Сахарный диабет, 2012, том 15, № 3
Научно-практический медицинский журнал
Покупка
Основная коллекция
Тематика:
Эндокринология и болезни обмена веществ
Издательство:
Эндокринологический научный центр
Наименование: Сахарный диабет
Год издания: 2012
Кол-во страниц: 120
Дополнительно
Тематика:
ББК:
УДК:
ГРНТИ:
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов.
Для полноценной работы с документом, пожалуйста, перейдите в
ридер.
3/2012 Сахарный диабет ревзойдя прогнозы экспертов, число больных диабетом в мире в 2011 г. достигло 366 млн человек, что составило 8,3% всего взрослого населения планеты [1]. Прирост числа больных осуществляется главным образом за счет сахарного диабета 2 типа (СД2). По данным Российского государственного регистра сахарного диабета, распространенность СД2 среди взрослого населения с 2000 по 2009 гг. увеличилась на 45,5%; распространенность СД2 среди женщин в 2,5 раза выше, чем среди мужчин [2]. Хотя основной Ассоциации вариантов гена фактора роста сосудистого эндотелия (VEGF) и генов цитокинов (IL-1B, IL-4, IL-6, IL-10, TNFA) с сахарным диабетом 2 типа у женщин Коненков В.И., Шевченко А.В., Прокофьев В.Ф., Климонтов В.В., Королев М.А., Фазуллина О.Н., Лапсина С.А., Королева Е.А. ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск (директор – академик РАМН В.И. Коненков) Цель . Изучить ассоциации комбинаций полиморфных участков генов фактора роста сосудистого эндотелия (VEGF) и генов цитокинов (IL1B, IL4, IL6, IL10 и TNFA) с сахарным диабетом 2 типа (СД2) у женщин. Материалы и методы . В исследование включены 374 женщины европеоидного происхождения без нарушений углеводного обмена в возрасте от 23 до 68 лет и 212 пациенток с СД2 в возрасте от 28 до 69 лет. Исследованы комбинации вариантов генов VEGF А-2578С и С+936Т, IL1В С-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 A-592C и А-1082G, TNFА А-238G, A-308G и A-863C. Результаты . Анализ полиморфных участков исследованных генов выявил 52 комбинированных генетических варианта, частота которых была различна в группах здоровых и больных СД2 (р<0,002). В группе из 34 признаков, положительно ассоциированных с СД2, обнаружена высокая частота гомозиготных генотипов VEGF -2578CC и +936CC, IL4 - 590СС, IL6 - 174GG, IL10 - 592СC и -1082АА, TNFА -238GG, -308GG и -863СC. В составе 18 комбинированных генетических признаков, негативно ассоциированных с СД2, гомозиготные варианты VEGF и IL10 встречались в равном соотношении с гетерозиготными вариантами, в то время как среди генотипов IL1В, IL4 и IL6 преобладали гетерозиготные варианты. Заключение . Комбинации вариантов генов VEGF A-2578С и C+936Т с генотипами IL1В C-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 А-592C и А-1082G, TNFА A-238G, A-308G и A-863C могут служить генетическими факторами риска развития СД2 у женщин европеоидного происхождения. Ключевые слова: сахарный диабет 2 типа, полиморфизм генов, факторы роста, цитокины Associations of vascular endothelial growth factor (VEGF) gene and cytokine (IL-1B, IL-4, IL-6, IL-10, TNFA) genes combinations with type 2 diabetes mellitus in women Konenkov V.I., Shevchenko A.V., Prokof'ev V.F., Klimontov V.V., Korolev M.A., Fazullina O.N., Lapsina S.A., Koroleva E.A. Research Institute of Clinical and Experimental Lymphology, Novosibirsk, Russian Federation Aim . To study the association between vascular endothelial growth factor (VEGF) and cytokine (IL1B, IL4, IL6, IL10 and TNFA) gene polymorphism combinations with type 2 diabetes mellitus (T2DM) in women. Materials and methods . 374 Caucasian women without carbohydrate metabolism disorders from 23 to 68 years of age and 212 women with T2DM from 28 to 69 years of age were included in the study. The combinations of polymorphism А-2578С, С+936Т in VEGF gene with polymorphism in IL1B С-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 A-592C and А-1082G, TNFA А-238G, A-308G and A-863C were studied. Results . Analysis revealed 52 combined genetic variations with different rate of occurrence between diabetic and control groups (р<0.002). Among variations positively associated with T2DM (n=34) high frequency of homozygote genotypes of VEGF -2578CC and +936CC, IL4 -590СС, IL6 -174GG, IL10 -592СC and -1082АА, TNFA -238GG, -308GG and -863СC, was observed. In 18 combined genetic variations that were negatively associated with T2DM, homozygous variant of VEGF and IL10 were equally distributed with heterozygous genotypes, while heterozygote IL1B, IL4 and IL6 genotypes were more prevalent. Conclusion . Combination of VEGF gene polymorphisms A-2578С and C+936Т with polymorphism in IL1B C-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 А-592C and А-1082G, TNFA A-238G, A-308G and A-863C may be genetic risk factors for T2DM in Caucasian women. Key words: diabetes mellitus type 2, gene polymorphism, growth factors, cytokines П Генетика Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
Сахарный диабет 5 3/2012 Генетика причиной эпидемии являются изменения образа жизни и питания, в генезе СД2 обсуждается значение гене ти ческих детерминант, которые помогают объяснить различия в индивидуальной предрасположенности и большую гетерогенность патогенеза заболевания. В проведенных в последнее десятилетие полногеномных исследованиях идентифицировано около 40 локусов генетической предрасположенности к СД2 в европейских и азиатских популяциях. Почти все выделенные локусы оказались связаны с функцией βклеток и лишь единичные (в частности, PPARG, FTO, KLF14) показали связь с инсулинорезистентностью [3]. Обнаружены ассоциативные связи СД2 с однонуклеотидным полиморфизмом более ста генов [4, 5]. Существует большое количество гипотез, пытающихся объяснить связь между полиморфизмами генов и развитием СД2. Общим слабым местом этих гипотез является относительно невысокая частота встречаемости отдельных аллелей или генотипов в популяции пациентов с СД2. Идентифицированные к настоящему времени локусы объясняют лишь порядка 10% наследственной предрасположенности к СД2 [6]. Это расширяет возможную область исследования ассоциаций полиморфизмов генов, а также их комбинаций, с развитием заболевания. В последние годы в патогенезе СД2 и его сосудистых осложнений обсуждается роль хронического воспаления [7] и нарушений ангиогенеза [8]. Известно, что регуляция воспалительных реакций и новообразования сосудов осуществляется факторами роста и цитокинами. Мощными ангиогенными и провоспалительными свойствами обладает фактор роста сосудистого эндотелия (VEGF). Ген VEGF расположен на 6р21.3 хромосоме, в нем обнаружено несколько полиморфных участков; определена взаимосвязь между аллельными вариантами в позициях -634, +936, -1154 и -2578, уровнем экспрессии VEGF и концентрацией данного фактора в крови [9]. Установлена ассоциация полиморфизма гена VEGF с развитием диабетической ретинопатии [10]. Активную роль в регуляции воспаления и ангиогенеза играют интерлейкины1, 4, 6, 10 (IL-1, IL-4, IL-6, IL-10) и фактор некроза опухолей α (TNF-α). Перечисленные цитокины могут включаться в патогенез СД2, участвуя в развитии воспаления жировой ткани и в формировании инсулинорезистентности [11]. Аллельные варианты генов влияют на уровень экспрессии данных цитокинов и тем самым на течение иммуновоспалительных заболеваний [12]. Проведенные к настоящему времени исследования ассоциаций полиморфизмов генов отдельных цитокинов с резистентностью к инсулину и развитием СД2 дали довольно противоречивые результаты [5, 13–21]. С учетом этого, в данной работе проведен анализ ассоциаций комбинированных генетических признаков, включающих генотипы VEGF и генотипы цитокинов, с СД2. Целью исследования стало изучение ассоциации комбинаций полиморфных участков гена VEGF и генов цитокинов (IL1В, IL4, IL6, IL10 и TNFА) с СД2 у женщин. Для исследования отобраны точки полиморфизма, ассоциированные с высокими или низкими уровнями продукции и сывороточной концентрации кодируемых этими генами регуляторных макромолекул. Материалы и методы В исследование включена группа из 586 жителей России женского пола, считающих себя и своих родителей русскими, в том числе 374 женщины без нарушений углеводного обмена, в возрасте от 23 до 68 лет, и 212 пациенток с СД2 в возрасте от 28 до 69 лет. Диагноз СД устанавливался по критериям ВОЗ (1999 г.). У больных с верифицированным СД определялась гликемия натощак и после еды, а также уровень гликированного гемоглобина А1с. При необходимости проводилось исследование Спептида, антител к глутаматдекарбоксилазе и антиостровковых антител, для исключения латентного аутоиммунного диабета взрослых. В исследование не включались пациенты с эндокринопатиями, болезнями экзокринной части поджелудочной железы и другими факторами риска симптоматических форм СД. Обследованные давали письменное информированное согласие на участие в исследовании. Протокол исследования одобрен локальным этическим комитетом. Исследован однонуклеотидный полиморфизм нетранслируемых регионов генов: VEGF А-2578С и С+936Т, IL1В С-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 A-592C и А-1082G, TNFА А-238G, A-308G и A-863C. Генотипирование осуществляли методом рестриктного анализа продуктов амплификации. Участки промоторного региона генов амплифицировали с использованием пары специфичных праймеров, затем продукты амплификации подвергали гидролизу соответствующими эндонуклеазами рестрикции («СибЭнзим», Новосибирск). Электрофорез проводили в 2% агарозном геле [22, 23]. При статистическом анализе результатов использовали такие показатели, как частота встречаемости генов, генотипов и их комбинаций, специфичность (Sp – вероятность отрицательного результата генетического теста при отсутствии заболевания), отношение шансов (odds ratio – отношение шансов события в одной группе к шансам этого же события в другой группе), с расчетом 95% доверительного интервала (95% CI). Частоту аллелей генов цитокинов вычисляли методом прямого подсчета по формуле: f=n/2N, где n – количество раз встречаемости аллеля (у гомозигот он учитывался дважды), 2N – удвоенная численность обследованных. Частоту встречаемости отдельных генотипов и их комбинаций определяли как процентное отношение индивидов, несущих генотип (комбинацию генотипов), к общему числу обследованных в группе по формуле: f=n/N, где n – количество раз встречаемости генотипа (комбинации), N – численность обследованных. Распределение генотипов по исследованным полиморфным локусам проверяли на соответствие равновесию ХардиВайнберга [24]. Достоверность различий частот распределения изучаемых признаков в альтернативных группах определяли по критерию χ2 с поправкой Йетса на непрерывность Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
3/2012 Сахарный диабет Генетика Таблица 1 Комбинации генотипов VEGF с генотипами цитокинов, ассоциированные с развитием СД2 Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 Контроль OR OR’s 95%CI P(tmF2) Sp n N % n N % VEGF2578:IL10-1082 CA-AA 51 209 24,40 13 129 10,08 2,88 1,50–5,54 0,0010 89,92 VEGF2578:IL10-1082 AA-AA 20 209 9,57 2 129 1,55 6,72 1,54–29,25 0,0028 98,45 VEGF2578:IL10-592 CA-AA 11 208 5,29 2 294 0,68 8,15 1,79–37,18 0,0025 99,32 VEGF-936:IL10-1082 CC-AA 67 212 31,60 20 124 16,13 2,40 1,37–4,20 0,0019 83,87 VEGF-936:IL10-592 CC-AA 19 210 9,05 4 253 1,58 6,19 2,07–18,50 0,0003 98,42 VEGF2578:VEGF936:IL10-592 CA-CC-AA 11 208 5,29 1 252 0,40 14,02 1,79–109,48 0,0016 99,60 VEGF2578:TNF-863:IL10-592 AA-CA-CA 7 208 3,37 0 294 0,00 21,92 1,25–386,03 0,0020 100,00 VEGF2578:TNF238:IL10-1082 CA-GG-AA 49 209 23,44 13 129 10,08 2,73 1,42–5,27 0,0022 89,92 VEGF2578:IL4590:IL10-1082 CA-CC-AA 32 203 15,76 6 129 4,65 3,84 1,56–9,46 0,0022 95,35 VEGF2578:IL6174:IL10-1082 AA-GC-AA 13 209 6,22 0 128 0,00 17,66 1,04–299,64 0,0024 100,00 VEGF-936:TNF863:IL10-1082 CC-CA-AA 21 212 9,91 1 124 0,81 13,52 1,80–101,83 0,0005 99,19 VEGF-936:TNF-308:IL10-592 CC-GG-AA 16 210 7,62 4 253 1,58 5,13 1,69–15,60 0,0021 98,42 VEGF-936:TNF-238:IL10-592 CC-GG-AA 17 210 8,10 3 246 1,22 7,13 2,06–24,70 0,0004 98,78 VEGF-936:IL4-590:IL10-1082 CC-CC-AA 46 206 22,33 11 124 8,87 2,95 1,47–5,95 0,0015 91,13 VEGF-936:IL101082:IL10-592 CC-AA-AA 17 210 8,10 0 124 0,00 22,52 1,34–377,87 0,0004 100,00 VEGF2578:TNF-863:TNF308:IL10-592 AA-CA-GG-CA 7 208 3,37 0 294 0,00 21,92 1,25–386,03 0,0020 100,00 VEGF2578:TNF-308:IL6174:IL10-592 CA-GA-GG-CC 7 208 3,37 0 287 0,00 21,40 1,22–376,87 0,0022 100,00 VEGF2578:TNF-238:IL4590:IL10-1082 CA-GG-CC-AA 32 203 15,76 6 129 4,65 3,84 1,56–9,46 0,0022 95,35 VEGF-936:TNF-863:TNF308:IL10-1082 CC-CA-GG-AA 19 212 8,96 1 124 0,81 12,11 1,60–91,61 0,0014 99,19 VEGF-936:TNF-863:TNF238:IL10-1082 CC-CA-GG-AA 19 212 8,96 1 124 0,81 12,11 1,60–91,61 0,0014 99,19 VEGF-936:TNF-863:IL4590:IL10-1082 CC-CA-CC-AA 16 206 7,77 0 124 0,00 21,57 1,28–362,77 0,0008 100,00 VEGF-936:TNF-308:TNF238:IL10-592 CC-GG-GG-AA 14 210 6,67 3 246 1,22 5,79 1,64–20,42 0,0024 98,78 VEGF-936:TNF-308:IL6174:IL10-592 CC-GA-GG-CC 13 210 6,19 2 247 0,81 8,08 1,80–36,25 0,0013 99,19 VEGF-936:TNF-308:IL101082:IL10-592 CC-GG-AA-AA 14 210 6,67 0 124 0,00 18,37 1,09–310,79 0,0015 100,00 VEGF-936:TNF-238:IL4590:IL10-1082 CC-GG-CC-AA 43 206 20,87 10 124 8,06 3,01 1,45–6,23 0,0019 91,94 VEGF-936:TNF-238:IL101082:IL10-592 CC-GG-AA-AA 15 210 7,14 0 124 0,00 19,74 1,17–332,92 0,0015 100,00 VEGF2578:VEGF-936:TNF238:IL4-590:IL10-1082 CA-CC-GGCC-AA 27 203 13,30 4 123 3,25 4,56 1,56–13,38 0,0029 96,75 VEGF2578:TNF-308:TNF238:IL6-174:IL10-592 CA-GA-GGGG-CC 7 208 3,37 0 275 0,00 20,51 1,16–361,18 0,0026 100,00 VEGF-936:TNF-863:TNF308:IL6-174:IL10-592 CC-CC-GAGG-CC 12 210 5,71 1 247 0,40 14,91 1,92–115,65 0,0009 99,60 VEGF-936:TNF-863:TNF238:IL4-590:IL10-1082 CC-CA-GGCC-AA 16 206 7,77 0 124 0,00 21,57 1,28–362,77 0,0008 100,00 VEGF-936:TNF-308:TNF238:IL6-174:IL10-592 CC-GA-GGGG-CC 13 210 6,19 2 240 0,83 7,85 1,75–35,22 0,0024 99,17 VEGF2578:TNF-308:TNF238:IL4-590:IL6174:IL10-592 CA-GA-GG-CCGG-CC 6 202 2,97 0 275 0,00 18,23 1,02–325,44 0,0055 100,00 VEGF-936:TNF-863:TNF308:TNF-238:IL4590:IL10-1082 CC-CA-GG-GGCC-AA 15 206 7,28 0 124 0,00 20,15 1,20–339,90 0,0015 100,00 VEGF-936:TNF-863:TNF308:TNF-238:IL6174:IL10-592 CC-CC-GA-GGGG-CC 12 210 5,71 1 240 0,42 14,48 1,87–112,37 0,0009 99,58 Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
Сахарный диабет 7 3/2012 Генетика и двустороннему варианту точного метода Фишера для четырехпольных таблиц [25]. Результаты и их обсуждение Анализ распределения отдельных аллелей гена VEGF в точках полиморфизма А-2578С и С+936Т в нашей выборке европеоидов России не выявил существенных различий в зависимости от наличия СД2. Характер распределения всех генотипов соответствовал распределению ХардиВайнберга. Установлено лишь незначительное увеличение частоты встречаемости аллеля А с соответствующим снижением частоты аллеля С в точке полиморфизма 2578 среди пациентов с СД2 (OR=1,3, CI95%: 1,01–1,6, р=0,0485). Частоты генотипов достоверно не различались и при исследовании комбинаций обоих полиморфизмов. Ранее сообщалось об отсутствии ассоциаций аллелей и генотипов VEGF с СД2 [26]. Гораздо более выраженные различия между группами здоровых и больных СД2 обнаружены при анализе распределения комбинированных генетических признаков, в состав которых входят генотипы одного или обоих полиморфизмов гена VEGF. Комплексный анализ частот встречаемости генотипов VEGF в точках полиморфизма А-2578С и С+936Т в сочетании с вариантами генов IL1B С-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 A-592C и А-1082G, а также TNFA G-238C, A-308G и A-863C, выявил 579 комбинированных генетических признаков, частота которых оказалась различна в группах здоровых и больных СД2 с уровнем достоверности различий по двустороннему критерию Фишера р<0,05. В целях повышения информативности анализируемых признаков и приближения Таблица 2 Комбинации генотипов VEGF с генотипами цитокинов, ассоциированные с резистентностью к развитию СД2 Полиморфизмы Комбинации генотипов СД2 Контроль OR OR’s 95%CI P(tmF2) Sp n N % n N % VEGF2578:IL10-1082 CA-AG 31 209 14,83 39 129 30,23 0,40 0,24–0,69 0,0009 85,17 VEGF2578:TNF-238:IL4590:IL10-592 CA-GG-CT-CC 12 202 5,94 41 282 14,54 0,37 0,19–0,73 0,0029 94,06 VEGF2578:IL1B-31:IL4590:IL10-1082 CC-TC-CT-AG 0 203 0,00 7 126 5,56 0,04 0,00–0,69 0,0011 100,00 VEGF-936:IL1B-31:IL101082:IL10-592 CT-TC-AG-CC 0 210 0,00 8 121 6,61 0,03 0,00–0,55 0,0003 100,00 VEGF2578:VEGF-936:TNF308:IL4-590:IL6-174 CA-CT-GGCC-GC 0 203 0,00 11 249 4,42 0,05 0,00–0,87 0,0014 100,00 VEGF2578:VEGF-936:TNF308:IL10-1082:IL10-592 CA-CT-GGAG-CC 1 208 0,48 8 123 6,50 0,07 0,01–0,56 0,0019 99,52 VEGF2578:VEGF-936:IL1B31:IL4-590:IL10-1082 CC-CC-TC-CT-AG 0 203 0,00 6 120 5,00 0,04 0,00–0,78 0,0024 100,00 VEGF2578:VEGF-936:IL4590:IL6-174:IL10-592 CC-CC-CC-CC-CC 0 202 0,00 10 246 4,07 0,06 0,00–0,96 0,0026 100,00 VEGF2578:TNF-308:IL1B31:IL4-590:IL10-1082 CC-GG-TCCT-AG 0 203 0,00 6 126 4,76 0,05 0,00–0,82 0,0029 100,00 VEGF2578:TNF-238:IL1B31:IL4-590:IL10-1082 CC-GG-TCCT-AG 0 203 0,00 7 126 5,56 0,04 0,00–0,69 0,0011 100,00 VEGF-936:TNF-863:TNF308:IL6-174:IL10-1082 CT-CC-GGGC-AG 0 212 0,00 6 123 4,88 0,04 0,00–0,76 0,0023 100,00 VEGF-936:TNF-308:TNF238:IL1B-31:IL4-590 CC-GG-GGTC-CT 4 206 1,94 20 244 8,20 0,22 0,07–0,66 0,0029 98,06 VEGF-936:TNF-308:IL1B31:IL10-1082:IL10-592 CT-GG-TCAG-CC 0 210 0,00 8 121 6,61 0,03 0,00–0,55 0,0003 100,00 VEGF-936:TNF-238:IL1B31:IL10-1082:IL10-592 CT-GG-TCAG-CC 0 210 0,00 8 121 6,61 0,03 0,00–0,55 0,0003 100,00 VEGF2578:VEGF936:TNF-308:TNF-238:IL4590:IL6-174 CA-CT-GG-GGCC-GC 0 203 0,00 10 242 4,13 0,05 0,00–0,93 0,0024 100,00 VEGF2578:VEGF936:TNF-238:IL1B-31:IL4590:IL10-1082 CC-CC-GG-TCCT-AG 0 203 0,00 6 120 5,00 0,04 0,00–0,78 0,0024 100,00 VEGF2578:TNF-308:TNF238:IL1B-31:IL4590:IL10-1082 CC-GG-GG-TCCT-AG 0 203 0,00 6 126 4,76 0,05 0,00–0,82 0,0029 100,00 VEGF-936:TNF-308:TNF238:IL1B-31:IL101082:IL10-592 CT-GG-GG-TCAG-CC 0 210 0,00 8 121 6,61 0,03 0,00–0,55 0,0003 100,00 В таблицах: n – число носителей комбинаций генотипов; N – общее число обследованных; % – частота встречаемости комбинаций генотипов; OR – отношение шансов; OR’s 95%CI – 95% доверительный интервал для OR; P(tmF2) – значения P разности частот встречаемости комбинаций генотипов в группах сравнения по двустороннему варианту точного метода Фишера; Sp – специфичность в %. Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
3/2012 Сахарный диабет Генетика расчетных популяционных показателей к результатам, которые могут использоваться в персонализированной медицине, далее был проведен анализ встречаемости комбинированных генетических признаков со значимостью различий p<0,002 (табл. 1, 2). Данному уровню достоверности соответствовали 52 признака: частота 34 из них была повышена среди пациентов с СД2, частота 18 признаков, напротив, оказалась пониженной. Среди всех позитивно ассоциированных с СД2 комбинированных генетических признаков обращает внимание высокая частота встречаемости гомозиготных вариантов генотипов VEGF в обеих точках полиморфизма (табл. 1). Их общая доля среди всех признаков, ассоциированных с СД2, составила 70,6%, тогда как среди здоровых лиц преобладали гетерозиготные варианты. Среди гомозиготных вариантов гена VEGF в большинстве случаев (83,3%) выявлены варианты СС в обеих точках полиморфизма, ассоциированные с повышенным уровнем продукции фактора [9]. Среди генов цитокинов, которые совместно с вариантами генов VEGF вошли в состав позитивно ассоциированных с СД2 комбинированных генетических признаков, обращает на себя внимание чрезвычайно высокая доля гомозиготных вариантов АА в точке 1082 и СС в точке -592 гена IL10. Эти варианты выявлялись в составе подавляющего большинства генетических комбинаций (94,1% случаев). Указанные генотипы ассоциированы с высоким уровнем продукции IL-10 – цитокина с противовоспалительными и антиангиогенными свойствами. Таким образом, в генотипе женщин с СД2 одновременно присутствуют варианты генов, способствующие высокой продукции проангиогенного/ провоспалительного и антиангиогенного/противовоспалительного фактора (VEGF и IL-10). Такие комбинации не характерны для регуляции воспаления и ангиогенеза в норме: у обследованных нами 374 женщин без СД2 они встречались крайне редко. О наличии генетических особенностей регуляции ангиогенеза и воспалительного ответа у пациентов с СД2 свидетельствуют и результаты анализа полиморфизма генов других цитокинов. В составе ассоциированных с СД2 генетических комбинаций в позиции 590 гена IL4 выявлялся исключительно гомозиготный вариант СС. Данный вариант ассоциирован с низким уровнем продукции IL4 – противовоспалительного цитокина, обладающего выраженной способностью ингибировать ангиогенез [27]. В большей части генетических комбинаций обнаружены гомозиготные варианты GG или СС в полиморфных позициях регуляторных участков А-238G, А-308G и А-863C гена TNFA, которые ассоциируются с низким уровнем продукции фактора. Известно, что ангиотропное действие TNFα обладает дозозависимым эффектом – в низких дозах проявляется проангиогенное влияние, в высоких дозах оно сменяется на антиангиогенное [28]. Практически во всех случаях в составе комбинаций у больных СД2 встречался гомозиготный вариант GG в позиции -174 гена IL6, ассоциированный с высоким уровнем продукции цитокина. Известно, что IL6 обладает выраженной провоспалительной активностью, а также способен стимулировать ангиогенез путем активации продукции VEGF [29]. Полученные данные согласуются с результатами других исследований, показавших ассоциацию аллели G в позиции -174 гена IL6 c развитием СД2 [13, 14]. В составе комбинированных генетических признаков, негативно ассоциированных с СД2, гомозиготные варианты гена VEGF встречались в равном соотношении с гетерозиготными генотипами (табл. 2). То же можно отнести к соотношению числа гомои гетерозиготных вариантов гена IL10. Среди генотипов IL4 и IL6 преобладали гетерозиготные варианты. Частота аллельных вариантов гена TNFA в составе комбинаций, позитивно и негативно ассоциированных с СД2, достоверно не различалась; в обеих группах преобладали варианты, связанные с низким уровнем продукции фактора. Существенным отличием группы генетических признаков, негативно ассоциированных с СД2, от группы позитивно ассоциированных признаков, оказалось наличие значительного числа гетерозиготных вариантов гена IL1B в позиции -31 C/T. Молекула IL1β, синтез которой кодируется этим геном, обладает выраженным провоспалительным и проангиогенным действием [30]. Представленные данные свидетельствуют о существенных различиях частот встречаемости комбинаций генотипов VEGF и других цитокинов, регулирующих интенсивность воспалительного ответа и ангиогенез, между больными СД2 и здоровыми женщинами. Выделенные комбинации в целом ряде случаев полностью отсутствуют у здоровых женщин и широко распространены среди женщин больных СД2. Высокая степень достоверности различий частот генетических комбинаций у больных и в контроле приближает их по информативности к так называемым «биологическим или генетическим маркерам» предрасположенности или резистентности к развитию СД2, что делает их использование перспективным в медицинской практике. Заключение Комбинации аллельных вариантов гена VEGF в точках полиморфизма A-2578С и C+936Т с генотипами IL1B C-31Т, IL4 С-590Т, IL6 G-174C, IL10 А-592C и А-1082G, TNFA A-238G, A-308G и A-863C могут служить генетическими маркерами высокого и низкого риска развития СД2 у женщин европеоидного происхождения. В составе генетических комбинаций, ассоциированных с СД2, присутствует большое число гомозиготных вариантов генов цитокинов, влияющих на уровень экспрессии их продуктов и, тем самым, определяющих особенности течения воспалительных процессов и состояние ангиогенеза. Это свидетельствует о необходимости комплексного изуче ния роли семейства цитокинов и ростовых факторов с проангиогенной и провоспалительной активностью в патогенезе развития и характера течения СД2, Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
Сахарный диабет 9 3/2012 Генетика с акцентом на молекулярногенетические механизмы контроля базового уровня продукции регуляторных факторов в организме каждого индивида. Такой подход позволяет использовать полученные индивидуальные характеристики в обосновании персонализированных подходов в диабетологии. Авторы декларируют отсутствие двойственности (конфликта) интересов, связанных с рукописью. 1. IDF Diabetes Atlas. Fifth edition. International Diabetes Federation. 2011. 2. Сунцов ЮИ, Болотская ЛЛ, Маслова ОВ, Казаков ИВ. Эпидемиология сахарного диабета и прогноз его распространенности в Российской Федерации. Сахарный диабет. 2011;(1):15–18. 3. Imamura M, Maeda S. Genetics of type 2 diabetes: the GWAS era and future perspectives [review]. Endocr J. 2011;58(9):723–739. Epub 2011 Jul 20. 4. The Pharmacogenomics Knowledge Base. Available from: http://www.pharmgkb.org/index.jsp. 5. Willer CJ, Bonnycastle LL, Conneely KN, Duren WL, Jackson AU, Scott LJ, Narisu N, Chines PS, Skol A, Stringham HM, Petrie J, Erdos MR, Swift AJ, Enloe ST, Sprau AG, Smith E, Tong M, Doheny KF, Pugh EW, Watanabe RM, Buchanan TA, Valle TT, Bergman RN, Tuomilehto J, Mohlke KL, Collins FS, Boehnke M. Screening of 134 single nucleotide polymorphisms (SNPs) previously associated with type 2 diabetes replicates association with 12 SNPs in nine genes. Diabetes. 2007 Jan;56(1):256–264. 6. Voight BF, Scott LJ, Steinthorsdottir V. MAGIC investigators; GIANT Consortium. Twelve type 2 diabetes susceptibility loci identified through large-scale association analysis. Nat. Genet. 2010 Jul;42(7):579–589. 7. Garcia C, Feve B, Ferré P, Halimi S, Baizri H, Bordier L, Guiu G, Dupuy O, Bauduceau B, Mayaudon H. Diabetes and inflammation: fundamental aspects and clinical implications. Diabetes Metab. 2010 Nov;36(5):327–338. 8. Fadini GP, Sartore S, Agostini C, Avogaro A. Significance of endothelial progenitor cells in subjects with diabetes. Diabetes Care. 2007 May;30(5):1305–1313. 9. Шевченко АВ, Голованова ОВ, Коненков ВИ, Бородин ЮИ, Любарский МС. Функциональный полиморфизм генов фактора роста сосудистого эндотелия VEGF. Лимфология. Новосибирск: Издательский дом «Манускрипт»; 2012. С. 280–303. 10. Abhary S, Hewitt AW, Burdon KP, Craig JE. A systematic metaanalysis of genetic association studies for diabetic retinopathy. Diabetes. 2009 Sep;58(9): 2137–2147. 11. Шварц В. Воспаление жировой ткани. Часть 2. Патогенетическая роль при сахарном диабете 2 типа. Пробл. эндокринол. 2009;55(5):43–48. 12. Смольникова МВ, Коненков ВИ. Клиническая иммуногенетика заболеваний человека. Медицинская иммунология. 2001;3(3):379–388. 13. Ho KT, Shiau MY, Chang YH, Chen CM, Yang SC, Huang CN. Association of interleukin-4 promoter polymorphisms in Taiwanese patients with type 2 diabetes mellitus. Metabolism. 2010 Dec;59(12):1717–1722. 14. Illig T, Bongardt F, Schöpfer A, Müller-Scholze S, Rathmann W, Koenig W, Thorand B, Vollmert C, Holle R, Kolb H, Herder C. Kooperative Gesundheitsforschung im Raum Augsburgю. Cooperative Research in the Region of Augsburg. Significant association of the interleukin-6 gene polymorphisms C-174G and A-598G with type 2 diabetes. J. Clin. Endocrinol. Metab. 2004 Oct;89(10):5053–5058. 15. Huth C, Heid IM, Vollmert C, Gieger C, Grallert H, Wolford JK, Langer B, Thorand B, Klopp N, Hamid YH, Pedersen O, Hansen T, Lyssenko V, Groop L, Meisinger C, Döring A, Löwel H, Lieb W, Hengstenberg C, Rathmann W, Martin S, Stephens JW, Ireland H, Mather H, Miller GJ, Stringham HM, Boehnke M, Tuomilehto J, Boeing H, Möhlig M, Spranger J, Pfeiffer A, Wernstedt I, Niklason A, López-Bermejo A, Fernández-Real JM, Hanson RL, Gallart L, Vendrell J, Tsiavou A, Hatziagelaki E, Humphries SE, Wichmann HE, Herder C, Illig T. IL6 gene promoter polymorphisms and type 2 diabetes: joint analysis of individual participants' data from 21 studies. Diabetes. 2006 Oct; 55(10):2915–2921. 16. Qi L, van Dam RM, Meigs JB, Manson JE, Hunter D, Hu FB. Genetic variation in IL6 gene and type 2 diabetes: tagging-SNP haplotype analysis in large-scale case-control study and metaanalysis. Hum. Mol. Genet. 2006;15 (11):1914–1920. 17. Scarpelli D, Cardellini M, Andreozzi F, Laratta E, Hribal ML, Marini MA, Tassi V, Lauro R, Perticone F, Sesti G. Variants of the interleukin-10 promoter gene are associated with obesity and insulin resistance but not type 2 diabetes in caucasian italian subjects. Diabetes. 2006 May;55(5):1529–1533. 18. Kubaszek A, Pihlajamäki J, Komarovski V, Lindi V, Lindström J, Eriksson J, Valle TT, Hämäläinen H, Ilanne-Parikka P, KeinänenKiukaanniemi S, Tuomilehto J, Uusitupa M, Laakso M. Finnish Diabetes Prevention Study. Promoter polymorphisms of the TNF-alpha (G-308A) and IL-6 (C-174G) genes predict the conversion from impaired glucose tolerance to type 2 diabetes: the Finnish Diabetes Prevention Study. Diabetes. 2003 Jul;52(7):1872–1876. 19. Dalziel B, Gosby AK, Richman RM, Bryson JM, Caterson ID. Association of the TNF-alpha -308 G/A promoter polymorphism with insulin resistance in obesity. Obes. Res. 2002 May;10(5):401–407. 20. Zeggini E, Groves CJ, Parkinson JR, Halford S, Owen KR, Frayling TM, Walker M, Hitman GA, Levy JC, O'Rahilly S, Hattersley AT, McCarthy MI. Large-scale studies of the association between variation at the TNF/LTA locus and susceptibility to type 2 diabetes. Diabetologia. 2005 Oct;48(10):2013–2017. 21. Susa S, Daimon M, Sakabe J, Sato H, Oizumi T, Karasawa S, Wada K, Jimbu Y, Kameda W, Emi M, Muramatsu M, Kato T. A functional polymorphism of the TNF-alpha gene that is associated with type 2 DM. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008 May 9;369(3):943–947. 22. Banyasz I, Szabo S, Bokodi G, Vannay A, Vasarhelyi B, Szabo A, Tulassay T, Rigo J. Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor in severe preeclampsia. Mol. Hum. Reprod. 2006 Apr;12(4):233–236. 23. Kim JK, Oh D, Kwak SY, Han JH, Chung YS, Kim NK. Genetic Polymorphism of Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF C936T) in the Korean Population. Korean J. Biol. Sci. 2003;(7):261–264. 24. Вейр Б. Анализ генетических данных. Дискретные генетические признаки. Пер. с англ. М: Мир; 1995. 25. Гланц С. Медико-биологическая статистика. Пер. с англ. М: Практика; 1998. Список литературы Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
3/2012 Сахарный диабет Генетика 26. Freathy RM, Weedon MN, Shields B, Hitman GA, Walker M, McCarthy MI, Hattersley AT, Frayling TM. Functional variation in VEGF is not associated with type 2 diabetes in a United Kingdom Caucasian population. JOP. 2006 May;7(3):295–302. 27. Haas CS, Amin MA, Allen BB, Ruth JH, Haines GK, Woods JM, Koch AE. Inhibition of angiogenesis by interleukin-4 gene therapy in rat adjuvant-induced arthritis. Arthritis Rheum. 2006 Aug;54(8):2402–2414. 28. Sainson RC, Johnston DA, Chu HC, Holderfield MT, Nakatsu MN, Crampton SP, Davis J, Conn E, Hughes CC. TNF primes endothelial cells for angiogenic sprouting by inducing a tip cell phenotype. Blood. 2008 May 15; 111(10):4997–5007. 29. Huang S, Wu M, Shun C, Wang H, Lin M. Interleukin-6 increases vascular endothelial growth factor and angiogenesis in gastric carcinoma. J. Biomed. Sci. 2004 Jul– Aug;11(4):517–527. 30. Voronov E, Carmi Y, Apte RN. Role of IL-1-mediated inflammation in tumor angiogenesis. Adv. Exp. Med. Biol. 2007;601:265–270. Коненков Владимир Иосифович д.м.н., академик РАМН, руководитель лаборатории клинической иммуногенетики, директор, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск Шевченко Алла Владимировна к.б.н., с.н.с. лаборатории клинической иммуногенетики, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск Прокофьев Виктор Федорович к.м.н., в.н.с. лаборатории клинической иммуногенетики, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск E-mail: vprok@ngs.ru Климонтов Вадим Валерьевич д.м.н., в.н.с. лаборатории клинической иммуногенетики, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск Королев Максим Александрович к.м.н., зам. директора, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск Фазуллина Ольга Николаевна врач-эндокринолог, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск Лапсина Светлана Александровна врач-эндокринолог, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск Королева Елена Анатольевна к.м.н., врач-эндокринолог, ФГБУ НИИ клинической и экспериментальной лимфологии, Новосибирск DMjournal.ru/ru/articles/catalog/2012_3/2012_3_4 Сахарный диабет. 2012;(3):4–10
Сахарный диабет 11 3/2012 Генетика егодня не подвергается сомнению тот факт, что во всех (исследованных) популяциях человека основной компонент наследуемой чувствительности к возникновению сахарного диабета 1 типа (СД1) ассоциирован с локусом HLA – human leukocyte antigen – класса II. Выявлены как предрасполагающие, так и протективные аллели генов этого локуса (DRB1*, DQA1*, DQB1*) и/или комбинации аллелей (DRB1 – DQ гаплотипы). Определены характерные для европеоидов и ориентов наиболее диабетогенные HLA класса II аллели и гаплотипы [1]. При этом наблюдается существенная межэтническая и даже межпопуляционная разница как спектров диабетогенных специфичностей, так и степеней их ассоциации с заболеванием. Одна из причин этого явлеАссоциация HLA–DQ транс-кодируемых гетеродимеров с сахарным диабетом 1 типа в бурятской этнической группе 1Иванова О.Н., 1Прокофьев С.А., 2Бардымова Т.П. 1ФГБУ Эндокринологический научный центр, Москва (директор – академик РАН и РАМН И.И. Дедов) 2ГБОУ ДПО Иркутский институт усовершенствования врачей, Иркутск (ректор – член-корр. РАМН, проф. А.А. Дзизинский) Цель . Поиск наиболее выраженных HLA класса II маркеров сахарного диабета 1 типа (СД1) в бурятской этнической группе, анализ роли транс-кодируемых HLA-DQ гетеродимеров. Материалы и методы . Методом случай-контроль обследовано 74 больных СД1 и 61 здоровый пациент. Идентификацию аллелей генов проводили методом мультипраймерной аллель-специфической ПЦР. Ассоциация признака с заболеванием определялась величиной показателя соотношения шансов (OR). Расчеты выполняли при помощи компьютерных программ StatSoft STATISTICA 6. Результаты . Показано, что по частотам высокодиабетогенных расо-специфичных HLA класса II гаплотипов бурятская этническая группа занимает промежуточное положение между монголоидами и европеоидами, и ни один из этих гаплотипов не ассоциирован с СД1. Выявлена статистически значимая ассоциация СД1 с фенотипом DQA1*0301+DQB1*0201+. В 77% случаев этот фенотип представлен транс-кодируемыми аллелями. На популяционном уровне наиболее чувствительным маркером заболевания является фенотип DQA1*0301+DQB1*0302+ или/и *0201+. Он обнаружен у 43% больных против 11,5% в контрольной группе (OR=5,9; рс=0,0094). Наиболее специфичным маркером является фенотип DQA1*0301+/ DQВ1*0201 и DQВ1*0302. Он обнаружен у 16% больных против 0% в контрольной группе (OR=11,8; рс=0,047). Заключение . HLA-опосредованный риск возникновения СД1 в бурятской этнической группе детерминируется транскодируемыми DQ гетеродимерами. Ключевые слова: буряты, этническая группа, HLA класса II генотип, DQ-гетеродимеры Association of HLA-DQ trans-heterodimers with prevalence of type 1 diabetes mellitus in Buryat ethnic group 1Ivanova O.N., 1Prokof'ev S.A., 2Bardymova T.P. 1Endocrinology Research Centre, Moscow, Russian Federation 2Irkutsk State University of Advanced Medical Training, Irkutsk , Russian Federation Aims . Search for the most pronounced HLA II markers of type 1 diabetes mellitus (T1DM) in Buryat ethnic group and analysis of HLA-DQ trans-heterodimers. Materials and methods . Case control design was applied for assessment of 74 patients with T1DM and 61 healthy individuals. Allele identification was performed with multi-primer allele-specific PCR technique. Association of genetic markers with pathology was evaluated according to odds ratio (OR) index. All calculations were performed with StatSoft and STATISTICA 6 software applications. Results . We show that regarding race-specific highly diabetogenic HLA class II haplotypes Buryat ethnic group holds intermediate position between Mongoloids and Caucasians and none of those haplotypes are associated with T1DM. We revealed a statistically significant association of T1DM with DQA1*0301+DQB1*0201+ phenotype represented by trans-coding alleles in 77% of cases. On population level DQA1*0301+DQB1*0302+ or *0201+ phenotype is found to be the most sensitive marker. It was registered in 43% of patients with T1DM against 11.5% of controls (OR 5.9; рс=0.0094). DQA1*0301+/DQВ1*0201 and DQВ1*0302 phenotype is the most specific marker, registered in 16% of patients, but not found in controls (OR 11.8; рс=0.047). Conclusions . HLA-mediated risk for development of T1DM in Buryat ethnic group is determined by HLA-DQ trans-heterodimers. Key words: buryat, ethnic group, HLA II genotype, DQ-heterodimers С Сахарный диабет. 2012;(3):11–17
3/2012 Сахарный диабет Генетика ния – вариабельность генетических фонов популяций. Различия фоновых частот HLA класса II аллелей/гаплотипов обусловлены рядом факторов, в числе которых подверженность некоторых HLA генов сильному давлению естественного отбора на популяционном уровне и закрепление в процессе эволюции разных рас (популяций) популяционноспецифических гаплотипов, появившихся в результате редких эпизодов рекомбинации внутри локуса HLA класса II [2]. В европеоидных популяциях частоты высокопредрасполагающих к СД1 гаплотипов DRB1*0301DQB1*0201 и DRB1*0401-DQB1*0302 достигают 11% и 6,3% соответственно, тогда как в азиатских популяциях частоты этих гаплотипов не превышают 1%. Наиболее предрасполагающими гаплотипами в азиатских популяциях являются DRB1*0405-DQB1*0401 и DRB1*0901-DQB1*0303 с частотой распространения 12% и 4,5% соответственно, а в европеоидных популяциях частоты этих гаплотипов не превышают 1% [1, 3]. Было показано, что сцепление генов HLA класса II в азиатских популяциях таково, что протективные у европеоидов HLA-DR4 аллели (DRB1*0403 или *0406) сцеплены с предрасполагающим DQ аллелем (DQB1*0302), в то же время высокопредрасполагающие DR4 аллели (DRB1*0401, *0402, *0405) сцеплены с нейтральным/ протективным DQ аллелем (DQB1*0401) [4]. По мнению авторов [4], сцепление предрасполагающих DRB1* аллелей с протективными DQB1* аллелями и наоборот может быть одним из факторов, объясняющих низкую заболеваемость и распространенность СД1 в азиатских популяциях. Монголоидные популяции Восточной Азии (Япония, Китай, Корея) характеризуются низкой заболеваемостью. В Японии на протяжении 1993–2001 гг. этот показатель изменялся несущественно и составил в среднем 2,37 на 100 тысяч населения в год [3]. Распространенность СД1 у представителей монголоидной расы тоже невысока и составляет 0,01–0,02% [1, 5]. Это в 10–30 раз меньше, чем в европеоидных этнических группах. К монголоидной лингвистической группе относится и бурятская популяция. Показано, что бурятская этническая группа, как и многие монголоидные популяции, отличается низкой распространенностью и заболеваемостью СД1 – 0,024% и 0,73 на 100 тысяч населения в год соответственно [6]. Молекулярногенетические исследования, проведенные в 1995 г., основывающиеся на определении пятилокусных гаплотипов HLA класса II и трехлокусных гаплотипов HLA класса I, обнаружили гаплотипы, характерные для монголоидов, европеоидов, америндов и только бурят. Было показано, что бурятская популяция относится к монголоидным группам СевероВосточной Таблица 1 Частоты расо-специфичных высокодиабетогенных HLA класса II гаплотипов у европеоидов, монголоидов и в бурятской популяции, (%) [1, 8] Гаплотип Монголоиды Европеоиды Буряты DRB1* DQB1* 17(03) 0201 <1 11 7,4 0401 0302 <1 6,3 2,5 0405 0401 12 <1 4,9 0901 0303 4,5 <1 4,9 Таблица 2 Сравнение частот HLA класса II гаплотипов Гаплотип K 2n=122 СД1 2n=148 р OR 95% CI EF для OR>1 PF для OR<1 DRB1* DQA1* DQB1* кол-во % кол-во % 01 0101 0501 2 1,6 9 6,1 * 04 0301 0201 1 0,8 5 3,4 * 04 0301 0301 12 9,8 11 7,4 * 04 0301 0302 3 2,5 13 8,8 0,037 3,82 1,06–13,7 EF=0,06 04 0301 0401/2 6 4,9 10 6,8 * 07 0201 0201 9 7,4 14 9,5 * 08 0301 0302 1 0,8 9 6,1 0,02 7,83 0,978–62,7 EF=0,05 08 0401 0401/2 5 4,1 5 3,4 * 09 0301 0303 5 4,1 8 5,4 * 11 0501 0301 15 12,3 7 4,7 0,04 0,35 0,139–0,899 PF=0,07 12 0501 0301 5 4,1 6 4,1 * 13 0102 0602-8 10 8,2 7 4,7 * 13 0103 0602-8 4 3,3 4 2,7 * 13 0501 0301 3 2,5 5 3,4 * 15 0102 0602-8 12 9,8 4 2,7 0,018 0,25 0,08–0,81 PF=0,07 15 0103 0601 4 3,3 2 1,4 * 17(03) 0501 0201 9 7,4 16 10,8 * другие 18 14,7 13 8,8 ∑ 122 100 148 100 К – контрольная группа; СД1 – группа больных; n – число генотипов; OR (odds ratio) – соотношение шансов; 95% CI – доверительный интервал; р – статистическая достоверность; * – p>0,05; EF – этиологическая фракция; PF – превентивная фракция; ∑ – сумма. Сахарный диабет. 2012;(3):11–17
Сахарный диабет 13 3/2012 Генетика Азии [7]. Что касается распределения частот «классических» высокопредрасполагающих к СД1 расоспецифичных гаплотипов, то можно сказать, что бурятская этническая группа занимает промежуточное положение между монголоидами и европеоидами (табл. 1) [1, 8]. Проведенное ранее исследование ассоциации генов локуса HLA класса II с СД1 в бурятской этнической группе выявило ряд аллелей, разница частот которых в двух группах достигает 16% [8]. Однако с поправкой на множественность сравнений (Бонферрони) статистическая значимость отличий сохраняется лишь для двух аллелей (DQA1*0301 OR=2,2; рс=0,042 и DQB1*0302 OR=5,15; рс=0,03). Было идентифицировано больше 30 различных HLA DRB1*-DQA1*-DQB1* гаплотипов. В таблице 2 представлены лишь те гаплотипы, частота которых хотя бы в одной из групп больше 3%. Выявился ряд гаплотипов, разница частот которых в двух группах лежит в диапазоне 5,3–7,6% (р<0,05, но рс>0,05). Два из них являются протективными во многих популяциях. Это DRB1*11DQA*0501-DQB1*0301 (OR=0,35; р=0,04) и DRB1*15DQA*0102-DQB1*0602-8 (OR=0,25; р=0,018). Гаплотип DRB1*04-DQA*0301-DQB1*0302 (OR=3,82; р=0,037) относится к высокопредрасполагающим в европеоидных популяциях, а DRB1*08-DQA*0301-DQB1*0302 (OR=7,8; р=0,02) известен как предрасполагающий к возникновению СД1 в детском возрасте в японской популяции [9]. С поправкой на множественность сравнений ни один из вышеперечисленных гаплотипов не является достоверно ассоциированным с СД1 в бурятской этнической группе. Можно говорить лишь о существенном, но не значимом увеличении/уменьшении частот гаплотипов в группе больных, что может быть связано, вопервых, с величиной выборки, вовторых, с генетическими особенностями бурятской этнической группы. Возможно, что в бурятской популяции локусы вне HLA оказывают большее влияние на чувствительность к СД1, и/или генотип локуса HLA (а не отдельные аллели и гаплотипы) имеет большее значение в модуляции чувствительности к СД1. В ряде работ [10, 11] показано, что диабетогенность локуса HLA класса II определяется генотипом, и именно генотип авторы предлагают брать за основу при выявлении индивидуальной предрасположенности к СД1 и проведении первичной профилактики СД1 среди населения в целом. Цель данной работы – поиск наиболее выраженных HLA класса II маркеров СД1 в популяции бурят, проживающих в Бурятской Республике и УстьОрдынском Бурятском автономном округе, генотипопосредованных маркеров СД1, анализ роли транскодируемых HLA-DQ гетеродимеров. Материалы и методы Методом случайконтроль исследовано 135 человек бурятской национальности (буряты в третьем поколении), проживающих в Республике Бурятия и УстьОр дын ском Бурятском автономном округе. Из них 74 имеют СД1 (диагноз поставлен или подтвержден в клиниках г. УланУдэ и г. Иркутска) и 61 являются практически здоровыми (без аутоиммунных заболеваний и отягощенной наследственности по ним). Родственники из анализа исключались. Возраст больных колеблется от 1 года до 40 лет; возраст манифестации диабета – от 3 месяцев до 32 лет. Образцы крови предоставлены эндокринологами НЦ медицинской экологии ВСНЦ СО РАМН г. Иркутска. Геномную ДНК выделяли из лимфоцитов периферической крови фенольнохлороформной экстракцией после обработки протеиназой К. Идентификацию аллелей генов HLA проводили методом мультипраймерной аллельспецифичес кой полимеразной цепной реакции, используя наборы ЗАО «НПФ ДНКТехнология» (Россия). Обозначение специфичностей генов HLA соответствует общепринятой номенклатуре [12]. Всеми пациентами подписано информированное согласие. Частоты аллелей определяли методом простого счета. Частоты трехлокусных гаплотипов HLA класса II определяли, используя EM (ExpectationMaximization) алгоритм. Вне семейного анализа этот метод высокоэффективен для определения частот гаплотипов генов, находящихся в тесном сцеплении [13], в частности DRB1*, DQA1* и DQB1* [14]. Полученные данные подтверждались сравнением с известными группами сцепления генов локуса HLA класса II. Частоты гаплотипов, соответствие распределения равновесию ХардиВайнберга вычисляли с помощью программы Arlequin ver 3.01 [15]. Степень ассоциации признака с заболеванием определялась величиной показателя отношения шансов (OR – odd`s ratio) [16]. Приведены 95% доверительные интервалы для OR (95% CI – confidence intervals). Точный двусторонний критерий Фишера или χ2тест с поправкой Йетса на непрерывность использовали для оценки достоверности различий (р) в распределении частот признака. Для множественных сравнений вводилась поправка Бонферрони (рс). Значимыми считались отличия, для которых рс<0,05. Степень ассоциации признака с заболеванием на популяционном уровне EF (etiologic fraction) и PF (preventive fraction) определялась по формулам [17]. Расчеты выполняли при помощи компьютерных программ StatSoft, Inc. (2001), STATISTICA (data analysis software system), version 6.www.statsoft.com; Microsoft Office Excel2003. Результаты и обсуждение В нашем исследовании у 135 индивидуумов было выявлено 94 разных генотипа; 66 из них (70%) выявлены единожды. В группе здоровых генотип DRB1*04DQA1*0301-DQB1*0301/DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 встречается с максимальной частотой – 4,9%; частоты всех других генотипов не превышают 3,3%. В группе больных генотип DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0302/ DRB1*17(03)-DQA1*0501-DQB1*0201 встречается с максимальной частотой – 6,8%; частоты неуказанных в таблице генотипов не превышают 2,7%. Сахарный диабет. 2012;(3):11–17