингу 
резистентности, связанной с  применением антибиотиков в медицинских организациях (2017) 
и  в  пищевой индустрии (2018). Центр выступает координатором участия России в деятельности 
Комиссии “Кодекс Алиментариус”, созданной под 
эгидой ФАО и ВОЗ, а также на площадке СНГ.
По данным референс-центра, за 2018–2023 гг. 
в 72 субъектах РФ установлено 47 507 антибиотикорезистентных микроорганизмов (82.7% всех выявленных возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи). При этом более 
75% входят в группу ESKAPE-патогенов, а 22.3% 
обладают фенотипом множественной устойчивости (MDR). Для части подобных изолятов (3127 
культур) определение генов резистентности проводилось методом ПЦР. Наибольшую долю составили микроорганизмы – ​
продуценты бета-лактамаз 
расширенного спектра (58%) и карбапенемаз (34%).
В ЦНИИЭ Роспотребнадзора впервые в России проведено широкомасштабное эпидемиологическое исследование клинических изолятов на 
основе секвенирования третьего поколения и получены подробные данные по детерминантам антибиотикорезистентности, вирулентности и  их 
локализации для нескольких групп особо опасных 
ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК	
том 94	
№ 1	
2024

АКИМКИН
патогенов: доминировали K. pneumoniae (30%) 
и P. аeruginosaе (29%). За 2018–2023 гг. были получены сведения о полной структуре геномов 152 
изолятов K. pneumoniae госпитального происхождения. Среди них преобладал сиквенс-тип ST 395 
(34%), распространённый на территориях Центрального, Южного и Сибирского федеральных 
округов, обладающий мультирезистентным генотипом с повышенной вирулентностью и способностью вызывать тяжёлые септические состояния 
(частота летального исхода до 45%) [10]. В отношении синегнойной палочки наблюдается вытеснение преобладавшего ранее типа ST 235 сиквенс-типом ST 654 (13.5 и 36% изолятов соответственно).
Исследования по Московской области показали, что у пациентов, не совершавших международных поездок до поступления в больницу, в течение ограниченного времени были выделены 
пять из девяти известных международных клонов 
A. baumannii высокого риска. Проведённый анализ 
выявил гетерогенность популяций ESKAPE-патогенов и показал, что даже в пределах одной линии 
патогенные изоляты могут иметь отличительные 
особенности, сформировавшиеся в процессе эволюции. Все эти примеры свидетельствуют о наличии реальных угроз для здоровья населения и системы здравоохранения, доказывают важность 
мониторинга штаммов микроорганизмов с целью 
прогноза ситуации в стационарах.
ЦНИИЭ Роспотребнадзора постоянно взаимодействует с научными организациями в области 
изучения резистентности возбудителей инфекций, 
связанных с  оказанием медицинской помощи: 
НИИ антимикробной химиотерапии Смоленского государственного медицинского университета 
Минздрава России (Смоленск); Национальным 
медицинским исследовательским центром акушерства, гинекологии и перинатологии им. В.И. Кулакова Минздрава России (Москва); Национальным 
медико-хирургическим центром им. Н.И. Пирогова Минздрава России (Москва); Государственным научным центром прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора (пос. Оболенск); Тюменским НИИ краевой инфекционной 
патологии Роспотребнадзора (Тюмень); Хабаровским НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора (Хабаровск); Ростовским-на-Дону противочумным институтом Роспотребнадзора (Ростов-на-Дону); НИИ системной биологии 
и медицины Роспотребнадзора (Москва); Детским 
научно-клиническим центром инфекционных болезней ФМБА России (Санкт-Петербург).
В реализации научной программы Роспотребнадзора по эпидемиологии и  этиологической 
структуре внебольничных пневмоний и пневмоний, 
связанных с оказанием медицинской помощи в период пандемии COVID-19 (2020–2021), участвовало три научных организации Роспотребнадзора 
(Центральный НИИ эпидемиологии, Хабаровский 
НИИЭМ, Ростовский-на-Дону противочумный 
институт), а также центры гигиены и эпидемиологии Хабаровского края, Амурской и Ростовской областей. Полученные результаты продемонстрировали увеличение обнаружения карбапенемоустойчивой K. pneumoniae c 65 до 88% [11] и дрожжей 
рода Candida в диагностически значимых количествах (с 35 до 45%) на 7–14 день после госпитализации пациентов [12, 13].
Проведён целый ряд исследований по выявлению генов устойчивости к противомикробным 
препаратам у пациентов различных нозологий. Так, 
в результате совместной работы научно-клинического отдела муковисцидоза Медико-генетического научного центра им. академика Н.П. Бочкова 
и ЦНИИЭ Роспотребнадзора по поиску детерминант антибиотикорезистентности в отделяемом ротоглотки детей с муковисцидозом (100 пациентов) 
относительно группы контроля (100 условно здоровых детей) найдено 33 гена бактериальной устойчивости у 28 больных детей, в то время как в контрольной группе – ​
1 ген. Это позволило сделать 
вывод, что в случае пациентов с муковисцидозом, 
при использовании статистического метода расчёта 
шансов детерминанты антибиотикорезистентности 
в отделяемом ротоглотки обнаруживаются значительно чаще (в 38.5 раза) по сравнению со здоровыми детьми (p<0.001) [14].
ЦНИИЭ Роспотребнадзора и  НИИ антимикробной химиотерапии показали возможность увеличения числа неинвазивных и инвазивных типов 
S. pneumoniae до 92 и 98.5% соответственно с помощью метода полногеномного секвенирования 
(против 69 и 87% при использовании классического метод ПЦР) штаммов от пациентов с инвазивной пневмококковой инфекцией (238 штаммов). 
Полученные данные подтверждают потенциал полногеномного секвенирования при определении серотипов пневмококков [15–17].
Для осуществления своевременной и адекватной диагностики, эпидемиологического надзора и предупреждения распространения наиболее 
важных факторов антимикробной резистентности 
специалисты ЦНИИЭ Роспотребнадзора разрабатывают наборы реагентов, которые позволяют на 
основе метода ПЦР выявлять соответствующие 
гены непосредственно в биологическом материале. 
Подобный подход чрезвычайно перспективен, поскольку не требует много времени и манипуляций 
с живыми бактериальными культурами, что предотвращает возможное распространение микроорганизмов внутри медицинских организаций. Внедрены тест-системы, позволяющие детектировать:
• маркеры метициллинрезистентных стафилококков (нечувствительность к бета-лактамным 
антибиотикам) и  ДНК S. aureus (метициллинрезистентный золотистый стафилококк, MRSA; 
	
ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК	
том 94	
№ 1	
2024

НАЦИОНАЛЬНАЯ СИСТЕМА МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО МОНИТОРИНГА

7
материале [22, 23]. По данным Роспатента, патент “Система CRISPR-Cas для выявления гена 
антибиотикоустойчивости blaVIM-2 Pseudomonas 
aeruginosa в ультранизких концентрациях” вошёл 
в пятёрку лучших медицинских изобретений по 
итогам 2021 г.
Антибиотики в  сельском хозяйстве. Сельскохозяйственные животные и пищевая продукция 
животного происхождения входят в число главных источников распространения возбудителей 
инфекционных заболеваний человека. Согласно 
международным экспертным оценкам, 60–80% 
известных антибиотиков используются в сельском 
хозяйстве и ветеринарии для лечения, в качестве 
стимуляторов роста и в кормовых добавках, при 
этом их остаточное содержание в полученных продуктах питания никак не контролируется [24].
В животноводстве применяются основные 
группы антибиотиков, предназначенные для лечения инфекционных заболеваний человека, что 
стимулирует селекцию устойчивых штаммов. 
Клинически значимые механизмы антибиотикорезистентности выявляются у  патогенных и  условно-патогенных бактерий, полученных от сельскохозяйственных животных, из пищевых продуктов, продовольственного сырья, воды и объектов 
окружающей среды. Они могут вызывать инфекции, колонизировать слизистые оболочки и кожу 
контактирующих с ними людей [25].
Многолетнее сотрудничество ЦНИИЭ Роспотребнадзора и ФАО ООН привело к назначению 
института 12 декабря 2022 г. 9-м референс-центром 
ФАО по устойчивости к противомикробным препаратам в пищевой продукции и сельском хозяйстве. 
В число задач центра входят: сбор, характеристика и анализ гено- и фенотипических детерминант 
резистентности микроорганизмов, выделенных 
из пищевой продукции; определение антибиотиков в пище; оказание научно-методической помощи в организации исследований в России и государствах ВЕКЦА 
3 (Армения, Беларусь, Казахстан, 
Кыргызстан, Таджикистан).
За 2018–2022 гг. в  референс-центр поступило 7317 бактерий из пищевой продукции, обнаруженных на территории России и сопредельных 
государств. Из них 5674 оказались устойчивы как 
минимум к  одному классу противомикробных 
препаратов, а 1547 обладали множественной резистентностью к трём и более группам антибиотиков. 
Основным источником таких микроорганизмов 
стала кулинарная (37.6%) и птицеводческая продукция (32.3%). Обсеменёнными также оказались 
метициллинрезистентные коагулазонегативные 
стафилококки, MRCNS);
• гены приобретённых карбапенемаз 
2 групп 
KPC и OXA-48-подобных (типы OXA-48 и OXA-162) 
у грамотрицательных бактерий;
• гены приобретённых карбапенемаз класса MBL 
(группы VIM, NDM, IMP);
• мутации в области генов 23S рРНК и ParC 
M. genitalium, определяющие устойчивость микобактерий к макролидам и фторхинолонам [18].
Кроме того, разработаны четыре набора реагентов для нахождения методом ПЦР генов антибиотикорезистентности микроорганизмов в выделенных бактериальных культурах, включая тест-системы для выявления гена фермента бета-лактамазы 
расширенного спектра CTX–M (определяющего 
нечувствительность к бета-лактамным антибиотикам из групп пенициллинов, цефалоспоринов, 
монобактамов), генов vanA, vanB и mcr-1 (устойчивость бактерий к  ванкомицину и  колистину 
соответственно).
Учёные ЦНИИЭ Роспотребнадзора применяют на практике самые современные мировые инновационные технологические решения. Созданы 
наборы реагентов для поиска генов антибиотикорезистентности микроорганизмов методом изотермической амплификации (LAMP), отличающейся большой скоростью реакции (до 40 мин, 
около 80–90% положительных образцов детектируются в течение 15 мин) [19] и не уступающей по 
чувствительности и специфичности классической 
ПЦР с обратной транскрипцией. С помощью данной технологии уже получен набор реагентов для 
определения MRSA в биологическом материале. 
С целью выявления грибковых инфекций созданы 
наборы для детекции и дифференциальной идентификации отдельных видов патогенных грибов 
Candida auris и Aspergillus niger. Их большое преимущество – ​
наличие в ЦНИИЭ Роспотребнадзора собственной ферментной базы, которая включает ДНК-полимеразу, полученную из Bacillus 
stearothermophilus (ДНК-полимераза Bst) [20].
Методика CRISPR-Cas для направленного редактирования геномов – ​
перспективное направление современной мировой генной инженерии [21]. 
Она используется при создании в ЦНИИЭ Роспотребнадзора тест-систем нового поколения, 
предназначенных для поиска нуклеиновых кислот 
возбудителей инфекционных заболеваний. В настоящее время получено три патента на способы 
применения методики CRISPR-Cas для детектирования ультранизких количеств (единичные копии, 
101) генов антибиотикорезистентности у бактерий 
рода Pseudomonas непосредственно в клиническом 
2 Карбапенемазы – ​
бактериальные ферменты, способные 
расщеплять все типы бета-лактамных антибиотиков.
3 ВЕКЦА (EECCA – ​
Eastern Europe, Caucasus and Central 
Asia) – ​
субрегион, охватывающий страны Восточной Европы, Кавказа и Центральной Азии (12 стран бывшего СССР, 
за исключением Латвии, Литвы и Эстонии).
ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК	
том 94	
№ 1	
2024

АКИМКИН
тетрациклинам (29%), у сальмонелл – ​
к аминогликозидам (98.9%), тетрациклинам (73.9%) и бета-лактамам (40%). Основные сиквенс-типы 
S. aureus, выявленные на территории РФ и стран 
ВЕКЦА в  2018–2022 гг., – ​
культуры MRSA 
сиквенс-типов ST11 (41%), ST15 (9.1%), ST5 (8.1%), 
а  также ST32-серотип Infantis и  ST11-серотип 
 
Enteritidis сальмонелл. Подобное распространение 
одинаковых доминирующих сиквенс-типов на территории всех стран – ​
участниц мониторинга может 
свидетельствовать о сходных характере и спектре 
применения антибиотиков в сельскохозяйственной отрасли.
мясные (12.6%), молочные (8.5%), рыбные (3.5%) 
и кондитерские (2.6%) продуты.
Основные патогенные микроорганизмы, установленные в  пищевых продуктах и  продовольственном сырье в  2018–2022 гг., – ​
Salmonella 
enterica (46.1%) и Staphylococcus aureus (26%). Динамика резистентности бактерий рода Salmonella 
(n = 3 371) в 2018–2021 гг. свидетельствует об увеличении стойкости к антибиотикам фторхинолоновой группы (до 62%), бета-лактамам (до 55.1%), 
аминогликозидам (до  48.3%), тетрациклинам 
(до 49.8%). Особое беспокойство вызывает появление в 2020 г. изолятов рода Salmonella, устойчивых к колистину (9.4%). В 2022 г. отмечено некоторое снижение доли штаммов, нечувствительных 
к фторхинолонам (49.2%), бета-лактамам, аминогликозидам и тетрациклинам (до 27.8%), а также 
уменьшение количества колистинрезистентных 
сальмонелл до 4.7%, что может быть результатом 
разумного применения в России и странах СНГ 
важных с медицинской точки зрения противомикробных препаратов для животных. Однако, несмотря на общее сокращение резистентных изолятов рода Salmonella, за 2018–2022 гг. наблюдалось 
увеличение более чем в 2 раза мультирезистентных 
сальмонелл (с 22.8% в 2018 г. до 46.9% в 2022 г.).
Пятилетний мониторинг чувствительности 
к противомикробным препаратам культур S. aureus 
показал волнообразную динамику. Доля метициллинрезистентных культур S. aureus, выделенных из 
пищевой продукции, изменялась от 53.5% в 2018 г. 
до 56.3% в 2022 г. с пиком 81.4% изолятов MRSA 
в  2020 г. В  2020 г. отмечалась их максимальная 
устойчивость к тетрациклинам (16.9%), аминогликозидам (16.9%), фторхинолонам (6.2%) и минимальная – ​
к макролидам и линкозамидам (7.4%). 
В 2021 г. снизилась доля культур, стойких ко всем 
группам антибиотиков, за исключением макролидов и линкозамидов (у них самый высокий показатель – ​
16.8%). В 2022 г. наметилась тенденция 
снижения доли антибиотикорезистеных штаммов 
S. aureus ко всем исследованным группам антибиотиков, кроме тетрациклинов (увеличение с 8.7 
до 9.3%). Стоит отметить, что 81.4% резистентных 
культур относились к MRSA, а доля невосприимчивых к ванкомицину (VRSA) изолятов была низкой на протяжении всего периода наблюдений: 
3.4% в 2018 г. и 0.3% в 2022 г.; в 2019–2021 гг. VRSA 
выявлено не было.
MDR-культуры S. aureus показали минимум 
в  2019 г. (0.7%), максимум – ​
в  2020 г. (16.8%), 
а в 2022 г. произошло их снижение до 8.7%. Полногеномные исследования MDR-изолятов S. aureus 
(n = 200) и сальмонелл (n = 896) показали наличие у них детерминант резистентности ко всем основным классам противомикробных препаратов: 
в том числе у штаммов золотистого стафилококка – ​
к бета-лактамам (87%), макролидам (36.5%), 
*
*
*
В условиях распространения резистентности на 
глобальном уровне важно понимать, что перенос 
генов устойчивости от людей и животных, получающих антибиотики, продолжается в биосфере, 
куда они попадают с отходами и стоками больниц, 
ферм, боен, предприятий аквакультуры, а также 
процветает на территории самих этих организаций. 
Подтверждение тому – ​
регулярное обнаружение 
бактерий и фагов, несущих такие гены, в местах 
сброса стоков, повышение их содержания в водоёмах, почве и воздухе вблизи ферм, даже у работников этих ферм [26]. Клональная схожесть 
полученных из продуктов штаммов, циркуляция в пищевой цепи трансмиссивных генов KPC, 
NDM, MBLBS, определяющих мультирезистентность бактерий, признаются угрозой здоровью населения. Гены устойчивости к лекарствам последних поколений передаются человеку с пищей либо 
контактным путём, таким образом расширяя свой 
ареал [27].
Усиление надзора и мониторинга резистентности и использования противомикробных препаратов в пищевой промышленности и сельском хозяйстве входит в число главных целей принятого ФАО 
плана борьбы с этой проблемой [28]. План функционирует в странах ЕС, во многом на его основе 
подготовлена стратегия борьбы с антибиотикорезистентностью ВОЗ и стран G7 [29].
В России в ближайшей перспективе планируется создать систему мониторинга распространённости устойчивых штаммов и генетических детерминант резистентности в медицинских организациях. 
Параллельно в РФ и странах ВЕКЦА будет непрерывно контролироваться циркуляция геновариантов основных возбудителей болезней пищевого 
происхождения, невосприимчивых к противомикробным препаратам. Подобный геномный эпидемиологический надзор использует приложения 
секвенирования последнего поколения и обеспечивает доступность данных о полном геноме вируса. На этой основе предлагаются новые средства обнаружения фенотипически или антигенно 
отличающихся вариантов, что позволит быстрее 
	
ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК	
том 94	
№ 1	
2024