Биофизика
Покупка
Издательство:
Издательство Уральского университета
Год издания: 2019
Кол-во страниц: 114
Дополнительно
Вид издания:
Учебно-методическая литература
Уровень образования:
ВО - Бакалавриат
ISBN: 978-5-7996-2621-1
Артикул: 798394.01.99
В учебно-методическом пособии рассмотрены основные биофизические принципы из разных разделов курса: от биофизики сложных систем до частной биофизики. Освещены вопросы термодинамики биологических процессов, методы атомной физики в применении к биологическим системам, молекулярной и клеточной биофизики. Приведены методические рекомендации к лабораторным занятиям, которые содержат теоретический блок и иллюстративный материал, а также вопросы и задания по рассмотренным темам. Пособие предназначено для студентов биологических и медицинских специальностей вузов.
Тематика:
ББК:
УДК:
ОКСО:
- ВО - Бакалавриат
- 06.03.01: Биология
- ВО - Специалитет
- 30.05.01: Медицинская биохимия
- 30.05.02: Медицинская биофизика
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов
Екатеринбург Издательство Уральского университета 2019 МИнИстЕрство наУкИ И высшЕго образованИя россИйской ФЕдЕрацИИ УральскИй ФЕдЕральный УнИвЕрсИтЕт ИМЕнИ пЕрвого прЕзИдЕнта россИИ б. н. ЕльцИна о. с. арташян, в. а. Мищенко, Е. л. лебедева бИоФИзИка Учебно-методическое пособие рекомендовано методическим советом Уральского федерального университета в качестве учебно-методического пособия для студентов вуза, обучающихся по направлению подготовки 06.03.01 «биология», по специальностям 30.05.01 «Медицинская биохимия», 30.05.02 «Медицинская биофизика»
© Уральский федеральный университет, 2019 р е ц е н з е н т ы: лаборатория биологической подвижности Института иммунологии и физиологии Уро ран (заведующий лабораторией доктор биологических наук С. Ю. Бершицкий); Л. Б. Кацнельсон, доктор физико-математических наук, доцент, ведущий научный сотрудник лаборатории математической физиологии Института иммунологии и физиологии Уро ран под общей редакцией о. с. арташян Удк 577.3(075.8) ббк 28.07я73 а86 Арташян, О. С. биофизика : учеб. -метод. пособие / о. с. арташян, в. а. Мищенко, Е. л. лебедева; [под общ. ред. о. с. арташян] ; М-во науки и высш. образования рос. Федерации, Урал. федер. ун-т. — Екатеринбург : Изд-во Урал. ун-та, 2019. — 114 с. ISBN 978-5-7996-2621-1 в учебно-методическом пособии рассмотрены основные биофизические принципы из разных разделов курса: от биофизики сложных систем до частной биофизики. освещены вопросы термодинамики биологических процессов, методы атомной физики в применении к биологическим системам, молекулярной и клеточной биофизики. приведены методические рекомендации к лабораторным занятиям, которые содержат теоретический блок и иллюстративный материал, а также вопросы и задания по рассмотренным темам. пособие предназначено для студентов биологических и медицинских специальностей вузов. а86 Удк 577.3(075.8) ббк 28.07я73 ISBN 978-5-7996-2621-1 На обложке: Ж. Л. Давид. Портрет Лавуазье и его жены Мари-Анны, 1788
Оглавление предисловие ................................................................................................... 4 Тема 1. Биофизика сложных систем. Термодинамика биологических процессов лабораторная работа 1. биоэнергетика и метаболизм .................. 5 лабораторная работа 2. определение основного обмена. дыхательный коэффициент ........................................................... 23 Тема 2. Атомная физика и квантовая механика в применении к биологическим системам лабораторная работа 3. количественный спектрофотометрический анализ .................................................. 39 лабораторная работа 4. рентгеновская компьютерная томография ...................................................................................... 45 Тема 3. Молекулярная биофизика лабораторная работа 5. Изучение пространственной структуры белка на компьютерной модели .................................. 57 лабораторная работа 6. Изучение интенсивности перекисного окисления липидов по содержанию тбк-реактивных продуктов в плазме крови ................................ 65 Тема 4. Биофизика клетки лабораторная работа 7. биофизика мембран. кислотный и щелочной гемолиз эритроцитов ................................................. 70 лабораторная работа 8. биофизика мышечного сокращения. Электромиография. пополнение двигательных единиц. Утомление ....................................................................................... 78 Тема 5. Методы биофизики лабораторная работа 9. капиллярный электрофорез ................. 94 примерный перечень вопросов для подготовки к экзамену по курсу «биофизика» ............................................................................................... 106 библиографические ссылки ...................................................................... 110 список рекомендуемой литературы ..........................................................111
биофизика — междисциплинарная наука, находящаяся на стыке биологии, физики, химии и математики. в настоящее время биофизика наряду с другими отдельными биологическими направлениями (молекулярная биология, биохимия, физиология и др.) является базой фундаментального курса наук о жизни. современная биофизика достигла крупных успехов в изучении и объяснении ряда биологических явлений, проявляющихся на разных уровнях организации живого. реализованы общетеоретические подходы к явлениям жизни, основанные на термодинамике, теории информации, авторегуляции и др. Учебно-методическое пособие «биофизика» предназначено для проведения лабораторных и практических занятий по дисциплине «биофизика» у студентов 3–4 курсов биологических, физических, медицинских, фармацевтических, сельскохозяйственных специальностей высшей школы. настоящее учебно-методическое пособие составлено согласно действующему федеральному государственному образовательному стандарту и рабочей программе по учебной дисциплине «биофизика». Материал по каждому занятию предваряется изложением кратких теоретических положений, которые дают объяснение физикохимическим основам биологических явлений. представленные в пособии материалы не являются заменой лекционного курса и основных существующих учебников, а будут полезны в качестве дополнения на этапах изучения биофизики, для качественного выполнения лабораторных и практических работ, написания рефератов, подготовки к экзаменам и зачетам, для повторения материала по предмету при изучении последующих дисциплин образовательной программы. ПредислОвие
Тема 1. БиОфизика слОжных сисТем. ТермОдинамика БиОлОгических ПрОцессОв Лабораторная работа 1 БиОэнергеТикА и МеТАБОЛизМ (работа выполняется на учебном комплексе «Biopac Student Lab») в основе жизни лежит обмен веществ, который сопровождается процессами превращения энергии. для понимания этих процессов необходимы знания основ биоэнергетики и термодинамики. о б м е н в е щ е с т в состоит из двух взаимосвязанных процессов: — часть общего обмена веществ, при котором идет усвоение, поглощение, синтез, называется анаболизмом (ассимиляцией); — часть общего обмена веществ, при котором идет разрушение, распад и выделение, называется катаболизмом (диссимиляцией). п л а с т и ч е с к и й о б м е н — совокупность реакций синтеза органических веществ, из которых образуются структуры клетки, обновляется ее состав, а также синтезируются ферменты, необходимые для ускорения химических реакций в клетке. синтез сложного органического вещества — белка — из менее сложных органических веществ — аминокислот — пример пластического обмена. взаимосвязь пластического и энергетического обмена: пластический обмен поставляет для энергетического обмена органические вещества и ферменты, а энергетический обмен поставляет для пластического — энергию, без которой не могут идти реакции синтеза. нарушение одного из видов клеточного обмена ведет к нарушению всех процессов жизнедеятельности, т. е. к гибели организма.
Энергия необходима для механической работы при сокращении мышц, для электрической работы — при генерации и передаче нервных импульсов, для осмотической работы — при секреции, ресорбции и фильтрации веществ на клеточных мембранах, для химической работы — при образовании новых химических связей между атомами в процессах биосинтеза сложных органических соединений. Источником энергии для всех видов биологической работы служит потенциальная химическая энергия, заключенная в молекулах пищевых веществ. она высвобождается в процессе обмена веществ и при помощи специальных молекулярных устройств преобразуется в различные другие виды энергии. каждое органическое соединение обладает запасом энергии, которую называют свободной энергией. в процессе реакции идет преобразование энергии между веществами. главным носителем свободной энергии в веществе являются химические связи между атомами. Если химическая связь имеет энергию 12,5 кдж/моль, то такая связь по энергетическому обеспечению называется нормальной. Если при разрыве химической связи выделяется энергия 25–50 кдж/моль, то такая связь называется макроэргической и обозначается символом «~» (знак «тильда»). Э н е р г и я — это способность производить работу. различают потенциальную энергию, зависящую от положения или состояния тела, и кинетическую энергию, т. е. энергию движения. в живом организме потенциальная энергия представлена, главным образом, в форме химической энергии связей между атомами в молекулах биоорганических соединений. например, количество потенциальной энергии, заключенной в связях между атомами с, н и о в молекуле глюкозы, составляет около 285 тыс. дж на 1 моль вещества. потенциальная энергия химических связей обусловлена расположением валентных электронов на орбитах с высоким энергетическим уровнем, куда они попадают при образовании молекул биоорганических соединений в процессе химических реакций. при метаболических превращениях, совершающихся в живом организме, электроны, образующие химические связи в молекулах первичных веществ, переходят с более высокого на более низкий энергетический уровень.
Кинетическая энергия потока электронов, переходящих по энергетическим уровням, в дальнейшем может быть использована для образования новых химических связей или же с помощью специальных биологических преобразователей превратиться в другие виды кинетической энергии: тепловую, механическую, электрическую, электромагнитную и т. д. постоянное взаимодействие этих двух видов энергии обусловливает способность организма поддерживать разнообразные жизненные функции. первичным источником энергии для всех биологических процессов на земле служит солнечный свет, лучистая энергия которого возникает в недрах солнца из ядерной энергии превращения атомов водорода в атомы гелия с выделением энергии в виде гамма-лучей. в результате взаимодействия гамма-лучей с электронами снова выделяется энергия в виде фотонов солнечного света. на земле лучистая энергия солнечного света улавливается содержащимся в хлоропластах зеленых растений пигментом хлорофиллом и превращается в ходе реакций фотосинтеза в химическую энергию, которая используется для синтеза из двуокиси углерода и воды углеводов и других сложных биоорганических соединений. таким образом, энергия солнечного света, представляющая собой один из видов кинетической энергии, превращается в один из видов потенциальной энергии. Энергия, накопленная в химических связях биоорганических молекул, может высвободиться только в процессе реакций обмена веществ. в организмах животных, питающихся растениями, химическая энергия углеводов и других питательных веществ выделяется в процессе биологического окисления в количестве, соответствующем энергии, израсходованной на синтез этих веществ при фотохимических реакциях в зеленых растениях. одна часть энергии, выделяющейся при биологическом окислении, превращается в доступную для дальнейшего использования энергию макроэргических фосфатных связей атФ, другая превращается в тепло и не может быть использована в дальнейшем. процессы, связанные с образованием макроэргических фосфатных связей, осуществляются в митохондриях.
науку, изучающую трансформацию энергии в живых системах, называют б и о э н е р г е т и ко й. теоретической базой биоэнергетики является х и м и ч е с к а я т е р м о д и н а м и к а. в термодинамику вводится понятие с и с т е м ы, которая представляет собой совокупность веществ, находящихся во взаимодействии, но мысленно обособляемых от окружающей среды. особенность систем, рассматриваемых в термодинамике, заключается в том, что они состоят из очень большого числа частиц — молекул или атомов. все лежащие за пределами системы называются окружающей средой. системы делятся на: • изолированные (замкнутые), не обменивающиеся с окружающей средой ни веществом, ни энергией; • закрытые — обмениваются с внешней средой только энергией; • открытые, для которых возможен обмен веществом и энергией с окружающей средой. Энергия может переходить из системы в окружающую среду и в обратном направлении. величины, определяющие состояние системы, называются ее параметрами. параметры системы часто делят на интенсивные (не зависящие от общего количества вещества в системе — температура и давление) и экстенсивные (зависящие от количества вещества — объем, масса, энергия). Характеристику перехода системы из одного состояния в другое можно дать такими термодинамическими функциями, как внутренняя энергия (U или Е), энтальпия (Н — термодинамическая величина, характеризующая энергию системы), энтропия (S — внутренняя энергия замкнутой системы) и свободная энергия (энергия гиббса — G). поскольку для живых систем трудно определить абсолютные значения Е, Н, S и G, обычно говорят об изменениях функций состояния системы: ∆U, ∆Н, ∆S и ∆G. процессы преобразования энергии в системе подчиняются з а ко н а м т е р м о д и н а м и к и.
Первый закон термодинамики каждая система обладает определенным запасом энергии, называемой внутренней энергией. внутренняя энергия системы представляет собой сумму энергий всех видов движений (поступательного, вращательного, колебательного) частиц системы (молекул, ионов, ядер). в н у т р е н н я я э н е р г и я — это полная энергия системы за вычетом потенциальной, обусловленной воздействием на систему внешних силовых полей (в поле тяготения), и кинетической энергией движущейся системы. запас внутренней энергии определяется природой вещества, его массой и состоянием системы. полную внутреннюю энергию (абсолютное значение внутренней энергии) определить невозможно. Экспериментально можно определить только изменение внутренней энергии при переходе ее из одного состояния в другое: ∆U = U2 – U1, где ∆U — приращение внутренней энергии; U1 и U2 — внутренняя энергия начального (исходного) и конечного состояний. Теплота, подведенная к закрытой системе, расходуется на изменение внутренней энергии системы и совершение работы – формулировка п е р в о г о з а к о н а т е р м о д и н а м и к и для процесса, протекающего при постоянном давлении, который является законом сохранения энергии и описывается уравнением Qp = ΔU + A, где Qp — теплота изобарного процесса; ΔU — приращение внутренней энергии; A — работа. впервые понял и доказал эквивалентность понятий теплоты и работы и сформулировал первое начало термодинамики (1842) немецкий врач р. Майер. в термодинамике обычно принимается, что теплота, отданная системой в окружающую среду, отрицательна, а полученная системой из окружающей среды — положительна. для работы приняты противоположные знаки. работа, совершенная системой