Культура животных клеток
Покупка
Тематика:
Общая генетика. Общая цитология
Издательство:
Лаборатория знаний
Автор:
Фрешни Р. Я.
Год издания: 2022
Кол-во страниц: 791
Дополнительно
Вид издания:
Практическое пособие
Уровень образования:
ВО - Бакалавриат
ISBN: 978-5-00101-974-9
Артикул: 620418.02.99
Учебное издание, написанное ведущим специалистом в данной области, содержит наиболее полное описание теоретических основ и практических приемов работы с культурами животных клеток, а также необходимого
оборудования, включая лабораторный дизайн. В достаточном объеме освещены вопросы техники безопасности. Подробно обсуждаются методика подготовки сред, приемы работы с первичной культурой и клеточными линиями. Описано специальное оборудование, в том числе для манипуляций с культурами животных клеток. Книга прекрасно иллюстрирована и удобна для использования как руководство в лаборатории.
Для студентов-биологов, биотехнологов, медиков, а также исследователей, специалистов биофармацевтических центров и сотрудников диагностических лабораторий.
Тематика:
ББК:
УДК:
ОКСО:
- ВО - Бакалавриат
- 06.03.01: Биология
- 19.03.01: Биотехнология
- ВО - Магистратура
- 06.04.01: Биология
- 19.04.01: Биотехнология
- ВО - Специалитет
- 30.05.01: Медицинская биохимия
- 30.05.02: Медицинская биофизика
- 31.05.01: Лечебное дело
- 32.05.01: Медико-профилактическое дело
- 33.05.01: Фармация
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов.
Для полноценной работы с документом, пожалуйста, перейдите в
ридер.
КУЛЬТУРА ЖИВОТНЫХ КЛЕТОК ПРАКТИЧЕСКОЕ РУКОВОДСТВО
СULTURE OF ANIMAL CELLS A MANUAL OF BASIC TECHNIQUE AND SPECIALIZED APPLICATIONS R. Jan Freshney Cancer Research UK Centre or Oncology and Applied Pharmacology Division of Cancer Sciences and Molecular PharmacologyUniversity of Glasgow Willey-Liss Sixth Edition
КУЛЬТУРА ЖИВОТНЫХ КЛЕТОК ПРАКТИЧЕСКОЕ РУКОВОДСТВО 5-е издание, электронное Р. Я. Фрешни Перевод 6-го английского издания Москва Лаборатория знаний 2022
УДК 57.08 ББК 28.03 Ф87 П е р е в о д ч и к и: д-р биол. наук Ю. Н. Хомяков, канд. мед. наук Т. И. Хомякова Фрешни Р. Я. Ф87 Культура животных клеток : практическое руководство / Р. Я. Фрешни ; пер. 6-го англ. изд. — 5-е изд., электрон. — М. : Лаборатория знаний, 2022. — 791 с. — Систем. требования: Adobe Reader XI ; экран 10". — Загл. с титул. экрана. — Текст : электронный. ISBN 978-5-00101-974-9 Учебное издание, написанное ведущим специалистом в данной области, содержит наиболее полное описание теоретических основ и практических приемов работы с культурами животных клеток, а также необходимого оборудования, включая лабораторный дизайн. В достаточном объеме освещены вопросы техники безопасности. Подробно обсуждаются методика подготовки сред, приемы работы с первичной культурой и клеточными линиями. Описано специальное оборудование, в том числе для манипуляций с культурами животных клеток. Книга прекрасно иллюстрирована и удобна для использования как руководство в лаборатории. Для студентов-биологов, биотехнологов, медиков, а также исследователей, специалистов биофармацевтических центров и сотрудников диагностических лабораторий. УДК 57.08 ББК 28.03 Приведенные в книге показания к применению, противопоказания и дозировки препаратов настоятельно рекомендуется сверять с информацией их производителей и соотносить с клиническими процедурами. Авторы, редакторы и издатель не несут никакой юридической ответственности за любые содержащиеся в тексте и иллюстрациях ошибки или упущения. В соответствии со ст. 1299 и 1301 ГК РФ при устранении ограничений, установленных техническими средствами защиты авторских прав, правообладатель вправе требовать от нарушителя возмещения убытков или выплаты компенсации ISBN 978-5-00101-974-9 © Copyright 2010 by John Wiley & Sons. Inc. All rights reserved. Все права защищены. Авторизованный перевод издания на английском языке, опубликованного John Wiley & Sons Limited. Ответственность за точность перевода полностью возложена на издательство Лаборатория знаний и не является ответственностью John Wiley & Sons Limited. Никакая часть данной книги не может быть воспроизведена в любой форме без письменного разрешения первоначального правообладателя, John Wiley & Sons Limited. © Перевод на русский язык, оформление, Лаборатория знаний, 2015
Оглавление Список иллюстраций . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Список цветных вклеек . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Список протоколов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 Список таблиц . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 Предисловие и благодарности . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 Список сокращений . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 Глава 1 ВВЕДЕНИЕ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 1.1. Исторические сведения . . . . . . . . . . . . . . . 30 1.2. Преимущества культуры ткани . . . . . . . 35 1.2.1. Контроль окружающей среды . . . . . . . . . . . 35 1.2.2. Характеристика и однородность образцов 36 1.2.3. Экономичность, эффективность и автоматизация процесса . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 1.2.4. Моделирование in vitro условий in vivo . . . 36 1.3. Ограничения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 1.3.1. Наличие специальных навыков . . . . . . . . . 36 1.3.2. Затраты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 1.3.3. Дифференцировка и селекция . . . . . . . . . . 37 1.3.4. Происхождение клеток . . . . . . . . . . . . . . . . 37 1.3.5. Нестабильность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 1.4. Основные отличия культуры in vitro . . . 38 1.5. Типы культуры ткани . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Глава 2 БИОЛОГИЯ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ КЛЕТОК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 2.1. Влияние окружающей среды на культуру клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 2.2. Клеточная адгезия . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 2.2.1. Молекулы клеточной адгезии . . . . . . . . . . . 41 2.2.2. Межклеточные контакты . . . . . . . . . . . . . . . 42 2.2.3. Внеклеточный матрикс . . . . . . . . . . . . . . . . 43 2.2.4. Цитоскелет . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44 2.2.5. Клеточная подвижность . . . . . . . . . . . . . . . 44 2.3. Клеточная пролиферация . . . . . . . . . . . . . 45 2.3.1. Клеточный цикл . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 2.3.2. Контроль клеточной пролиферации . . . . . . 46 2.4. Дифференцировка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46 2.4.1. Поддержание дифференцировки . . . . . . . . 47 2.4.2. Дедифференцировка . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47 2.5. Передача клеточных сигналов . . . . . . . . 50 2.6. Энергетический метаболизм . . . . . . . . . . 51 2.7. Происхождение культивируемых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51 2.7.1. Получение первичной культуры . . . . . . . . . 52 2.7.2. Эволюция клеточных линий . . . . . . . . . . . . 53 2.7.3. Старение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 2.7.4. Трансформация и развитие постоянных клеточных линий . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Глава 3 СТРУКТУРА, ПЛАНИРОВКА И ОБОРУДОВАНИЕ ЛАБОРАТОРНЫХ ПОМЕЩЕНИЙ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 3.1. Планировка, меблировка и оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 3.1.1. Требования к помещениям . . . . . . . . . . . . . 57 3.1.2. Обслуживание . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60 3.1.3. Вентиляция . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 3.2. Планировка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 3.2.1. Помещение для стерильных манипуляций 61 3.2.2. Ламинарное оборудование . . . . . . . . . . . . . 62 3.2.3. Служебный лабораторный стол . . . . . . . . . 62 3.2.4. Карантин и изоляция . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 3.2.5. Инкубация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 3.2.6. Зона подготовительных работ . . . . . . . . . . . 66 3.2.7. Хранение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67 Глава 4 ОБОРУДОВАНИЕ И МАТЕРИАЛЫ . . . . 70 4.1. Потребности лаборатории культуры ткани . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70 4.2. Асептическая зона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70 4.2.1. Ламинарные шкафы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70 4.2.2. Сервисные тележки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74 4.2.3. Стерильные манипуляции с жидкостями — пипетирование и дозирование . . . . . . . . . . 75 4.2.4. Инвертированный микроскоп . . . . . . . . . . . 79 4.2.5. CCD-камера и монитор . . . . . . . . . . . . . . . . 79 4.2.6. Препаровальная лупа . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79 4.2.7. Центрифуга . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 4.2.8. Подсчет клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 4.3. Инкубация и культура . . . . . . . . . . . . . . . 80 4.3.1. Инкубатор . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 4.3.2. Влажный СО2-инкубатор . . . . . . . . . . . . . . 81 4.3.3. Регистратор температуры . . . . . . . . . . . . . . 83 4.3.4. Роллерные штативы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 4.3.5. Магнитная мешалка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 4.3.6. Культуральные сосуды . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 4.4. Препаративные работы и стерилизация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 4.4.1. Мытье посуды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 4.4.2. Приготовление сред и реактивов . . . . . . . . 84 4.4.3. Стерилизация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86 4.5. Хранение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 4.5.1. Расходные материалы . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
Оглавление 4.5.2. Холодильники и морозильники . . . . . . . . . 88 4.5.3. Контейнеры для криоконсервации . . . . . . . 88 4.5.4. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг с управляемым процессом замораживания 89 4.6. Дополнительное лабораторное оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 4.6.1. Компьютеры и cети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 4.6.2. Прямой микроскоп . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 4.6.3. Низкотемпературный морозильник . . . . . . 89 4.6.4. Конфокальный микроскоп . . . . . . . . . . . . . 90 4.6.5. PCR-термоциклер (ДНК-амплификатор) . . 90 4.7. Специальное оборудование . . . . . . . . . . . 90 4.7.1. Установка для микроинъекций . . . . . . . . . . 90 4.7.2. Счетчик колоний . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 4.7.3. Центрифужный элютриатор . . . . . . . . . . . . 90 4.7.4. Проточный цитометр . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 Глава 5 МЕТОДЫ АСЕПТИКИ . . . . . . . . . . . . . . . 91 5.1. Цели асептики . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 5.1.1. Риск контаминации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 5.1.2. Поддержание стерильности . . . . . . . . . . . . 91 5.2. Элементы асептического окружения . . . 91 5.2.1. Ламинарный поток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92 5.2.2. Стерильная зона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94 5.2.3. Рабочая поверхность . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95 5.2.4. Личная гигиена . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96 5.2.5. Реагенты и среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96 5.2.6. Культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96 5.3. Стерильные манипуляции . . . . . . . . . . . . 97 5.3.1. Протирание поверхностей . . . . . . . . . . . . . . 97 5.3.2. Закрывание емкостей . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 5.3.3. Работа с горелкой . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 5.3.4. Манипуляции с бутылями и колбами . . . . . 97 5.3.5. Пипетирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98 5.3.6. Переливание . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99 5.4. Стандартная процедура . . . . . . . . . . . . . . 99 Протокол 5.1. Асептический метод работы в вертикальном ламинарном потоке . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100 Протокол 5.2. Работа на открытой поверхности . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102 Протокол 5.3. Работа с планшетами и чашками . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103 5.5. Приборы и оборудование . . . . . . . . . . . . . 104 5.5.1. Инкубаторы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 5.5.2. Коробки для влажного инкубатора . . . . . . . 104 5.5.3. Культивирование в атмосфере СО2 . . . . . . . . . 104 Глава 6 БЕЗОПАСНОСТЬ, БИОЭТИКА И ВАЛИДАЦИЯ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 6.1. Лабораторная безопасность . . . . . . . . . . . 105 6.2. Оценка риска . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 6.3. Стандартные рабочие процедуры . . . . . . 107 6.4. Контроль безопасности . . . . . . . . . . . . . . . 107 6.5. Общая безопасность . . . . . . . . . . . . . . . . . 107 6.5.1. Оператор . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108 6.5.2. Оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108 6.5.3. Стеклянные и острые предметы . . . . . . . . . 108 6.5.4. Химическая токсичность . . . . . . . . . . . . . . . 110 6.5.5. Газы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111 6.5.6. Жидкий азот . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111 6.5.7. Ожоги . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111 6.6. Пожар . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112 6.7. Ионизирующее излучение . . . . . . . . . . . . 112 6.7.1. Попадание в организм . . . . . . . . . . . . . . . . . 112 6.7.2. Утилизация радиоактивных отходов . . . . . 112 6.7.3. Излучение от меченых реагентов . . . . . . . . 112 6.7.4. Излучение от высокоэнергетических источников . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113 6.8. Биологическая опасность . . . . . . . . . . . . . 113 6.8.1. Уровни биологической защиты . . . . . . . . . 113 6.8.2. Ламинарные шкафы микробиологической защиты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113 6.8.3. Человеческий биопсийный материал . . . . . 116 6.8.4. Манипуляции с генетическим материалом 119 6.8.5. Уничтожение биологически опасных отходов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 6.8.6. Дезинфекция окуриванием . . . . . . . . . . . . . 120 6.9. Биоэтика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 6.9.1. Ткани животных . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 6.9.2. Ткани человека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 6.10. Обеспечение качества . . . . . . . . . . . . . . . . 121 6.10.1. Процедуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 6.10.2. Контроль качества . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 6.11. Валидация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 6.11.1. Подтверждение аутентичности . . . . . . . . . . 122 6.11.2. Происхождение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 6.11.3. Контаминация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123 Глава 7 ПОСУДА И СУБСТРАТЫ ДЛЯ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ КЛЕТОК . . . . . . . . . . . . . . . 124 7.1. Субстрат . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 7.1.1. Прикрепление и рост клеток . . . . . . . . . . . . 124 7.1.2. Общепринятые материалы для субстрата . 124 7.1.3. Альтернативные субстраты . . . . . . . . . . . . . 124 7.2. Обработка поверхности . . . . . . . . . . . . . . 125 7.2.1. Покрытие матриксом . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125 Протокол 7.1. Приготовление ECM . . . . . 126 7.2.2. Фидерные слои . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126 7.2.3. Неадгезивные субстраты . . . . . . . . . . . . . . . 126 7.3. Выбор культуральных сосудов . . . . . . . . 127 7.3.1. Клеточный выход . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 7.3.2. Суспензионная культура . . . . . . . . . . . . . . . 129 7.3.3. Вентиляция . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 7.3.4. Отбор и анализ проб . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 7.3.5. Неравномерный рост . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 7.3.6. Расходы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 7.4. Специализированные системы . . . . . . . . 133 7.4.1. Проницаемые подложки . . . . . . . . . . . . . . . 133 7.4.2. Трехмерные матриксы . . . . . . . . . . . . . . . . . 134 Глава 8 СРЕДЫ И ДОБАВКИ . . . . . . . . . . . . . . . . 135 8.1. Составление сред . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135 8.2. Физико-химические свойства . . . . . . . . . 135 8.2.1. Значение pH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Оглавление 7 Протокол 8.1. Приготовление стандартных буферных растворов . . . . . . . . . . . 135 8.2.2. CO2 и бикарбонат . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 8.2.3. Буферная система . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137 8.2.4. Кислород . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 8.2.5. Осмотическое давление . . . . . . . . . . . . . . . . 138 8.2.6. Температура . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 8.2.7. Вязкость . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 8.2.8. Поверхностное натяжение и пенообразование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 8.3. Сбалансированные солевые растворы . 142 8.4. Полная среда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 8.4.1. Аминокислоты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 8.4.2. Витамины . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 8.4.3. Соли . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 8.4.4. Глюкоза . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 8.4.5. Органические добавки . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 8.4.6. Гормоны и факторы роста . . . . . . . . . . . . . . 144 8.4.7. Антибиотики . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 8.5. Сыворотка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145 8.5.1. Белки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145 8.5.2. Факторы роста . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145 8.5.3. Гормоны . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 8.5.4. Питательные вещества и метаболиты . . . . 146 8.5.5. Липиды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 8.5.6. Неорганические вещества . . . . . . . . . . . . . . 146 8.5.7. Ингибиторы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 8.6. Выбор среды и сыворотки . . . . . . . . . . . . 146 8.6.1. Резервирование партии сыворотки . . . . . . 147 8.6.2. Тестирование сыворотки . . . . . . . . . . . . . . . 148 8.6.3. Термическая инактивация . . . . . . . . . . . . . . 149 8.7. Другие добавки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.7.1. Гидролизаты аминокислот . . . . . . . . . . . . . 149 8.7.2. Эмбриональный экстракт . . . . . . . . . . . . . . 149 8.7.3. Кондиционированная среда . . . . . . . . . . . . 149 Глава 9 БЕССЫВОРОТОЧНЫЕ СРЕДЫ . . . . . . . 150 9.1. Недостатки сыворотки . . . . . . . . . . . . . . . 150 9.2. Преимущества бессывороточных сред . 154 9.2.1. Определение стандартной среды . . . . . . . . 154 9.2.2. Селективные среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 9.2.3. Регуляция пролиферации и дифференцировки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 9.3. Недостатки бессывороточных сред . . . . 156 9.4. Замена сыворотки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 9.4.1. Коммерчески доступные бессывороточные среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 9.4.2. Заменители сыворотки . . . . . . . . . . . . . . . . 156 9.4.3. Бессывороточная субкультура . . . . . . . . . . 157 9.4.4. Гормоны . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 9.4.5. Факторы роста . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158 9.4.6. Питательные вещества сыворотки . . . . . . . 158 9.4.7. Белки и полиамины . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158 9.4.8. Вязкость . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158 9.5. Выбор бессывороточной среды . . . . . . . . 158 9.5.1. Специфичность клеток или продукта . . . . 158 9.5.2. Адаптация клеток к бессывороточной среде . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165 9.6. Разработка бессывороточной среды . . . . 165 9.7. Приготовление бессывороточной среды 165 9.8. Среда, не содержащая животных белков . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166 9.9. Заключение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166 Глава 10 ПОДГОТОВИТЕЛЬНЫЕ РАБОТЫ И СТЕРИЛИЗАЦИЯ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167 10.1. Приготовление реактивов и материалов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167 10.2. Стерилизация оборудования и жидкостей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167 10.3. Оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168 10.3.1. Стеклянная посуда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168 Протокол 10.1. Подготовка и стерилизация изделий из стекла . . . . . . . . . . . . . . 169 10.3.2. Стеклянные пипетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 Протокол 10.2. Подготовка и стерилизация стеклянных пипеток . . . . . . . . . . . . 173 10.3.3. Завинчивающиеся крышки . . . . . . . . . . . . . 175 Протокол 10.3. Подготовка и стерилизация завинчивающихся крышек . . . . . . . . 175 10.3.4. Выбор детергента . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 10.3.5. Прочее оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177 10.3.6. Стерилизационные фильтры многократного использования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177 Протокол 10.4. Стерилизация комплекта фильтров . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 178 10.4. Реагенты и среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 178 10.4.1. Вода . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 178 Протокол 10.5. Приготовление и стерилизация сверхчистой воды (UPW) . . . . . . 179 10.4.2. Техническое обслуживание водоочистительной установки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180 10.4.3. Сбалансированный солевой раствор (BSS) 180 Протокол 10.6. Приготовление и стерилизация D-PBSA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181 10.4.4. Приготовление и стерилизация среды . . . . 181 Протокол 10.7. Приготовление среды из концентрата с кратностью 1× . . . 182 Протокол 10.8. Приготовление среды из концентрата с кратностью 10× . . 182 10.4.5. Порошкообразные среды . . . . . . . . . . . . . . . 184 Протокол 10.9. Приготовление среды из порошка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184 10.4.6. Специализированная среда . . . . . . . . . . . . . 184 Протокол 10.10. Приготовление специализированной среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . 185 10.5. Стерилизация среды . . . . . . . . . . . . . . . . . 185 10.5.1. Автоклавируемые среды . . . . . . . . . . . . . . . 185 10.5.2. Стерилизация методом фильтрации . . . . . . 185 Протокол 10.11. Стерилизация с использованием фильтрующих насадок на шприцы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 186 Протокол 10.12. Стерилизация с использованием фильтрующей вакуумной насадки на колбу . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188
Оглавление Протокол 10.13. Стерилизация с использованием малого встроенного фильтра . 189 Протокол 10.14. Стерилизационная фильтрация с использованием большого прямоточного фильтра . . . . . . . . . . . . . . . . 190 10.5.3. Сыворотка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192 Протокол 10.15. Сбор и стерилизация сывороток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192 Протокол 10.16. Диализ сывороток . . . . . 194 10.5.4. Приготовление и стерилизация других реагентов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196 10.6. Контроль, проверка качества и хранение сред . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196 10.6.1. Контроль качества . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196 10.6.2. Проверка стерильности . . . . . . . . . . . . . . . . 196 10.6.3. Проверка культуральных свойств . . . . . . . . 197 10.6.4. Хранение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 198 Глава 11 ПЕРВИЧНАЯ КУЛЬТУРА . . . . . . . . . . . . . 199 11.1. Инициация первичной культуры клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199 11.1.1. Ферменты, используемые для дезагрегации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199 11.1.2. Общие характеристики дезагрегации . . . . 199 11.2. Выделение образцов ткани . . . . . . . . . . . . 200 11.2.1. Мышиный эмбрион . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201 Протокол 11.1. Выделение мышиного эмбриона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201 11.2.2. Куриный эмбрион . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 204 Протокол 11.2. Выделение куриного эмбриона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 204 11.2.3. Биопсийный материал человека . . . . . . . . . 204 Протокол 11.3. Передача и получение биопсийного материала человека . . . . . . . 206 11.3. Типы первичной культуры . . . . . . . . . . . 206 11.3.1. Первичный эксплантат . . . . . . . . . . . . . . . . 206 Протокол 11.4. Первичные эксплантаты . 206 11.3.2. Ферментативная дезагрегация . . . . . . . . . . 208 11.3.3. Теплый трипсин . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209 Протокол 11.5. Дезагрегация ткани теплым трипсином . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209 11.3.4. Трипсинизация с преинкубацией на холоде . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212 Протокол 11.6. Дезагрегация ткани в холодном трипсине . . . . . . . . . . . . . . . . . . 212 11.3.5. Рудиментарные органы куриного эмбриона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213 Протокол 11.7. Рудиментарные органы куриного эмбриона . . . . . . . . . . . . . . . . . 213 11.3.6. Дезагрегация с использованием других ферментов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215 11.3.7. Коллагеназа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215 Протокол 11.8. Дезагрегация ткани с помощью коллагеназы . . . . . . . . . . . . . . . . 215 11.3.8. Механическая дезагрегация . . . . . . . . . . . . 219 Протокол 11.9. Механическая дезагрегация ткани путем просеивания . . . . . . . 220 11.3.9. Разделение жизнеспособных и нежизнеспособных клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 220 Протокол 11.10. Обогащение доли жизнеспособных клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . 220 11.3.10. Первичная культура, краткие выводы . . . . 222 11.3.11. Первичная документация . . . . . . . . . . . . . . 222 Глава 12 СУБКУЛЬТУРА И КЛЕТОЧНЫЕ ЛИНИИ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 223 12.1. Субкультивирование . . . . . . . . . . . . . . . . . 223 12.1.1. Перекрестная контаминация и неправильная идентификация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 223 12.1.2. Микоплазменная контаминация . . . . . . . . . 227 12.1.3. Терминология . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 228 12.1.4. Маркировка клеточной культуры . . . . . . . . 228 12.1.5. Возраст культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229 12.2. Выбор клеточной линии . . . . . . . . . . . . . . 229 12.3. Обычный порядок поддержания культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 230 12.3.1. Значение клеточной морфологии . . . . . . . . 230 12.3.2. Замена среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231 12.3.3. Стандартный протокол замены среды . . . . 232 Протокол 12.1. Питание монослойной культуры во флаконах . . . . . . . . . . . . . . 232 Протокол 12.2. Питание монослойной культуры в чашках и планшетах . . . . . 233 12.4. Субкультивирование . . . . . . . . . . . . . . . . . 233 12.4.1. Критерии субкультивирования . . . . . . . . . . 234 12.4.2. Стандартный протокол субкультивирования клеток, образующих монослой . . . . . . . . . . 236 Протокол 12.3. Субкультивирование клеток, образующих монослой . . . . . . . . . . 236 12.4.3. Цикл роста и индекс разведения . . . . . . . . 238 12.4.4. Концентрация клеток в субкультуре . . . . . 239 12.4.5. Размножение в суспензии . . . . . . . . . . . . . . 239 12.4.6. Субкультивирование клеток, растущих в суспензии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240 Протокол 12.4. Суспензионное субкультивирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240 12.4.7. Стандартизация условий культивирования 241 12.4.8. Использование антибиотиков . . . . . . . . . . . 242 12.4.9. Ведение документации . . . . . . . . . . . . . . . . 242 Глава 13 КЛОНИРОВАНИЕ И СЕЛЕКЦИЯ . . . . . 244 13.1. Клонирование клеток . . . . . . . . . . . . . . . . 244 Протокол 13.1. Клонирование с разведением . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245 13.2. Стимуляция эффективности посева . . . 247 13.2.1. Условия, которые улучшают клональный рост . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248 13.2.2. Кондиционированные среды . . . . . . . . . . . . 249 Протокол 13.2. Приготовление кондиционированной среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . 249 13.2.3. Фидерные слои . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 Протокол 13.3. Приготовление фидерных слоев . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 13.3. Суспензионное клонирование . . . . . . . . . 251
Оглавление 9 Протокол 13.4. Клонирование в агаре . . . . 251 Протокол 13.5. Клонирование в Methocel . 252 13.4. Выделение клонов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 255 Протокол 13.6. Выделение клонов с использованием колец для клонирования . . . . . 255 Протокол 13.7. Выделение клеточных колоний путем облучения . . . . . . . . . . . . . 257 13.4.1. Другие методы выделения монослойных клонов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257 13.4.2. Суспензионные клоны . . . . . . . . . . . . . . . . . 257 Протокол 13.8. Выделение суспензионных клонов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257 13.5. Получение репликативных колоний . . . 258 13.6. Селективные ингибиторы . . . . . . . . . . . . 259 13.7. Выделение генетических вариантов . . . 259 Протокол 13.9. Метотрексат-резистентность и DHFR-амплификация . . . . . . . . 259 13.8. Взаимодействие с субстратом . . . . . . . . . 261 13.8.1. Селективная адгезия . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261 13.8.2. Селективное открепление . . . . . . . . . . . . . . 261 13.8.3. Природа субстрата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261 13.8.4. Селективные фидерные слои . . . . . . . . . . . 261 13.8.5. Селекция на полужидкой среде . . . . . . . . . 261 Глава 14 РАЗДЕЛЕНИЕ КЛЕТОК . . . . . . . . . . . . . . 263 14.1. Плотность клеток и изопикническая седиментация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263 Протокол 14.1. Разделение клеток центрифугированием в градиенте плотности 263 14.2. Размер клеток и скорость седиментации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 266 14.2.1. Гравитационная седиментация . . . . . . . . . . 266 14.2.2. Элютриация центрифугированием . . . . . . . 266 14.3. Методы, основанные на применении антител . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 266 14.3.1. Иммунный пэннинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267 14.3.2. Магнитный сортинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268 Протокол 14.2. Магнитно-активированный клеточный сортинг (MACS) . . . . . . . . . 269 14.4. Флуоресцентно-активируемый клеточный сортинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270 14.5. Другие методы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 272 14.6. Подходы для начинающих к освоению клеточного сортинга . . . . . . . . . . . . . . . . . 273 Глава 15 ХАРАКТЕРИСТИКА КЛЕТОК . . . . . . . . 274 15.1. Необходимость характеристики . . . . . . . 274 15.2. Аутентификация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 274 15.3. Ведение документации и происхождение клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275 15.4. Параметры характеристики . . . . . . . . . . 275 15.4.1. Видовая идентификация . . . . . . . . . . . . . . . 275 15.4.2. Происхождение тканевых маркеров . . . . . . 276 15.4.3. Уникальные маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . 277 15.4.4. Трансформация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278 15.5. Морфология клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278 15.5.1. Микроскопия . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 284 Протокол 15.1. Использование инвертированного микроскопа . . . . . . . . . . . . . . . . 284 15.5.2. Окрашивание . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285 Протокол 15.2. Окрашивание по Гимзе . . . 285 Протокол 15.3. Окрашивание кристаллвиолетом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286 15.5.3. Культуральные сосуды для цитологии: монослойные культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286 15.5.4. Приготовление суспензионной культуры для цитологии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286 Протокол 15.4. Подготовка суспензионной культуры клеток для цитологических исследований методом цитоцентрифугирования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287 Протокол 15.5. Фильтрационная цитология . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288 15.5.5. Микрофотография . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288 Протокол 15.6. Цифровая фотография на микроскопе . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 289 15.6. Конфокальная микроскопия . . . . . . . . . . 289 15.7. Хромосомный состав . . . . . . . . . . . . . . . . . 290 Протокол 15.7. Приготовление хромосомного препарата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 290 15.7.1. Дифференциальное окрашивание хромосом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292 15.7.2. Хромосомный анализ . . . . . . . . . . . . . . . . . 293 15.8. Анализ ДНК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293 15.8.1. Гибридизация ДНК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293 15.8.2. Фингерпринтинг ДНК . . . . . . . . . . . . . . . . . 293 15.8.3. Анализ профиля ДНК . . . . . . . . . . . . . . . . . 294 Протокол 15.8. Анализ STR-профиля ДНК клеточных линий . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296 15.9. Рнк и экспрессия белка . . . . . . . . . . . . . . . 298 15.10. Активность ферментов . . . . . . . . . . . . . . . 298 15.10.1. Изоферменты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298 15.10.2. Изоферментный электрофорез с набором для определения аутентичности Authentikit . . . 300 Протокол 15.9. Изоферментный анализ . . 300 15.11. Антигенные маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . 303 15.11.1. Иммунное окрашивание . . . . . . . . . . . . . . . 304 Протокол 15.10. Непрямая иммунофлуоресценция . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304 15.11.2. Иммунный анализ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 305 15.12. Дифференцировка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306 Глава 16 ДИФФЕРЕНЦИРОВКА . . . . . . . . . . . . . . . 307 16.1. Экспрессия фенотипа in vivo . . . . . . . . . . 307 16.1.1. Дедифференцировка . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307 16.1.2. Линейная селекция . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307 16.2. Стадии дифференцировки . . . . . . . . . . . . 307 16.3. Пролиферация и дифференцировка . . . . 308 16.4. Коммитирование и линии дифференцировки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 308 16.5. Пластичность стволовых клеток . . . . . . 309 16.6. Маркеры дифференцировки . . . . . . . . . . 310 16.7. Индукция дифференцировки . . . . . . . . . . 311 16.7.1. Межклеточные взаимодействия . . . . . . . . . 311
Оглавление 16.7.2. Системные факторы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313 16.7.3. Взаимодействия клетки с матриксом . . . . . 315 16.7.4. Полярность и форма клетки . . . . . . . . . . . . 316 16.7.5. Давление кислорода . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316 16.8. Дифференцировка и злокачественность 317 16.9. Практические аспекты . . . . . . . . . . . . . . . 317 Глава 17 ТРАНСФОРМАЦИЯ И ИММОРТАЛИЗАЦИЯ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318 17.1. Роль в характеристике клеточных линий . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318 17.2. Что такое трансформация? . . . . . . . . . . . 318 17.3. Генетическая нестабильность и гетерогенность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318 17.3.1. Генетическая нестабильность . . . . . . . . . . . 318 17.3.2. Хромосомные аберрации . . . . . . . . . . . . . . . 320 17.4. Иммортализация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321 17.4.1. Контроль физиологического старения . . . . 322 17.4.2. Иммортализация с использованием вирусных генов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322 17.4.3. Иммортализация человеческих фибробластов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 323 Протокол 17.1. Иммортализация фибробластов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324 17.4.4. Теломеразоиндуцированная иммортализация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326 Протокол 17.2. Иммортализация мезенхимальных стволовых клеток человека с помощью теломеразы . . . . . . . . . . . . . 327 17.4.5. Иммортализация лимфоцитов . . . . . . . . . . 329 17.4.6. Трансгенные мыши . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329 17.5. Аберрантный контроль роста . . . . . . . . . 329 17.5.1. Независимость от прикрепления к субстрату . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329 17.5.2. Контактное ингибирование . . . . . . . . . . . . . 330 Протокол 17.3. Ограничение клеточной пролиферации плотностью суспензии . 330 17.5.3. Зависимость от сыворотки . . . . . . . . . . . . . 331 17.5.4. Онкогены . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332 17.6. Туморогенность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332 17.6.1. Малигнизация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332 17.6.2. Опухолевая трансплантация . . . . . . . . . . . . 333 17.6.3. Инвазивность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333 17.6.4. Ангиогенез . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334 Протокол 17.4. Исследование ангиогенеза in vitro . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335 17.6.5. Активатор плазминогена . . . . . . . . . . . . . . . 337 Глава 18 КОНТАМИНАЦИЯ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338 18.1. Источники контаминации . . . . . . . . . . . . 338 18.1.1. Техника работы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338 18.1.2. Окружающая среда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338 18.1.3. Использование и обслуживание ламинарного шкафа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338 18.1.4. Инкубаторы с увлажнением . . . . . . . . . . . . 341 Протокол 18.1. Обработка инкубаторов . 341 18.1.5. Холодильные камеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342 18.1.6. Стерильные материалы . . . . . . . . . . . . . . . . 342 18.1.7. Доставленные клеточные линии и образцы биопсии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342 18.1.8. Карантин . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342 18.2. Виды микробной контаминации . . . . . . 342 18.3. Контроль контаминации . . . . . . . . . . . . . 342 18.3.1. Визуально определяемая микробная контаминация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343 18.3.2. Микоплазмы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343 18.3.3. Флуоресцентное окрашивание микоплазм 345 Протокол 18.2. Выявление микоплазм методом флуоресценции . . . . . . . . . . . . . . 345 18.3.4. Использование PCR для обнаружения микоплазм . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346 Протокол 18.3. Использование PCR для обнаружения микоплазм . . . . . . . . . . . . . . 346 18.3.5. Альтернативные методы детекции микоплазм . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348 18.3.6. Сервисные службы по обнаружению микоплазм . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350 18.3.7. Вирусная контаминация . . . . . . . . . . . . . . . 350 18.4. Уничтожение контаминированных культур . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350 18.5. Устранение контаминации . . . . . . . . . . . . 350 18.5.1. Бактерии, грибы и дрожжи . . . . . . . . . . . . . 350 Протокол 18.4. Устранение микробной контаминации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350 18.5.2. Устранение микоплазм . . . . . . . . . . . . . . . . 351 Протокол 18.5. Устранение микоплазменной контаминации . . . . . . . . . . . . . . . . . 351 18.5.3. Устранение вирусной контаминации . . . . . 352 18.5.4. Персистирующая контаминация . . . . . . . . 352 18.6. Перекрестная контаминация . . . . . . . . . 354 18.7. Заключение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354 Глава 19 КРИОКОНСЕРВАЦИЯ . . . . . . . . . . . . . . . 355 19.1. Предпосылки метода замораживания . . 355 19.2. Подготовка к криоконсервации . . . . . . . 355 19.2.1. Валидация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356 19.2.2. Когда нужно замораживать . . . . . . . . . . . . . 356 19.3. Принципы криоконсервации . . . . . . . . . 356 19.3.1. Теоретическое обоснование замораживания клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356 19.3.2. Концентрация клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356 19.3.3. Среда для замораживания . . . . . . . . . . . . . . 356 19.3.4. Скорость охлаждения . . . . . . . . . . . . . . . . . 357 19.3.5. Ампулы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 359 19.3.6. Криоморозильники . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 359 19.3.7. Замораживание культивируемых клеток . . 362 Протокол 19.1. Замораживание клеток . . 362 19.3.8. Протоколирование работы морозильника . 364 19.3.9. Размораживание хранившихся ампул . . . . 364 Протокол 19.2. Размораживание клеток . 364 19.3.10. Флаконы для замораживания . . . . . . . . . . . 367 19.4. Витрификация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 367 19.4.1. Криоконсервация эмбриональных стволовых клеток человека (hES) . . . . . . . . . . . . . 367 Протокол 19.3. Криоконсервация hESклеток путем витрификации . . . . . . . . 367
Оглавление 11 19.4.2. Размораживание hES-клеток . . . . . . . . . . . . 368 Протокол 19.4. Размораживание hESклеток, криоконсервированных путем витрификации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 368 19.5. Дизайн и контроль замороженных запасов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 369 19.5.1. Инвентарный контроль морозильника . . . . 369 19.5.2. Периодическая замена запасов культур . . . 370 19.6. Банки клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 370 19.7. Транспортировка клеточных культур . . 371 19.7.1. Замороженные ампулы . . . . . . . . . . . . . . . . 371 19.7.2. Живые культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 371 Глава 20 КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ АНАЛИЗ . . . . . . . 373 20.1. Подсчет клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 373 20.1.1. Гемоцитометр . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 374 Протокол 20.1. Подсчет клеток при помощи гемоцитометра . . . . . . . . . . . . . . 374 20.1.2. Электронный счетчик . . . . . . . . . . . . . . . . . 377 Протокол 20.2. Электронный подсчет клеток на основе электрического сопротивления . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 378 20.1.3. Окрашенные монослои . . . . . . . . . . . . . . . . 380 20.1.4. Проточная цитометрия . . . . . . . . . . . . . . . . 380 20.2. Вес клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 381 20.3. Содержание ДНК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 382 Протокол 20.3. Оценка содержания ДНК с использованием красителя Hoechst 33258 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 382 20.4. Белок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 382 20.4.1. Солюбилизация образца . . . . . . . . . . . . . . . 382 20.4.2. Метод исследования белка по Брэдфорду . 382 Протокол 20.4. Оценка содержания белка методом Брэдфорда . . . . . . . . . . . . . . . . 382 20.5. Скорость синтеза . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 384 20.5.1. Синтез ДНК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 384 Протокол 20.5. Оценка уровня синтеза ДНК методом включения [3Н]-тимидиновой метки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 384 20.5.2. Синтез белка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 385 Протокол 20.6. Синтез белка . . . . . . . . . . . 385 20.6. Приготовление образцов для ферментного и иммуноферментного анализа . . . 386 20.7. Цитометрия . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 386 20.7.1. Мечение in situ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 386 20.7.2. Проточная цитометрия . . . . . . . . . . . . . . . . 386 20.8. Репликация образцов . . . . . . . . . . . . . . . . 386 20.8.1. Сбор данных . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 387 20.8.2. Анализ данных . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 387 20.9. Клеточная пролиферация . . . . . . . . . . . . . 387 20.9.1. Разработка эксперимента . . . . . . . . . . . . . . 387 20.9.2. Цикл роста . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 389 Протокол 20.7. Кривая роста монослоя во флаконах . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 391 Протокол 20.8. Кривая роста монослоя в многолуночном планшете . . . . . . . . . . 391 20.9.3. Анализ кривых роста монослоя . . . . . . . . . 392 20.9.4. Объем среды, концентрация и плотность клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 393 20.9.5. Суспензионные культуры . . . . . . . . . . . . . . 394 Протокол 20.9. Кривая роста суспензионной культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 394 20.9.6. Фазы цикла роста . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 394 20.9.7. Производные кривой роста . . . . . . . . . . . . . 395 20.10. Эффективность культивирования . . . . . 396 Протокол 20.10. Определение эффективности посева на чашки Петри . . . . . . . 397 20.10.1. Анализ формирования колоний . . . . . . . . . 399 20.10.2. Автоматический счетчик колоний . . . . . 399 20.11. Индекс мечения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 399 Протокол 20.11. Индекс мечения [3Н]-тими ди ном . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 400 20.11.1. Ростовая фракция . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 401 Протокол 20.12. Определение фракции пролиферирующих клеток . . . . . . . . . . . . . . 401 20.11.2. Митотический индекс . . . . . . . . . . . . . . . . . 401 20.11.3. Индекс пролиферации . . . . . . . . . . . . . . . . 401 20.12. Время клеточного цикла . . . . . . . . . . . . . 402 20.13. Миграция клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 402 Глава 21 ЦИТОТОКСИЧНОСТЬ . . . . . . . . . . . . . . . 403 21.1. Жизнеспособность, токсичность и выживаемость . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 403 21.2. Ограничения in vitro . . . . . . . . . . . . . . . . . 404 21.2.1. Фармакокинетика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 404 21.2.2. Метаболизм . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 404 21.2.3. Тканевой и системный ответы . . . . . . . . . . 404 21.3. Характер исследований . . . . . . . . . . . . . . 404 21.3.1. Жизнеспособность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 405 Протокол 21.1. Оценка жизнеспособности методом отторжения красителя . . . . 405 Протокол 21.2. Оценка жизнеспособности методом поглощения красителя . . . . . 405 21.3.2. Выживаемость . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 406 Протокол 21.3. Клоногенный анализ прикрепленных клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . 406 21.3.3. Анализ, основанный на клеточной пролиферации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 410 21.3.4. Метаболический анализ цитотоксичности 410 21.3.5. Микротитрационный анализ . . . . . . . . . . . . 410 Протокол 21.4. Оценка цитотоксичности при помощи МТТ-теста . . . . . . . . . . . . 411 21.3.6. Сравнительная оценка микротитрационного и клоногенного анализа выживания . . . . . . 414 21.3.7. Взаимодействие лекарственных препаратов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 415 21.4. Применение исследования цитотоксичности . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 415 22.4.1. Скрининг противораковых препаратов . . . 415 21.4.2. Прогностические исследования противоопухолевых препаратов . . . . . . . . . . . . . . . . 415 21.4.3. Фармацевтическое тестирование . . . . . . . . 416 21.5. Генотоксичность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 416
Оглавление 21.5.1. Анализ мутагенеза методом обмена сестринских хроматид . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 416 Протокол 21.5. Обмен сестринских хроматид . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 416 21.5.2. Канцерогенность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 418 21.6. Воспаление . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 419 Глава 22 КУЛЬТУРЫ СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫХ КЛЕТОК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 420 22.1. Клеточные культуры специализированных клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 420 22.2. Эпителиальные клетки . . . . . . . . . . . . . . 422 22.2.1. Эпидермис . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 423 Протокол 22.1. Эпидермальные кератиноциты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 424 22.2.2. Роговица . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 427 Протокол 22.2. Эпителиальные клетки роговицы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 427 22.2.3. Молочная железа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 429 Протокол 22.3. Получение эпителиальных клеток молочной железы из тканей, отобранных при маммопластике . . . . . 429 22.2.4. Шейка матки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 431 Протокол 22.4. Цервикальный эпителий . 431 22.2.5. Желудочно-кишечный тракт . . . . . . . . . . . . 433 Протокол 22.5. Выделение и культивирование клеток крипт толстого кишечника . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 433 22.2.6. Печень . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 434 22.2.7. Первичная культура гепатоцитов . . . . . . . . 434 Протокол 22.6 А. Выделение гепатоцитов крысы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 435 22.2.8. Гепатоциты человека HepaRG . . . . . . . . . . 436 Протокол 22.6 Б. Очистка гепатоцитов человека HepaRG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 437 22.2.9. Поджелудочная железа . . . . . . . . . . . . . . . . 438 Протокол 22.7. Эпителий поджелудочной железы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 438 22.2.10. Почка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 439 Протокол 22.8. Эпителий почки . . . . . . . . 440 22.2.11. Бронхиальный и трахеальный эпителий . . 441 Протокол 22.9. Бронхиальный и трахеальный эпителий . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 441 22.2.12. Эпителий ротовой полости . . . . . . . . . . . . . 442 Протокол 22.10. Кератиноциты ротовой полости . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 442 22.2.13. Простата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 443 Протокол 22.11. Эпителий простаты . . . 444 22.3. Мезенхимальные клетки . . . . . . . . . . . . . 445 22.3.1. Соединительная ткань . . . . . . . . . . . . . . . . . 445 22.3.2. Жировая ткань . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 445 Протокол 22.12. Первичная культура адипоцитов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 446 22.3.3. Мышцы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 447 Протокол 22.13. Выделение и культивирование гладкомышечных клеток . . . . . . . 447 Протокол 22.14. Культура миобластов взрослой скелетной мышцы . . . . . . . . . 448 Протокол 22.15. Культура отдельного мышечного волокна скелетной мышцы 450 22.3.4. Хрящи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 451 Протокол 22.16. Хондроциты на альгинатных бусинах . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 451 22.3.5. Кости . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 453 Протокол 22.17. Остеобласты . . . . . . . . . 454 22.3.6. Эндотелий . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 455 Протокол 22.18. Выделение и культивирование клеток сосудистого эндотелия . 455 22.4. Нейроэктодермальные клетки . . . . . . . . 459 22.4.1. Нейроны . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 459 Протокол 22.19. Выделение и культивирование тучных клеток мозжечка . . . . . . 459 22.4.2. Глиальные клетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 460 Протокол 22.20. Первичная культура астроцитов человека . . . . . . . . . . . . . . . 461 Протокол 22.21. Обонятельные клетки . . 463 22.4.3. Эндокринные клетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . 465 22.4.4. Меланоциты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 465 Протокол 22.22. Культура меланоцитов . 466 22.5. Гематопоэтические клетки . . . . . . . . . . . . 467 22.6. Гонады . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 469 22.6.1. Яичники . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 469 22.6.2. Тестикулы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 469 Глава 23 СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ, ГАМЕТЫ И АМНИОЦИТЫ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 470 23.1. Стволовые клетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 470 23.1.1. Эмбриональные стволовые клетки . . . . . . . 470 23.1.2. Происхождение эмбриональных стволовых клеток мыши . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 470 Протокол 23.1. Получение и первичное культивирование эмбриональных стволовых клеток мыши . . . . . . . . . . . . . . . . 471 23.1.3. Субкультура и размножение эмбриональных стволовых клеток мыши . . . . . . . . . . . . . . . 474 Протокол 23.2. Размножение эмбриональных стволовых клеточных линий мыши . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 474 23.1.4. Первичная культура эмбриональных стволовых клеток человека . . . . . . . . . . . . . . . . 476 Протокол 23.3. Получение эмбриональных стволовых клеток человека . . . . . . . . . . 476 23.1.5. Пересадка hES-клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . 477 Протокол 23.4. Пересадка hES-клеток . . . 477 23.1.6. Плюрипотентные стволовые клетки из эмбрионов рыбы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 478 Протокол 23.5. Культуры клеток эмбриона данио-рерио . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 479 23.2. Половые клетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 481 23.3. Экстраэмбриональные клетки . . . . . . . . 481 23.3.1. Культура амниоцитов . . . . . . . . . . . . . . . . . . 481 Протокол 23.6. Культура амниоцитов . . . 482 23.3.2. Неонатальные и ювенильные клетки . . . . . 485 23.3.3. Мультипотентные стволовые клетки взрослых . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 485 23.3.4. MSC из костного мозга человека . . . . . . . . 486
Оглавление 13 Протокол 23.7. Получение MSC из костного мозга человека . . . . . . . . . . . . . . . . 487 23.3.5. Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 488 Протокол 23.8. Перепрограммирование человеческих дермальных фибробластов для генерации плюрипотентных стволовых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 489 23.3.6. Долгоживущие культуры костного мозга мыши . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 491 Протокол 23.9. Долгоживущие гематопоэтические клеточные культуры из костного мозга мыши . . . . . . . . . . . . . . . . . . 491 23.3.7. Долгоживущие культуры человеческих примитивных гематопоэтических клеток . . . . 493 Протокол 23.10. Исследование инициирующих долгоживущую культуру человеческих клеток (LTC-IC) . . . . . . . . . . . . . . . 493 23.3.8. Исследование гематопоэтических колониеобразующих клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 496 Протокол 23.11. Исследование гематопоэтических колониеобразующих клеток . 496 Глава 24 КУЛЬТУРА ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТОК . . 499 24.1. Проблемы культивирования опухолевых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 499 24.2. Получение образцов . . . . . . . . . . . . . . . . . . 500 24.2.1. Селекция репрезентативных клеток . . . . . . 500 24.2.2. Сохранение тканей замораживанием . . . . . 500 Протокол 24.1. Замораживание образцов биопсии . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 500 24.3. Дезагрегация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 501 24.4. Первичная культура . . . . . . . . . . . . . . . . . 501 24.5. Селективная культура опухолевых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 502 24.5.1. Селективные среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 502 24.5.2. Конфлюэнтные фидерные слои . . . . . . . . . 502 Протокол 24.2. Рост на конфлюэнтных фидерных слоях . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 503 24.5.3. Суспензионное клонирование . . . . . . . . . . 505 24.5.4. Ксенотрансплантаты . . . . . . . . . . . . . . . . . . 505 24.6. Размножение клеточных линий . . . . . . . 505 24.6.1. Субкультивирование первичной опухолевой культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 505 24.6.2. Постоянные клеточные линии . . . . . . . . . . 506 24.7. Характеристика культур опухолевых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 506 24.7.1. Гетерогенность опухолевых культур . . . . . 506 24.7.2. Гистотипическая культура . . . . . . . . . . . . . . 507 24.8. Специфические опухолевые культуры . 507 24.8.1. Молочная железа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 507 Протокол 24.3. Культивирование клеток опухоли молочной железы . . . . . . . . . . . 508 24.8.2. Легкое . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 509 24.8.3. Желудок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 509 24.8.4. Толстый кишечник . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 509 Протокол 24.4. Культура колоректальных опухолей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 510 24.8.5. Поджелудочная железа . . . . . . . . . . . . . . . . 512 24.8.6. Яичники . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 512 24.8.7. Простата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 513 24.8.8. Мочевой пузырь . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 513 24.8.9. Кожа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 513 24.8.10. Шейка матки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 513 24.8.11. Глиома . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 514 24.8.12. Нейробластома . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 514 24.8.13. Сперматоцитома . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 514 24.8.14. Лимфома и лейкемия . . . . . . . . . . . . . . . . . . 514 Протокол 24.5. Определение постоянных клеточных линий лейкемии и лимфомы 515 Глава 25 ТРЕХМЕРНАЯ КУЛЬТУРА . . . . . . . . . . . 516 25.1. Межклеточное взаимодействие и фенотипическая экспрессия . . . . . . . . . . . . . . . 516 25.1.1. Роль плотности клеточной суспензии . . . . 516 25.1.2. Реципрокные взаимодействия . . . . . . . . . . 516 25.1.3. Выбор моделей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 517 25.2. Органная культура . . . . . . . . . . . . . . . . . . 517 25.2.1. Обмен питательных веществ и газов . . . . . 517 25.2.2. Структурная целостность . . . . . . . . . . . . . . 519 25.2.3. Рост и дифференцировка . . . . . . . . . . . . . . . 519 25.2.4. Ограничения метода органной культуры . . 519 25.2.5. Типы органных культур . . . . . . . . . . . . . . . . 520 Протокол 25.1. Органная культура . . . . . . 520 25.3. Гистотипическая культура . . . . . . . . . . . . 521 25.3.1. Метод геля и губки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 521 25.3.2. Полые волокна . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 522 25.3.3. Сфероиды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 522 Протокол 25.2. 3D-культуры в сфероидах 523 25.3.4. Система вращающихся камер . . . . . . . . . . . 525 25.3.5. Иммобилизация живых клеток в альгинате . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 525 25.3.6. Фильтрационные вкладыши для лунок . . . 526 Протокол 25.3. Фильтрационные вкладыши для лунок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 526 25.3.7. Культуры нейрональных агрегатов . . . . . . . 528 Протокол 25.4. Нейрональные агрегаты . 528 25.4. Органотипическая культура . . . . . . . . . . 529 25.4.1. Тканевые эквиваленты . . . . . . . . . . . . . . . . . 529 25.4.2. Тканевая инженерия . . . . . . . . . . . . . . . . . . 529 25.5. Создание трехмерных изображений клеток (3D-реконструкций) . . . . . . . . . . . . . . 531 Глава 26 УВЕЛИЧЕНИЕ ПРОИЗВОДСТВА КЛЕТОК И АВТОМАТИЗАЦИЯ . . . . . . . . . . . . . . . . 532 26.1. Увеличение производства суспензионных культур . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 532 Протокол 26.1. Перемешивание 4-литровой партии суспензионной культуры . . . . . 533 26.1.1. Постоянная культура . . . . . . . . . . . . . . . . . . 535 26.1.2. Масштаб и сложности . . . . . . . . . . . . . . . . . 536 26.1.3. Перемешивание и аэрация . . . . . . . . . . . . . 536 26.2. Крупномасштабное производство монослойных культур . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 539 26.2.1. Мультиповерхностные культиваторы . . . . 539
Оглавление Протокол 26.2. Система Nunc Cell Factory . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 539 26.2.2. Роллерные культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . 542 Протокол 26.3. Культура в роллерных бутылях . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 542 26.2.3. Микроносители . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 544 Протокол 26.4. Микроносители . . . . . . . . . 544 26.2.4. Крупные микроносители . . . . . . . . . . . . . . . 546 26.2.5. Перфузионные монослойные культуры . . . 546 26.3. Управление процессом . . . . . . . . . . . . . . . 547 26.4. Автоматизация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 549 26.4.1. Роботизированная система культуры клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 550 26.4.2. Высокопроизводительный скрининг . . . . . 550 Глава 27 СПЕЦИАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ . . . . . . . . . . 551 27.1. Методы подготовки и исследования лимфоцитов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 551 27.1.1. Выделение по плотности . . . . . . . . . . . . . . . 551 Протокол 27.1. Подготовка препарата лимфоцитов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 551 27.1.2. Бласттрансформация . . . . . . . . . . . . . . . . . . 552 Протокол 27.2. РНА-стимуляция лимфоцитов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 552 27.2. Авторадиография . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 552 Протокол 27.3. Микроавторадиография . 554 27.3. Съемка в режиме замедленного времени . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 557 Протокол 27.4. Видеосъемка в режиме замедленного времени . . . . . . . . . . . . . . . . 557 27.4. Синхронизация клеток . . . . . . . . . . . . . . . 559 27.4.1. Разделение клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 559 27.4.2. Блокирование пролиферации . . . . . . . . . . . 559 27.5. Культуры клеток пойкилотермных животных . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 559 27.5.1. Клетки рыб . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 560 27.5.2. Клетки насекомых . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 560 Протокол 27.5. Культивирование клеток насекомых . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 560 27.6. СЛИЯНИЕ СОМАТИЧЕСКИХ КЛЕТОК . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 561 27.6.1. Клеточная гибридизация . . . . . . . . . . . . . . . 561 Протокол 27.6. Клеточная гибридизация . 561 27.6.2. Ядерный перенос . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 563 27.7. Продукция моноклональных антител . . 563 Протокол 27.7. Продукция моноклональных антител . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 564 Глава 28 ТРЕНИРОВОЧНЫЕ ПРОГРАММЫ . . . . 567 28.1. Цели и задачи главы . . . . . . . . . . . . . . . . . 567 28.2. Навыки препаративных работ и обращения с оборудованием . . . . . . . . . . . . . . . . . 567 Упражнение 1. Стерильное пипетирование и перенос жидкостей . . . . . . . . . . . . . . . 569 Упражнение 2. Мытье и стерилизация стеклянной посуды . . . . . . . . . . . . . . . . . 571 Упражнение 3. Приготовление и стерилизация воды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 572 Упражнение 4. Приготовление и стерилизация фосфатного буферного раствора Дульбекко (D-PBS) без Ca2+ и Mg2+ (D-PBSА) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 573 Упражнение 5. Приготовление стандартных рН-растворов . . . . . . . . . . . . . . . . . 574 Упражнение 6. Приготовление основной питательной среды из порошка и стерилизация методом фильтрования . . . 575 28.3. Основные методы работы с культурой клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 577 Упражнение 7. Наблюдение за культурой клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 577 Упражнение 8. Приготовление стерильной питательной среды . . . . . . . . . . . . . . . . 579 Упражнение 9. Смена среды в монослойной культуре . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 580 Упражнение 10. Приготовление полной среды из концентрата 10× . . . . . . . . . . 582 Упражнение 11. Подсчет клеток с помощью гемоцитометра и электронного счетчика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 584 Упражнение 12. Субкультивирование клеток, растущих в суспензии . . . . . . . . . . 587 Упражнение 13. Субкультивирование клеточных линий, растущих в монослое . . 589 Упражнение 14. Окрашивание монослойной клеточной культуры по Гимзе . . . . 591 Упражнение 15. Построение и анализ кривой роста . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 592 28.4. Упражнения повышенной сложности . . 595 Упражнение 16. Характеристика клеточных линий . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 595 Упражнение 17. Обнаружение микоплазм 596 Упражнение 18. Криоконсервация культивируемых клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . 597 Упражнение 19. Первичная культура . . . . 600 Упражнение 20. Клонирование клеток, растущих в монослое . . . . . . . . . . . . . . . 604 28.5. Специализированные упражнения . . . . 606 Глава 29 РЕШЕНИЕ ПРОБЛЕМ . . . . . . . . . . . . . . . 607 29.1. Аномальный внешний вид клеток . . . . . 607 29.2. Медленный рост клеток . . . . . . . . . . . . . . 608 29.2.1. Проблемы, ограниченные вашими собственными культурами . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 608 29.2.2. Более общие проблемы. Проблемы, с которыми столкнулись другие исследователи . 608 29.3. Среда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 610 29.3.1. Состав, приготовление и хранение . . . . . . . 610 29.3.2. Нестабильные реагенты . . . . . . . . . . . . . . . 612 29.3.3. Чистота компонентов среды . . . . . . . . . . . . 612 29.4. Субстраты и контейнеры . . . . . . . . . . . . . 613 29.5. Микробиологическая контаминация . . 614 29.5.1. Контаминация, ограниченная одним исследователем . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 614 29.5.2. Широко распространенная контаминация 616
Оглавление 15 29.5.3. Системы подачи воздуха и ламинарные боксы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 618 29.5.4. Специфическая контаминация . . . . . . . . . . 618 29.6. Химическое загрязнение . . . . . . . . . . . . . . 619 29.6.1. Стекло . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 619 29.6.2. Пипетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 619 29.6.3. Система очистки воды . . . . . . . . . . . . . . . . . 620 29.6.4. Криоконсерванты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620 29.6.5. Порошки и аэрозоли . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620 29.7. Первичная культура . . . . . . . . . . . . . . . . . 620 29.7.1. Недостаточное количество взятых клеток в первичной культуре . . . . . . . . . . . . . . . . . . 620 29.7.2. Неправильная селекция клеток . . . . . . . . . . 622 29.7.3. Контаминация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 622 29.8. Дифференцировка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 622 29.9. Питание культуры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 623 29.9.1. Простые монослойные культуры . . . . . . . . 623 29.9.2. Клонирование клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . 623 29.10. Субкультура . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 624 29.10.1. Недостаточное количество взятых клеток или медленный рост . . . . . . . . . . . . . . . . . . 624 29.10.2. Неравномерное развитие культуры . . . . . . 624 29.11. Клонирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 625 29.11.1. Слишком мало колоний в чашке . . . . . . . . . 625 29.11.2. Слишком много колоний в чашке . . . . . . . . 626 29.11.3. Неравномерное распределение . . . . . . . . . . 627 29.12. Перекрестная контаминация и неверная идентификация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 627 29.13. Криоконсервация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 628 29.13.1. Плохое восстановление . . . . . . . . . . . . . . . . 628 29.13.2. Измененный внешний вид после криоконсервации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 629 29.13.3. Потеря ростовой культуры . . . . . . . . . . . . . 629 29.14. Подсчет клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 630 29.14.1. Гемоцитометр . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 630 29.14.2. Электронный счетчик с измерением сопротивления в капилляре . . . . . . . . . . . . . . . . . . 630 Глава 30 ЗАКЛЮЧЕНИЕ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 631 Приложение I РАСЧЕТЫ И ПРИГОТОВЛЕНИЕ РЕАКТИВОВ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 632 Приложение II ИСТОЧНИКИ ОБОРУДОВАНИЯ И МАТЕРИАЛОВ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 640 Приложение III КОМПАНИИ-ПОСТАВЩИКИ И ДРУГИЕ РЕСУРСЫ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 664 Приложение IV СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ [по Schaeff er, 1990] 677 Приложение V КОНТАМИНИРОВАННЫЕ ИЛИ НЕПРАВИЛЬНО ИДЕНТИФИЦИРОВАННЫЕ КЛЕТОЧНЫЕ ЛИНИИ . . . . . . . . . . . . . . . 684 Приложение VI ОСНОВНАЯ ЛИТЕРАТУРА . . . . . . . . . . . 707 Список литературы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 709 Предметный указатель . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 758
Список иллюстраций Рис. 1.1. Рост количества публикаций по культуре ткани 30 Рис. 1.2. Области применения культуры ткани 34 Рис. 1.3. Типы клеточных культур 39 Рис. 2.1. Клеточная адгезия 42 Рис. 2.2. Межклеточные контакты 43 Рис. 2.3. Рост клеток А549 на Matrigel 44 Рис. 2.4. Клеточный цикл 45 Рис. 2.5. Дифференцировка и пролиферация 47 Рис. 2.6. Дифференцировка из стволовых клеток 48 Рис. 2.7. Коммитирование и реверсивность 50 Рис. 2.8. Клеточное взаимодействие и передача сигнала 51 Рис. 2.9. Развитие клеточной линии 53 Рис. 2.10. Количество хромосом в клетках конечной и постоянной клеточных линий 55 Рис. 3.1. Небольшая лаборатория для работы с культурой ткани 56 Рис. 3.2. Лаборатория средних размеров для работы с культурой ткани 57 Рис. 3.3. Лаборатория для работы с культурой ткани с прилежащими препаративными комнатами 58 Рис. 3.4. Большая лаборатория для работы с культурой ткани 59 Рис. 3.5. Баланс воздушного давления 60 Рис. 3.6. Термальная комната 64 Рис. 3.7. Раковина для мойки и моечная машина для пипеток 67 Рис. 3.8. Хранилище для жидкого азота и морозильное оборудование 68 Рис. 4.1. Ламинарный шкаф 73 Рис. 4.2. Пипетирующее устройство 75 Рис. 4.3. Пипетторы 76 Рис. 4.4. Градуированный бутылочный дозатор 77 Рис. 4.5. Шприцевые дозаторы 77 Рис. 4.6. Автоматические дозаторы 77 Рис. 4.7. Заполняющее и считывающее устройства для планшетов 78 Рис. 4.8. Устройство для переноса 78 Рис. 4.9. Аспирация среды 79 Рис. 4.10. Инвертированный микроскоп 80 Рис. 4.11. Культуральные камеры 81 Рис. 4.12. CO2-инкубатор 82 Рис. 4.13. Устройство СО2-инкубатора 82 Рис. 4.14. Моечная машина для стекла 84 Рис. 4.15. Очиститель воды 85 Рис. 4.16. Настольный автоклав 87 Рис. 4.17. Напольный автоклав 87 Рис. 4.18. Пробирки 88 Рис. 5.1. Возможность заражения 92 Рис. 5.2. Рабочая зона лаборатории культуры ткани 93 Рис. 5.3. Воздушные потоки в ламинарном шкафу 94 Рис. 5.4. Расположение оборудования в рабочей зоне ламинарного шкафа 95 Рис. 5.5. Планировка рабочей зоны в ламинарном шкафу с горизонтальным воздушным потоком 96 Рис. 5.6. Планировка рабочей зоны на открытом столе 97 Рис. 5.7. Способ удерживания груши и крышки от флакона в руке 98 Рис. 5.8. Стакан для отходов 100 Рис. 5.9. Введение пипетки в пипетирующее устройство 101 Рис. 5.10. Наклоняющиеся флаконы 101 Рис. 5.11. Чашки Петри в коробке 103 Рис. 5.12. Заполнение флакона газом 104 Рис. 6.1. Переполненный цилиндр для использованных пипеток 108 Рис. 6.2. Безопасное введение пипетки в пипетирующее устройство 110 Рис. 6.3. Хомут для баллона 111 Рис. 6.4. Колба для спиртовой стерилизации инструментов 112 Рис. 6.5. Ламинарный шкаф биологической безопасности 114 Рис. 7.1. Морфология фидерных слоев 127 Рис. 7.2. Количество клеток и площадь поверхности 128 Рис. 7.3. Многолуночные планшеты 128 Рис. 7.4. Чашки Петри 129 Рис. 7.5. Пластиковые флаконы 129 Рис. 7.6. Многопластинчатый флакон 129 Рис. 7.7. Флаконы с перемешиванием 131 Рис. 7.8. Вентилируемые чашки Петри и флаконы 132 Рис. 7.9. Пузырьки и флаконы с закручивающимися крышками 132 Рис. 7.10. Случайный рост 133 Рис. 7.11. Культивирование на полых волокнах 133 Рис. 8.1. Буферное действие HEPES и бикарбоната 138 Рис. 8.2. Осмометр фирмы Löser 139 Рис. 10.1. Действие влажности на температуру в автоклаве 167 Рис. 10.2. Мытье и стерилизация лабораторного стекла 170 Рис. 10.3. Стерилизованные бутыли с крышками 172 Рис. 10.4. Сифонное моющее устройство для пипеток 173 Рис. 10.5. Мытье и стерилизация пипеток 174 Рис. 10.6. Полуавтоматическое устройство для затыкания пипеток ватными пробками (Bellco) 174 Рис. 10.7. Стерилизационный шкаф 175
Список иллюстраций 17 Рис. 10.8. Упаковка закручивающихся крышек для стерилизации 176 Рис. 10.9. Очистка воды 176 Рис. 10.10. Стерилизация фильтрацией 186 Рис. 10.11. Одноразовые стерилизационные фильтры 187 Рис. 10.12. Фильтрация при помощи перистальтического насоса 188 Рис. 10.13. Крупномасштабный фильтрующий комплект 189 Рис. 10.14. Варианты стерилизации фильтрацией 191 Рис. 10.15. Фильтры многократного использования 192 Рис. 10.16. Предварительная фильтрация 195 Рис. 11.1. Общий вес и выход клеток мышиного эмбриона 200 Рис. 11.2. Мышиные эмбрионы 200 Рис. 11.3. Препарирование мыши 202 Рис. 11.4. Извлечение куриного эмбриона из яйца 205 Рис. 11.5. Варианты первичной культуры 207 Рис. 11.6. Культура первичного эксплантата 209 Рис. 11.7. Дезагрегация в теплом трипсине 210 Рис. 11.8. Клеточное сито 211 Рис. 11.9. Дезагрегация в холодном трипсине 212 Рис. 11.10. Теплая и холодная трипсинизация 214 Рис. 11.11. Препарирование куриного эмбриона 216 Рис. 11.12. Дезагрегация ткани с помощью коллагеназы 218 Рис. 11.13. Механическая дезагрегация 219 Рис. 12.1. Поврежденные клетки 230 Рис. 12.2. Кривая роста и поддержание культуры 234 Рис. 12.3. Субкультивирование монослоя 236 Рис. 12.4. Серийное субкультивирование 238 Рис. 12.5. Перемешиваемая культура 240 Рис. 12.6. Клетки HL-60, растущие в суспензии 240 Рис. 12.7. Параллельные культуры и антибиотики 242 Рис. 13.1. Выход клональных клеток 244 Рис. 13.2. Клонирование с помощью разведения 246 Рис. 13.3. Клонирование в планшетах для микротитрации 247 Рис. 13.4. Действие глюкокортикоидов на клонирование 248 Рис. 13.5. Фидерные слои 250 Рис. 13.6. Клонирование в суспензии 253 Рис. 13.7. Клонирование в метилцеллюлозе (Methocel) 254 Рис. 13.8. Кольца для клонирования 255 Рис. 13.9. Выделение монослойных клонов 256 Рис. 13.10. Выделение суспензионных клонов 258 Рис. 13.11. Суспензия клонов меланомы, фибробластов и глии 262 Рис. 13.12. Избыточный рост в смешанной культуре 262 Рис. 14.1. Разделение клеток по их плотности 264 Рис. 14.2. Устройство для создания градиента 265 Рис. 14.3. Градиент, полученный с помощью центрифугирования 265 Рис. 14.4. Центрифужный элютриаторный ротор (Beckman Coulter) 267 Рис. 14.5. Магнитный сортинг 268 Рис. 14.6. Магнитный сортинг клеток (MACS® Technology) 269 Рис. 14.7. Флуоресцентно-активируемый сортер клеток (FACS) 271 Рис. 14.8. Проточная цитометрия 271 Рис. 15.1. Куполообразные структуры 276 Рис. 15.2. Примеры морфологии клеток в культуре 278 Рис. 15.3. Культуральные сосуды для цитологии 287 Рис. 15.4. Цитоцентрифуга 287 Рис. 15.5. Цитологический фильтр 288 Рис. 15.6. Приготовление препарата хромосом 291 Рис. 15.7. Окрашивание хромосом 292 Рис. 15.8. Подготовка кариотипа 294 Рис. 15.9. ДНК-фингерпринтинг 295 Рис. 15.10. Секвенирование ДНК 297 Рис. 15.11. Изучение профиля ДНК 299 Рис. 15.12. Изоферментный электрофорез 300 Рис. 15.13. Прибор для иммуноанализа Agilent 305 Рис. 16.1. Регуляция дифференцировки 311 Рис. 16.2. Реципрокное паракринное взаимодействие 312 Рис. 17.1. Клональные вариации 320 Рис. 17.2. Хромосомные аберрации 320 Рис. 17.3. Фокусы трансформации 321 Рис. 17.4. Совокупное количество времени удвоения популяции (PD) иммортализованных клеток hTERT 326 Рис. 17.5. Ограничение клеточной пролиферации в зависимости от плотности 330 Рис. 17.6. Исследование клеток сердца цыпленка 333 Рис. 17.7. Инвазия в фильтрующей ячейке 334 Рис. 17.8. Исследование ангиогенеза in vitro 336 Рис. 17.9. Активатор плазминогена (РА) 336 Рис. 18.1. Типы контаминации 344 Рис. 18.2. Детекция микоплазм с помощью PCR 348 Рис. 19.1. Кривая замораживания 357 Рис. 19.2. Ампулы на стержне с изоляцией для медленного охлаждения 357 Рис. 19.3. Пробка для узкогорлого морозильника 358 Рис. 19.4. Охлаждающее устройство Nunc Cooler 358 Рис. 19.5. Программируемый морозильник 358 Рис. 19.6. Морозильники с жидким азотом 360 Рис. 19.7. Конструкция азотного морозильника 361 Рис. 19.8. Замораживание клеток 363 Рис. 19.9. Размораживание клеток 366 Рис. 19.10. Витрификация 368 Рис. 19.11. Помещение клеток в банк 369 Рис. 19.12. Серийное возобновление культуры 371 Рис. 19.13. Контейнер для транспортировки клеток 372 Рис. 20.1. Использование стекла гемоцитометра 375 Рис. 20.2. Электронный счетчик клеток CASY 378 Рис. 20.3. Схема работы счетчика клеток CASY 378 Рис. 20.4. Аналоговая распечатка результатов подсчета клеток на электронном счетчике CASY 379 Рис. 20.5. Электронный счетчик клеток Beckman Coulter Vi-CELL 380 Рис. 20.6. Флоуцитометр Accuri C6 381 Рис. 20.7. Данные, полученные при помощи проточного цитометра Guava 383 Рис. 20.8. Кривая роста 389 Рис. 20.9. Внешний вид многолуночных планшетов 390 Рис. 20.10. Интерпретация кривой роста 391 Рис. 20.11. Анализ изображения клеточных культур в процессе роста 393 Рис. 20.12. Кривая роста, построенная с помощью Incucyte 394 Рис. 20.13. Плотность насыщения 396 Рис. 20.14. Разведение клеток для клонирования 398 Рис. 20.15. Линейность эффективности посева 399 Рис. 20.16. Автоматический счетчик колоний 400 Рис. 20.17. Индекс мечения 401
Список иллюстраций Рис. 20.18. Сканирование препаратов или чашек 402 Рис. 20.19. Фракции роста 402 Рис. 21.1. Клоногенные исследования прикрепленных клеток 407 Рис. 21.2. Кривая выживания 408 Рис. 21.3. Интерпретация кривых выживания 408 Рис. 21.4. Влияние условий культивирования на долю выживших клеток 409 Рис. 21.5. Микротитрационное исследование 411 Рис. 21.6. Кривая процентного ингибирования 412 Рис. 21.7. Продолжительность исследования 412 Рис. 21.8. Кривая времени падения IC50 414 Рис. 21.9. Корреляция между микротитрационным и клоногенным методами исследования выживания 415 Рис. 21.10. Органотипическое исследование 419 Рис. 22.1. Выделение органоидных структур из ткани молочной железы 430 Рис. 22.2. Клетки HepaRG 437 Рис. 22.3. Клетки сосудистого эндотелия 457 Рис. 22.4. Иссечение обонятельной луковицы. 465 Рис. 22.5. Культура меланоцитов 468 Рис. 23.1. Эмбриональные стволовые клетки мыши 473 Рис. 23.2. Эмбриональные стволовые клетки человека 478 Рис. 23.3. Вытянутые кончики стеклянных пастеровских пипеток 479 Рис. 23.4. MSC, выделенные из костного мозга 488 Рис. 23.5. Колонии iPS-клеток 492 Рис. 24.1. Конфлюэнтные фидерные слои 503 Рис. 24.2. Селективные фидерные слои 504 Рис. 24.3. Фракционирование продуктов ферментативного расщепления ткани рака молочной железы 508 Рис. 24.4. Клеточные линии карциномы желудка 510 Рис. 24.5. Клеточные линии рака поджелудочной железы 512 Рис. 24.6. Две культуры клеток из анапластической астроцитомы человека 514 Рис. 25.1. Действие клеточной плотности на экспрессию GFAP в клетках C6 517 Рис. 25.2. Гистотипическая и органотипическая культуры 518 Рис. 25.3. Органная культура 519 Рис. 25.4. Разделение клеток в сфероидах 523 Рис. 25.5. Вращающаяся система камер Heraeus Miniperm 525 Рис. 25.6. Вращательная система культуры клеток Synthecon Rotatory Cell Culture System 525 Рис. 25.7. Вкладыши в фильтрационную лунку 527 Рис. 25.8. Вкладыши Transwells 527 Рис. 25.9. Каркасы и матрицы 530 Рис. 25.10. ЯМР конструкта хряща 531 Рис. 26.1. Большой флакон для перемешивания 533 Рис. 26.2. Перемешиваемая культура большого объема 533 Рис. 26.3. Биостат 535 Рис. 26.4. Контролируемый биореактор 536 Рис. 26.5. Биореакторы для крупного производства 537 Рис. 26.6. Волновой биореактор 537 Рис. 26.7. Культуральный аэратор BelloCell 538 Рис. 26.8. Перфузия на полых волокнах 538 Рис. 26.9. Многопланшетный флакон Corning HyperFlask 539 Рис. 26.10. Многоповерхностные культиваторы 540 Рис. 26.11. Заполнение системы Nunc Cell Factory 541 Рис. 26.12. Система для культуры клеток Corning CellCube 542 Рис. 26.13. Бутыли для роллерных культур на стеллажах 542 Рис. 26.14. Схема работы роллерной культуры 543 Рис. 26.15. Барабанный роллерный аппарат 543 Рис. 26.16. Микроносители Cytopore 544 Рис. 26.17. Реакторы с неподвижным слоем 546 Рис. 26.18. Биореактор Celligen® 310 547 Рис. 26.19. Системы контроля биореактора 548 Рис. 26.20. ЯМР-анализ клеток 548 Рис. 26.21. Роботизированное культивирование клеток 549 Рис. 27.1. Микроавторадиография 553 Рис. 27.2. Микрорадиоавтографы 555 Рис. 27.3. Гибридизация соматических клеток 562 Рис. 27.4. Производство гибридом 563 Рис. 28.1. Схема 12-луночного планшета 594 Рис. 28.2. Варианты упражнения по замораживанию 598 Рис. 29.1. Источники контаминации 615
Список цветных вклеек 1. Первичная культура клетки человека 2. Первичная культура, эксплантат, холодная трипсинизация и коллагеназа 3. Первичная культура эмбриона цыпленка, зачаточные органы 4. Фазы ростового цикла 5. Субкультивирование методом трипсинизации 6. Клонирование клеток 7. Клонирование клеток. Морфологическое разнообразие 8. Конечные клеточные линии и канюлирование пупочного канатика человека 9. Постоянные клеточные линии из опухолей человека 10. Постоянные клеточные линии из нормальных тканей животных 11. Иммунное окрашивание 12. Морфологическая дифференцировка эпителиальных клеток 13. Дифференцировка клеток Friend и глиальных клеток человека 14. Свойства трансформированных клеток 15. Свойства трансформированных клеток 16. Примеры контаминации 17. Жизнеспособность и цитотоксичность 18. Сфероиды, инкапсуляция и микроносители 19. Органотипическая культура на фильтрующих вкладышах в лунки 20. Органотипическая культура кожи. (С разрешения HansJürgen Stark.) 21. Токсичность в органотипической модели in vitro 22. Приготовление среды, культуральные системы и флаконы для криоконсервации 23. Магнитно-активированный клеточный сортинг 24. Автоматизированные культуры и анализ 25. Эмбриональные стволовые клетки 26. Ювенильные и зрелые стволовые клетки 27. Дифференцированные клетки человека в первичной культуре (1). Культуры после первого или второго субклонирования. Фазовый контраст, объектив ×10. (С разрешения Cell Applications, Inc.) 28. Дифференцированные клетки человека в первичной культуре (2). Культуры после первого или второго субклонирования. Фазовый контраст, объектив ×10. (С разрешения Cell Applications, Inc.)
Список протоколов 5.1. Асептический метод работы в вертикальном ламинарном потоке 100 5.2. Работа на открытой поверхности 102 5.3. Работа с планшетами и чашками 103 7.1. Приготовление ECM 126 8.1. Приготовление стандартных буферных растворов 135 10.1. Подготовка и стерилизация изделий из стекла 169 10.2. Подготовка и стерилизация стеклянных пипеток 173 10.3. Подготовка и стерилизация завинчивающихся крышек 175 10.4. Стерилизация комплекта фильтров 178 10.5. Приготовление и стерилизация сверхчистой воды (UPW) 179 10.6. Приготовление и стерилизация D-PBSA 181 10.7. Приготовление среды из концентрата с кратностью 1× 182 10.8. Приготовление среды из концентрата с кратностью 10× 182 10.9. Приготовление среды из порошка 184 10.10. Приготовление специализированной среды 185 10.11. Стерилизация с использованием фильтрующих насадок на шприцы 186 10.12. Стерилизация с использованием фильтрующей вакуумной насадки на колбу 188 10.13. Стерилизация с использованием малого встроенного фильтра 189 10.14. Стерилизационная фильтрация с использованием большого прямоточного фильтра 190 10.15. Сбор и стерилизация сывороток 192 10.16. Диализ сывороток 194 11.1. Выделение мышиного эмбриона 201 11.2. Выделение куриного эмбриона 204 11.3. Передача и получение биопсийного материала человека 206 11.4. Первичные эксплантаты 206 11.5. Дезагрегация ткани теплым трипсином 209 11.6. Дезагрегация ткани в холодном трипсине 212 11.7. Рудиментарные органы куриного эмбриона 213 11.8. Дезагрегация ткани с помощью коллагеназы 215 11.9. Механическая дезагрегация ткани путем просеивания 220 11.10. Обогащение доли жизнеспособных клеток 220 12.1. Питание монослойной культуры во флаконах 232 12.2. Питание монослойной культуры в чашках и планшетах 233 12.3. Субкультивирование клеток, образующих монослой 236 12.4. Суспензионное субкультивирование 240 13.1. Клонирование с разведением 245 13.2. Приготовление кондиционированной среды 249 13.3. Приготовление фидерных слоев 250 13.4. Клонирование в агаре 251 13.5. Клонирование в Methocel 252 13.6. Выделение клонов с использованием колец для клонирования 255 13.7. Выделение клеточных колоний путем облучения 257 13.8. Выделение суспензионных клонов 257 13.9. Метотрексат-резистентность и DHFR-амплифика ция 259 14.1. Разделение клеток центрифугированием в градиенте плотности 263 14.2. Магнитно-активированный клеточный сортинг (MACS) 269 15.1. Использование инвертированного микроскопа 284 15.2. Окрашивание по Гимзе 285 15.3. Окрашивание кристаллвиолетом 286 15.4. Подготовка суспензионной культуры клеток для цитологических исследований методом цитоцентрифугирования 287 15.5. Фильтрационная цитология 288 15.6. Цифровая фотография на микроскопе 289 15.7. Приготовление хромосомного препарата 290 15.8. Анализ STR-профиля ДНК клеточных линий 296 15.9. Изоферментный анализ 300 15.10. Непрямая иммунофлуоресценция 304 17.1. Иммортализация фибробластов 324 17.2. Иммортализация мезенхимальных стволовых клеток человека с помощью теломеразы 327 17.3. Ограничение клеточной пролиферации плотностью суспензии 330 17.4. Исследование ангиогенеза in vitro 335 18.1. Обработка инкубаторов 341 18.2. Выявление микоплазм методом флуоресценции 345 18.3. Использование PCR для обнаружения микоплазм 346 18.4. Устранение микробной контаминации 350 18.5. Устранение микоплазменной контаминации 351 19.1. Замораживание клеток 362 19.2. Размораживание клеток 364 19.3. Криоконсервация hES-клеток путем витрификации 367 19.4. Размораживание hES-клеток, криоконсервированных путем витрификации 368 20.1. Подсчет клеток при помощи гемоцитометра 374 20.2. Электронный подсчет клеток на основе электрического сопротивления 378 20.3. Оценка содержания ДНК с использованием красителя Hoechst 33258 382 20.4. Оценка содержания белка методом Брэдфорда 382 20.5. Оценка уровня синтеза ДНК методом включения [3Н]тимидиновой метки 384 20.6. Синтез белка 385
Список протоколов 21 20.7. Кривая роста монослоя во флаконах 391 20.8. Кривая роста монослоя в многолуночном планшете 391 20.9. Кривая роста суспензионной культуры 394 20.10. Определение эффективности посева на чашки Петри 397 20.11. Индекс мечения [3Н]-ти ми ди ном 400 20.12. Определение фракции пролиферирующих клеток 401 21.1. Оценка жизнеспособности методом отторжения красителя 405 21.2. Оценка жизнеспособности методом поглощения красителя 405 21.3. Клоногенный анализ прикрепленных клеток 406 21.4. Оценка цитотоксичности при помощи МТТ-теста 411 21.5. Обмен сестринских хроматид 416 22.1. Эпидермальные кератиноциты 424 22.2. Эпителиальные клетки роговицы 427 22.3. Получение эпителиальных клеток молочной железы из тканей, отобранных при маммопластике 429 22.4. Цервикальный эпителий 431 22.5. Выделение и культивирование клеток крипт толстого кишечника 433 22.6 А. Выделение гепатоцитов крысы 435 22.6 Б. Очистка гепатоцитов человека HepaRG 437 22.7. Эпителий поджелудочной железы 438 22.8. Эпителий почки 440 22.9. Бронхиальный и трахеальный эпителий 441 22.10. Кератиноциты ротовой полости 442 22.11. Эпителий простаты 444 22.12. Первичная культура адипоцитов 446 22.13. Выделение и культивирование гладкомышечных клеток 447 22.14. Культура миобластов взрослой скелетной мышцы 448 22.15. Культура отдельного мышечного волокна скелетной мышцы 450 22.16. Хондроциты на альгинатных бусинах 451 22.17. Остеобласты 454 22.18. Выделение и культивирование клеток сосудистого эндотелия 455 22.19. Выделение и культивирование тучных клеток мозжечка 459 22.20. Первичная культура астроцитов человека 461 22.21. Обонятельные клетки 463 22.22. Культура меланоцитов 466 23.1. Получение и первичное культивирование эмбриональных стволовых клеток мыши 471 23.2. Размножение эмбриональных стволовых клеточных линий мыши 474 23.3. Получение эмбриональных стволовых клеток человека 476 23.4. Пересадка hES-клеток 477 23.5. Культуры клеток эмбриона данио-рерио 479 23.6. Культура амниоцитов 482 23.7. Получение MSC из костного мозга человека 487 23.8. Перепрограммирование человеческих дермальных фибробластов для генерации плюрипотентных стволовых клеток 489 23.9. Долгоживущие гематопоэтические клеточные культуры из костного мозга мыши 491 23.10. Исследование инициирующих долгоживущую культуру человеческих клеток (LTC-IC) 493 23.11. Исследование гематопоэтических колониеобразующих клеток 496 24.1. Замораживание образцов биопсии 500 24.2. Рост на конфлюэнтных фидерных слоях 503 24.3. Культивирование клеток опухоли молочной железы 508 24.4. Культура колоректальных опухолей 510 24.5. Определение постоянных клеточных линий лейкемии и лимфомы 515 25.1. Органная культура 520 25.2. 3D-культуры в сфероидах 523 25.3. Фильтрационные вкладыши для лунок 526 25.4. Нейрональные агрегаты 528 26.1. Перемешивание 4-литровой партии суспензионной культуры 533 26.2. Система Nunc Cell Factory 539 26.3. Культура в роллерных бутылях 542 26.4. Микроносители 544 27.1. Подготовка препарата лимфоцитов 551 27.2. РНА-стимуляция лимфоцитов 552 27.3. Микроавторадиография 554 27.4. Видеосъемка в режиме замедленного времени 557 27.5. Культивирование клеток насекомых 560 27.6. Клеточная гибридизация 561 27.7. Продукция моноклональных антител 564