Квантово-химическое моделирование физико-химических свойств химических соединений
Покупка
Тематика:
Квантовая химия
Год издания: 2021
Кол-во страниц: 84
Дополнительно
Вид издания:
Учебное пособие
Уровень образования:
ВО - Бакалавриат
ISBN: 978-5-7882-3054-2
Артикул: 809777.01.99
Рассмотрены особенности теоретических методов исследования в химии, основные квантово-химические подходы и методы. Приведены примеры квантово-химического моделирования молекулярного строения и некоторых физико-химических свойств химических соединений. Предназначено для бакалавров и магистров химико-технологических направлений подготовки, также может использоваться аспирантами, обучающимися по направлению «Химические науки» (направленность «Физическая химия»).
Подготовлено на кафедре физической и коллоидной химии.
Тематика:
ББК:
УДК:
ОКСО:
- ВО - Бакалавриат
- 04.03.01: Химия
- 04.03.02: Химия, физика и механика материалов
- ВО - Магистратура
- 04.04.01: Химия
- 04.04.02: Химия, физика и механика материалов
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации Казанский национальный исследовательский технологический университет К. А. Романова, Ю. Г. Галяметдинов КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ХИМИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ Учебное пособие Казань Издательство КНИТУ 2021
УДК 541.1(075) ББК Г511.2я7 Р69 Печатается по решению редакционно-издательского совета Казанского национального исследовательского технологического университета Учебное пособие подготовлено в рамках проекта, реализуемого победителем конкурса на предоставление грантов преподавателям магистратуры благотворительной программы «Стипендиальная программа Владимира Потанина» Благотворительного фонда Владимира Потанина 2020/2021 Рецензенты: д-р хим. наук, проф. Я. А. Верещагина канд. физ.-мат. наук В. С. Лобков Р69 Романова К. А. Квантово-химическое моделирование физико-химических свойств химических соединений : учебное пособие / К. А. Романова, Ю. Г. Галяметдинов; Минобрнауки России, Казан. нац. исслед. технол. ун-т. – Казань : Изд-во КНИТУ, 2021. – 84 с. ISBN 978-5-7882-3054-2 Рассмотрены особенности теоретических методов исследования в химии, основные квантово-химические подходы и методы. Приведены примеры квантовохимического моделирования молекулярного строения и некоторых физико-химических свойств химических соединений. Предназначено для бакалавров и магистров химико-технологических направлений подготовки, также может использоваться аспирантами, обучающимися по направлению «Химические науки» (направленность «Физическая химия»). Подготовлено на кафедре физической и коллоидной химии. ISBN 978-5-7882-3054-2 © Романова К. А., Галяметдинов Ю. Г., 2021 © Казанский национальный исследовательский технологический университет, 2021 УДК 541.1(075) ББК Г511.2я7 2
СОДЕРЖАНИЕ СПИСОК УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ .................................................... 4 ВВЕДЕНИЕ ........................................................................................................ 8 1. ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ В ХИМИИ ............ 9 1.1. Молекулярное моделирование в химии .................................... 9 1.2. Квантово-химические подходы и методы ............................... 10 1.2.1. Молекулярная механика и молекулярная динамика ......... 16 1.2.2. Полуэмпирические методы ................................................ 27 1.2.3. Неэмпирические методы .................................................... 34 1.2.4. Теория функционала плотности ....................................... 46 1.2.5. Базисные наборы ................................................................. 52 2. МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРОЕНИЯ И ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ СОЕДИНЕНИЙ ........................................................................... 55 2.1. Оптимизация геометрии молекулы ......................................... 55 2.2. Моделирование колебательных частот ................................... 59 2.3. Учет влияния растворителя ...................................................... 63 2.4. Моделирование возбужденных состояний ............................. 68 2.5. Подходы к моделированию материалов .................................. 78 БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК .......................................................... 81
СПИСОК УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ ВЗМО (HOMO) – высшая занятая молекулярная орбиталь (the high est occupied molecular orbital). ММ – молекулярная механика. МО ЛКАО – приближение «молекулярная орбиталь – линейная комбинация атомных орбиталей». НСМО (LUMO) – низшая свободная (виртуальная) молекулярная орбиталь (the lowest unoccupied molecular orbital). ППЭ – поверхность потенциальной энергии. AM1 – модель «Остин 1» (Austin model 1). BP – функционал Бекке–Пердью (Burke–Perdew density functional). BLYP – обменно-корреляционный функционал Бекке–Ли–Янга– Парра (Becke–Lee–Yang–Parr density functional). CASPT2 – теория возмущений второго порядка полного активного пространства орбиталей (complete active space with second order perturbation theory). CASSCF – SCF-метод полного активного пространства орбиталей (complete active space self-consistent field). СС – метод связанных кластеров (coupled cluster). CCSD – метод связанных кластеров с учетом одно- и двухкратных возбуждений (coupled cluster singles and doubles). CCSD(T) – метод связанных кластеров с учетом одно-, двух- и трехкратных возбуждений (coupled cluster singles, doubles and triples). CCSD(TQ) – метод связанных кластеров с учетом одно-, двух-, трех- и четырехкратных возбуждений (coupled cluster singles, doubles, triples and quadruples). CI – метод конфигурационного взаимодействия (сonfiguration interaction method). CIS – метод конфигурационного взаимодействия с учетом одно кратно возбужденных электронных конфигураций (configuration interaction singles). CISD – метод конфигурационного взаимодействия с учетом одно- и двукратно возбужденных электронных конфигураций (configuration interaction with single and double excitations). CNDO – приближение полного пренебрежения дифференциаль ным перекрыванием (complete neglect of differential overlap).
COSMO – электропроводящая модель экранирования (conductor like screening model). DFT – теория функционала плотности (density functional theory). EFP – метод эффективных фрагментов (effective fragment poten tial method). EOM-CC – метод связанных кластеров в формализме уравнений движения (equation-of-motion coupled cluster). GGA – обобщенное градиентное приближение (generalized gradient approximation). GTO – орбитали гауссова типа (Gaussian type orbital). HCTH – обменно-корреляционный функционал Хампрехта–Ко эна–Тозера–Хэнди (Hamprecht–Cohen–Tozer–Handy density functional). HF – метод Хартри–Фока (Hartree–Fock method). INDO – частичное пренебрежение дифференциальным перекрыва нием (intermediate neglect of the differential overlap). IPCM – модель статической поверхности изоплотности (isoden sity polarized continuum model). LDA – приближение локальной плотности (local-density approxi mation). LR-CC – метод связанных кластеров в формализме линейного от клика (linear-response coupled cluster). LYP – корреляционный функционал Ли–Янга–Парра (Lee–Yang– Parr density functional). MCQDPT – многоконфигурационная квазивырожденная теория возмущений (multi-configuration quasi-degenerate perturbation theory). MCPT – многоконфигурационная теория возмущений (multi configuration perturbation theory). MCSCF – многоконфигурационный метод самосогласованного поля (multi-configuration self-consistent field). MNDO – модифицированное пренебрежение двухатомным пере крыванием (modified neglect of diatomic overlap). MINDO/3 – модифицированное частичное пренебрежение диф ференциальным перекрыванием, версия 3 (modified intermediate neglect of the differential overlap, version 3). МР – теория возмущений Меллера–Плессета (Møller–Plesset per turbation theory). MRMP – многодетерминантная теория возмущений Меллера– Плессета (multi-reference Møller–Plesset perturbation theory).
NDDO – пренебрежение дифференциальным двухатомным пере крыванием (neglect of diatomic differential overlap). NEVPT2 – теория возмущений второго порядка валентного состо яния N-электронов (N-electron valence state perturbation theory at second order). OLYP – оптимизированный обменный функционал Ли–Янга– Парра (OPTX Lee–Yang–Parr density functional). OPTX – оптимизированный обменный функционал (Handy–Cohen optimized exchange density functional). PBE – обменно-корреляционный функционал Пердью–Берке– Эрнцерхофа (Perdew–Burke–Ernzerhof density functional). PCM – модель поляризационного континуума Томаси (polarized continuum model). P-HF – спин-проектированный метод Хартри–Фока (projected Har tree–Fock method). PM3, PM6 и PM7 – параметрическая модель № 3, 6 и 7 (parameteri zed model number 3, 6 and 7). PT – теория возмущений (perturbation theory). PW91 – корреляционный функционал Пердью–Ванга (Perdew– Wang 91 density functional). QCCSD – квадратичный метод связанных кластеров с учетом одно- и двухкратных электронных возбуждений (quadratic coupled cluster singles and doubles). QCISD – квадратичный метод конфигурационного взаимодей ствия с учетом одно- и двухкратных электронных возбуждений (quadratic configuration interaction singles and doubles). QDPT – квазивырожденная теория возмущений (quasi-degenerate perturbation theory). QM/ММ – гибридный метод квантовой механики / молекулярной механики (quantum mechanics/molecular mechanics). RHF – ограниченный (по спину) метод Хартри–Фока (restricted Hartree–Fock method). ROHF – ограниченный метод Хартри–Фока для открытой обо лочки (restricted open-shell Hartree–Fock method). ROKS – ограниченный метод Кона–Шэма (restricted open-shell Kohn–Sham). SCF – метод самосогласованного поля (self-consistent field the ory).
SCIPCM – самосогласованная модель поляризационной среды с учетом изоплотности (self-consistent isodensity polarized continuum model). SM5 – континуумная модель растворителя (solution model 5). SMLC – модель Спаркл для расчета комплексов лантаноидов (Sparkle model for the calculation of lanthanide complexes). STO – орбитали слейтеровского типа (Slater-type orbitals). TDDFT – нестационарная теория функционала электронной плотности с зависимостью от времени (time-dependent density functional theory). UHF – неограниченный метод Хартри–Фока (unrestricted Hartree– Fock method). VWN – корреляционный функционал Воско–Вилка–Нусара (Vosko–Wilk–Nusair density functional). XMCQDPT2 – расширенная многоконфигурационная квазивы рожденная теория возмущений второго порядка (extended multi-configuration quasi-degenerate perturbation theory at second order of perturbation theory expansion). ZDO – приближение нулевого дифференциального перекрыва ния (zero differential overlap). ZINDO – частичное пренебрежение дифференциальным пере крыванием (Zerner's intermediate neglect of differential overlap). 7
ВВЕДЕНИЕ Современные методы квантовой химии превратили молекулярное моделирование в надежный и важнейший инструмент физических и химических исследований. Применение теоретических методов позволяет получить важную информацию о строении, физико-химических свойствах и поведении веществ, находить объяснение наблюдаемым экспериментальным эффектам и значительно дополнять их, устанавливать принципы влияния строения на физико-химические свойства веществ и их реакционную способность, предсказывать пути протекания реакций. Интенсивное развитие вычислительной техники, непрерывное совершенствование программных продуктов, теоретических подходов и методов расчета позволили значительно расширить возможности моделирования химических соединений сложного строения, многоатомных систем, кластеров, объектов изучения нанотехнологий, функциональных материалов, биологически активных молекул. В данном учебном пособии изложены особенности теоретиче ских методов исследования в химии, основные понятия и законы квантовой химии. Рассматриваются основные квантово-химические подходы и методы, их недостатки и достоинства, ограничения и области применения. Приведены особенности выполнения квантово-химического моделирования молекулярного строения, колебательных частот, оптических параметров и некоторых других физико-химических свойств химических соединений, сравнения результатов моделирования с экспериментальными данными. Пособие рекомендуется всем, кто изучает дисциплины «Инстру ментальные методы исследования в химической технологии», «Физическая химия», «Дополнительные главы физической химии», «Физическая и коллоидная химия» и «Актуальные проблемы физической химии». Может использоваться аспирантами, обучающимися по направлению «Химические науки», направленность программы аспирантуры «Физическая химия». 8
1. ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ В ХИМИИ 1.1. Молекулярное моделирование в химии В настоящее время методы молекулярного моделирования широко используются для решения широкого круга теоретических и прикладных задач в различных областях знаний, в том числе в нанотехнологиях, биохимии, при исследованиях структуры и поведения веществ, при разработке новых материалов, лекарств и др. Применение молекулярного моделирования позволяет получить информацию о строении и физико-химических свойствах веществ до проведения их синтеза, значительно дополнить экспериментальные данные, определить геометрические параметры соединений, спрогнозировать различные свойства веществ (дипольный момент, поляризуемость, магнитные характеристики, константы спин-спинового взаимодействия и др.), частоты колебаний в инфракрасных спектрах, химические сдвиги, возбужденные состояния, предсказывать пути протекания реакций и т. д. Основная задача молекулярного моделирования заключается не только в научном прогнозировании тех или иных величин и процессов, но и поиске причинно-следственной связи «молекулярная структура–физико-химические свойства и поведение», в обосновании основных химических представлений и закономерностей, в изучении принципов влияния строения на реакционную способность веществ, в прогнозировании соединений с улучшенными свойствами. Помимо этого, современные методы молекулярного моделирования применяют при изучении ферментативного катализа, структуры и динамики биологических и полимерных систем, а также процессов протекающих с участием белков, ДНК и мембран. Молекулярное моделирование может базироваться как на формализации химических знаний и использовании при прогнозировании неких правил и обобщений, выведенных из анализа экспериментальных данных, так и на квантовой теории и вычислительных приемах квантовой химии. Особенностью последнего варианта является фундаментальность и универсальность используемых подходов и положений. Преимущества квантового моделирования многочисленны. В первую очередь, данные подходы можно использовать для изучения физикохимических систем, недоступных экспериментально, например, слишком большого или малого размера, а также для исследования свойств объектов и процессов, неизвестных или нерегистрируемых на практике, которые, однако, могут быть сопоставлены моделируемым системам.