Синтез фотохромного трансмембранного белка бактериородопсина галобактерией Halobacterium halobium
Бесплатно
Основная коллекция
Тематика:
Общая и неорганическая химия
Издательство:
Науковедение
Год издания: 2014
Кол-во страниц: 15
Дополнительно
Скопировать запись
Фрагмент текстового слоя документа размещен для индексирующих роботов
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 1 http://naukovedenie.ru 13TVN214 УДК 577.37 + 537.86 03.00.00 Биологические науки, 03.00.02 Биофизика Мосин Олег Викторович ФГОУ ВПО «Московский государственный университет прикладной биотехнологии» Россия, Москва Научный сотрудник, кандидат химических наук E-mail: mosin-oleg@yandex.ru Игнатов Игнат Научно-исследовательский Центр медицинской биофизики (НИЦМБ) Болгария, София1 Профессор, доктор наук E-mail: mbioph@dir.bg Синтез фотохромного трансмембранного белка бактериородопсина галобактерией Halobacterium halobium Аннотация: В данной статье сообщается о микропрепаративном микробиологическом синтезе природного фотопреобразующего белка бактериородопсина (выход 8–10 мг) фотоорганотрофной галобактерией Halobacterium halobium, способного преобразовывать световую энергию в электрохимическую энергию генерируемых протонов H+ и АТФ, что важно для наноиндустрии новых современных отечественных фотопреобразующих наноматериалов и биомолекулярной электроники. Рассмотрены основные технологические стадии выделения и очистки бактериородопсина. Белок выделен из пурпурных мембран обработкой бактериальной биомассы ультразвуком при 22 кГц, спиртовой экстракцией низкои высокомолекулярных примесей, клеточной РНК, каротиноидов и липидов с последующей солюбилизацией конечного продукта 0,5%-ном додецилсульфате натрия (ДДС-Na) и фракционированием метанолом. Гомогенность синтезируемого бактериородопсина исследованы комбинацией методов разделения и анализа белка, включая электрофорез в 12,5%-ном полиакриламидном (ПААГ) геле с 0,1%-ным ДДС-Na, гель-проникающую хроматографию на сефадексе G-200. Ключевые слова: Halobacterium halobium; пурпурные мембраны; бактериородопсин; биомолекулярная электроника. Идентификационный номер статьи в журнале 13TVN214 1 1111, Болгария, София, ул. Николая Коперника, д. 32
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 2 http://naukovedenie.ru 13TVN214 Введение Бактериородопсин был впервые выделен из клеточной мембраны экстремальной аэробной фотоорганотрофной палочковидной галобактерии Halobacterium halobium в 1971 году В. Стохениусом (США) и Д. Остерхельтом (ФРГ) [1]. Он представляет собой хромопротеид с молекулярной массой 26,7 кДа, связанный альдиминной связью с остатком лизина-216, который содержит в качестве хромоформной группы эквимолекулярную смесь 13-цис- и полностью 13-транс-ретинольного С20-каротиноида – аналога витамина А, определяющего пурпурно-красный цвет галобактерий. Наряду с бактериородопсином в клеточной мембране галофилов содержатся другие сопутствующие каротиноидные пигменты, основной из которых бактериоруберин, обусловливающий окраску галобактерий от розового до красного и красно-оранжевого цветов, что имеет для галофилов важное значение как средство защиты против избыточной радиации и солнечного излучения, так как для мест их обитания характерна высокая освещенность. Несмотря на изученность структуры и функций бактериородопсина, он остается в центре внимания биои нанотехнологии прежде всего благодаря своей высокой светочувствительности и разрешающей способности, и используется в молекулярной биоэлектронике как природный фотохромный материал для управляемых светом или электрическими импульсами модулей компъютерных и оптических систем [2]. Кроме того, бактериородопсин очень привлекателен как модельный объект для исследований, связанных с изучением функциональной активности и структурных свойств фотопреобразующих белков в составе искусственных нативных энерго- и фотопреобразующих мембран [3]. Природные фотопреобразующие наноматериалы также представляют большую ценность для коммерческой нано- и биотехнологии, микроэлектроники, биофотоники, а также биофизических исследований [4]. Например, бактериородопсин-содержащие нанопленки, полученные с использованием пурпурных мембран галобактерий, используются в качестве компонента в биомолекулярной электроники, использующей биоматериалы и принципы переработки информации биологическими объектами в вычислительной технике для создания электронных устройств. Впервые в мире такие пленки на основе молекул бактериородопсина были получены и исследованы в нашей стране в рамках проекта “Родопсин”, в ходе которого была продемонстрирована эффективность и перспективы использования наноматериалов “Биохром” в качестве фотохромных материалов для голографической записи и микроэлектронных устройств [5]. Эти наноматериалы обратимо изменяют свою структуру в ответ на физические воздействия и генерируют два дискретных состояния, подающихся измерению спектральными методами. Это определяет их дальнейшее использование в качестве логических вычислительных систем в биомолекулярной электронике. Так, на основе бактериородопсина был сконструирован фоторецептор с микроэлектродом из SnO2, состоящий из 64 ячеек (пикселей), размером 2,5×2,5 мм и напряжением 0,3–0,7 В. Для преобразования сигналов в данном фоторецепторе, слабый ток элементов (3–10 нА) усиливается до достижения) значения напряжения) от 1 до 10 В и затем подается на светоизлучающие диоды. Данная конструкция свидетельствует о возможности эффективной интеграции бактериородопсина в современные микроэлектронные системы. Основной задачей при изготовлении бактериородопсин-содержащих нанопленок является ориентация пурпурных мембран, между гидрофобными и гидрофильными средами, например, между водой и воздухом, как это распространено в природе. Как правило, для улучшения характеристик бактериородопсин-содержащих пленок, используется несколько слоев пурпурных мембран, которые наносятся на поверхность полимерного носителя – подложки и высушиваются в определенных условиях с сохранением своей природной структуры. Подложка, на которой сформирован препарат, может быть изготовлена из
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 3 http://naukovedenie.ru 13TVN214 натуральных и синтетических полимеров, гидрогелей, стекла, керамики, металлов и быть электропроводящей, многослойной, нести на себе функциональные подслои и т.д. Наилучшие показатели достигаются при изготовлении нанопленок на основе желатина. Это позволяет добиться высокой концентрации бактериородопсина (до 50 масс.%) в нанопленках, избежать агрегации фрагментов пурпурных мембран, а также разрушения бактериородопсина в процессе изготовления. Встроенные в желатиновую подложку фрагменты пурпурных мембран с бактериородопсином долговечны (время жизни 104 часов) и устойчивы к воздействию многих факторов, как при изготовлении, так и в процессе эксплуатации (колебания температуры, интенсивное воздействие светом с помощью лазера и др.). При высыхании пурпурные мембраны укладываются друг на друга, ориентируясь в плоскости подложки. Слой высохших мембран толщиной 1 мкм содержит около 200 монослоев. При освещении в таких сухих пленках регистрируется фотопотенциал 100–200 мВ, что совпадает с величиной мембранного потенциала живой клетки. Большой научно-практический интерес к получению препаратов бактериородопсина для реконструкции нанопленок, определил цель настоящей работы, связанной с разработкой условий выращивания галобактерий Halobacterium halobium и оптимизаций условий выделения чистого бактериородопсина в микропрепаративных количествах. Структура и механизм функционирования бактериородопсина По своей структуре и расположению в мембране клетки бактериородопсин относится к интегральным трансмембранным белкам (рис. 1), пронизывающим всю толщу клеточной мембраны, которая подразделяется на три фракции: желтую, красную и пурпурную. Содержащая бактериородопсин пурпурная фракция образует естественные двумерные кристаллы, которые можно исследовать с помощью электронной микроскопии и дифракционных методов анализа – рассеивания рентгеновского излучения, электронов и нейтронов на поверхности кристаллов пурпурных мембран. Этими методами было доказано существование в молекуле бактериородопсина семи спиральных белковых сегментов, в середине которых симметрично расположена хромофорная часть молекулы в виде остатка ретиналя.
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 4 http://naukovedenie.ru 13TVN214 Рис. 1. Расположение белковой части молекулы бактериородопсина и остатка ретиналя в клеточной мембране галобактерии Halobacterium halobium по данным компьютерного моделирования: белковые фрагменты молекулы бактериородопсина в виде 7 пронизывающих клеточную мембрану -спиральных сегментов обозначены латинскими буквами; темным цветом обозначены сегменты, ответственные за связывание остатка ретиналя в молекуле бактериородопсина с белковой частью молекулы Полипептидная цепь бактериородопсина состоит из 248 аминокислотных остатков, 67% которых являются гидрофобными [6], а 33% – гидрофильными остатками из аспарагиновой и глутаминовой кислотами, аргинина и лизина. Эти остатки играют важную структурно-функциональную роль в пространственной ориентации α-спиральных сегментов молекулы бактериородопсина, которая организована в пурпурной мембране упорядоченно в виде тримеров со средним диаметром около 0,5 мкм и толщиной 5–6 нм; каждый тример окружен шестью другими так, что образуется правильная гексагональная кристаллическая решетка. Отдельная молекула бактериородопсина состоит из семи находящихся в конформации α-спирали сегментов, расположенных в направлении, перпендикулярном
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 5 http://naukovedenie.ru 13TVN214 плоскости цитоплазматической мембраны. Гидрофобные домены представляют собой трансмембранные сегменты, а гидрофильные домены выступают из мембраны и соединяют отдельные внутримембранные α-спиральные сегменты белковой части молекулы бактериородопсина. Наряду с бактериородопсином пурпурные мембраны содержат липиды, каротиноиды и воду [7]. Пурпурные мембраны устойчивы к солнечному свету, воздействию кислорода, температуре более чем 80 0C (в воде) и до 140 0C (на воздухе), рН от 1–12, высокой концентрации NaCl (15–20 масс.%), действию большинства ферментов-протеаз, чувствительны к смесям полярных органических растворителей с водой, но устойчивы к неполярным растворителям типа гексана. Эти факторы имеют большое практическое значение для встраивания пурпурных мембран в полимерные наноматрицы c cохранением фотохимических свойств. Бактериородопсин выполняет в клетке галофилов функции светозависимого протонного насоса, перекачивающего протоны через мембрану клетки и создающего электрохимический градиент протонов Н+ на поверхности клеточной мембраны, энергия которого используется клеткой для синтеза АТФ в анаэробном фотосинтетическом фосфорилировании. Этот механизм синтеза АТФ получил название “бесхлорофильный фотосинтез” в отличие от реализуемого растениями фотосинтеза с участием хлорофилла. В этом механизме при каждом поглощении молекулой кванта света бактериородопсин обесцвечивается, вступая в цикл фотохимических превращений, в результате происходит высвобождение протона на внешней стороне мембраны и поглощение протона из внутриклеточного пространства. Вследствие этого между внутренней и внешней сторонами цитоплазматической мембраны устанавливается градиент концентрации протонов Н+ [8]. Механизм последующего переноса Н+ через мембрану клетки включает цепь водородных связей, образованных боковыми радикалами гидрофильных аминокислот и простирающихся через всю толщу белка. Протонная проводимость обеспечивается в том случае, если белок состоит из двух участков и содержит функциональную фотохромную группу, способную под воздействием кванта света изменять свое микроокружение и тем самым последовательно соединять и разъединять участки связывания и переноса Н+ через клеточную мембрану. Роль такого переносчика между двумя белковыми проводниками Н+, один из которых сообщается с внешней, а другой – с цитоплазматической поверхностью мембраны клетки, играет ретиналь, связанный альдиминной связью (как в зрительных пигментах животных [9]) с остатком лизина-216 белкового фрагмента молекулы бактериородопсина. Ретиналь имеет 13-трансконформацию и располагается в мембранном туннеле между белковыми α-сегментами, блокируя поток протонов. При поглощении кванта света происходит обратимая световая фотоизомеризация 13-Z-БР (макс = 548 нм) в all-E-БР (макс = 568 нм) [10], инициирующая каскад быстрых фотохимических реакций продолжительностью от 3 миллисекунд до 1 пикосекунды, с образованием промежуточных интермедиантов J625, К590, L550, М412, N560, и O640 с последующим отрывом Н+ от ретинального остатка бактериородопсина и его присоединением со стороны цитоплазмы (рис. 2). В этом процессе молекула ретиналя изменяет свою конфигурацию в мембранном туннеле, формируя канал трансмембранного переноса протонов из цитоплазмы во внешнюю среду, и переносит протон Н+ с внутренней цитоплазматической мембраны на внешнюю мембрану клетки. При этом протон из ретинального остатка переносится на остаток Асп-85, после чего образовавшаяся вакансия заполняется протоном, перешедшим с Асп-96. В результате между внутренней и внешней поверхностью мембраны образуется градиент концентрации Н+, приводящий к тому, что при освещении светом клетки начинают синтезировать АТФ, т.е. преобразуют энергию света в химическую энергию связей. Этот процесс обратим, и в темноте протекает в обратном направлении, когда бактериородопсин самопроизвольно возвращается в исходную форму [10]. Таким образом, молекула бактериородопсина ведет себя как фотохромный переносчик с малым временем релаксации – переходом из возбужденного состояния в основное.
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 6 http://naukovedenie.ru 13TVN214 Оптические и динамические характеристики бактериородопсина изменяются в зависимости от условий получения пурпурных мембран и составом полимерной матрицы. Рис. 2. Схема фотохимического цикла молекулы бактериородопсина (водная суспензия, рН 7,2, 20 0С). Латинские цифры J, K, L, M, N, O обозначают спектральные интермедианты бактериородопсина. IM и IIМ обозначают спектральные интермедианты мета бактериородопсина с протонированной и депротонированной альдиминной связью. Верхние индексы “c” и “t” относятся к циклам 13-цис- и 13-транс-производных бактериородопсина (БР), “L” и “D” обозначают световую и темновую формы бактериородопсина. Нижние индексы соответствуют положению максимума поглощения интермедиаторов фотоцикла (в нм). Символами 13-Z и all-E показаны изомеры бактериородопсина. hv – квант света. Продолжительности реакций измерены в мс (миллисекундах), мкс (микросекундах) и пкс (пикосекундах) Биосинтез бактериородопсина Технология получения бактериородопсина заключается в культивировании галобактерий на жидких синтетических средах (с 1520 масс.% NaCl), содержащих аминокислоты, или на природных средах с пептонами смесями полипептидов и аминокислот, получаемыми из продуктов неполного гидролиза сухого молока или мяса животных под действием протеолитических ферментов (пепсин, трипсин), или на белкововитаминном концентрате (БВК) дрожжей, с последующим выделением бактериородопсина из пурпурных мембран клеток комбинацией методов физико-химического разделения.
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 7 http://naukovedenie.ru 13TVN214 Для биосинтеза бактериородопсина использовали мутантный каротиноидсодержащий штамм экстремальных фотоорганотрофных галобактерий Halobacterium halobium ЕТ 1001, полученный из коллекции культур МГУ. Штамм модифицирован селекцией отдельных бактериородопсин-синтезирующих колоний пурпурно-красного цвета на твердой (2 %-ный агар) пептоновой среде с 4,3 М NaCl. Полученный селекцией штамм галобактерий культивировали в жидкой комплексной синтетической среде (количества компонентов приведены в г/л), содержащей: ● 18 аминокислот: D,L-аланин — 0,43; L-аргинин 0,4; D,L-аспарагиновая кислота — 0,45; L-цистеин 0,05; L-глутаминовая кислота — 1,3; L-глицин — 0,06; D,L-гистидин — 0,3; DL-изолейцин — 0,44; L-лейцин — 0,8; L-лизин — 0,85; D,L-метионин — 0,37; D,L-фенилаланин — 0,26; L-пролин — 0,05; D,Lсерин — 0,61; D,L-треонин — 0,5; L-тирозин — 0,2; D,L-триптофан — 0,5; D,Lвалин — 1,0 г/л; ● нуклеотиды: аденозин-5-монофосфат — 0,1; уридин-5-монофосфат — 0,1 г/л; ● соли: NaCl — 250; MgSO4.7H2O — 20; KСl — 2,0; NH4Cl — 0,5; KNO3 — 0,1; KH2PO4 — 0,05; K2HPO4 — 0,05; Na+-цитрат — 0,5; MnSO4.2H2O — 3.10–4; CaCl2.6H2O — 0,065; ZnSO4.7H2O — 4.10-5; FeSO4.7H2O — 5.10–4; CuSO4.5H2O — 5.10–5 г/л; ● глицерин — 1,0 г/л; ● ростовые факторы: биотин — 1.10–4; фолиевая кислота — 1,5.10–4; витамин В12 — 2.10–5 г/л. Выращивание бактерий проводили в колбах Эрленмейера вместимостью 500 мл (объем реакционной смеси — 100 мл) 3–4 сут. при 35–37 0С в условиях интенсивной аэрации (расход воздуха — 0,5–2 л/мин на 1 л среды) в орбитальном шейкере 380-S (“Biorad”, Венгрия) и освещении монохромными люминисцентными лампами ЛДС-40-2 (40 Вт) (ООО “АльфаЭлектро”, Россия) (3 лампы освещенностью 1,5 лк). Бактериальный рост изучали по оптической плотности бактериальной суспензии, измеренной при длине волны λ = 620 нм на спектрофотометре Beckman DU-6 (“Beckman Coulter”, США). Процедура выделение бактериородопсина из пурпурных мембран галобактерий и все последующие стадии выделения и очистки белка производились с использованием светозащитной лампы, снабженной оранжевым светофильтром ОРЖ-1X (75×50 см) (“Marbel”, Германия). В оптимальных условиях выращивания галобактерий, показанных на рис. 3, б, относительно контроля (рис. 3, а) на пептоновой среде в клетке синтезировался каротиноидсодержащий фиолетовый пигмент, по спектральному соотношению белкового и хромофорного фрагментов молекулы D280/D568 = 1,5 : 1 полностью идентичный природному бактериородопсину. Как показали результаты исследования, рост галобактерий Halobacterium halobium на комплексной синтетической среде (рис. 3, б) ингибировался незначительно по сравнению с контролем (рис. 3, а) на пептоновой среде. Это существенно упрощает и удешевляет оптимизацию условий биосинтеза бактериородопсина, которые заключаются в культивировании галобактерий в синтетической среде при освещении монохромным светом с длиной волны λ = 560 нм в течение 45 сут при 35 0С. Существенным преимуществом является то, что в отличие от пептоновой среды, синтетическая среда не содержит в своем составе загрязняющих белковых продуктов, которые могут усложнить последующее выделение и очистку бактериородопсина.
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 8 http://naukovedenie.ru 13TVN214 Рис. 3. Динамика роста галобактерии Halobacterium halobium, измеренная по оптической плотности клеточной суспензии при λ = 620 нм на спектрофотометре Beckman DU-6 (“Beckman Coulter”, США) в различных экспериментальных условиях: пептоновая среда (а), комплексная синтетическая среда (б). Условия выращивания: период инкубации 4–5 сут при 35 0С, освещение монохромным светом с длиной волны λ = 560 нм. Контроль – пептоновая среда Выделение и очистка бактериородопсина Основными этапами получения бактериородопсина являлись: ● выращивание галобактерий Halobacterium halobium на синтетической среде; ● дезинтеграция клеток и лизис клеточных стенок; ● выделение фракции пурпурных мембран; ● очистка пурпурных мембран от низко- и высокомолекулярных примесей, клеточной РНК, каротиноидов и липидов; ● растворение пурпурных мембран в 0,5%-ном растворе ионного детергента додецилсульфата натрия (ДДС-Na) с образованием микроэмульсии; ● Осаждение бактериородопсина из микроэмульсии метанолом; ● гель-проникающая хроматография (ГПХ) на сефадексе G-200;
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 9 http://naukovedenie.ru 13TVN214 ● электрофорез в 12,5%-ном полиакриламидном (ПААГ) геле с 0,1%-ным ДДСNa. Поскольку выделяемый белок локализуется в пурпурных мембранах, освобождения от низкомолекулярных примесей и внутриклеточного содержимого достигали осмотическим шоком клеток дистиллированной водой на холоде после удаления 4,3 М NaCl и последующим разрушением клеточной оболочки ультразвуком с частотой 22 кГц. Последующую обработку клеточного гомогената ферментом РНК-азой (23 ед. акт.) проводили для разрушения клеточной РНК. В результате получаются фрагменты пурпурных мембран, содержащих бактериородопсин [11]. Поскольку фракция пурпурных мембран наряду с выделяемым белком в комплексе с липидами и полисахаридами содержала примесь связанных каротиноидов и посторонних белков, применялись специальные методы фракционирования белка без повреждения его нативной структуры и диссоциации ретинального остатка. Это существенно усложняло задачу выделения индивидуального бактериородопсина с применением методов декаротинизации и делипидизации (удаление каротиноидов и липидов), а также очистки и колоночной ГПХ на сефадексе. Декаротинизация, заключающаяся в многократной обработке суспензии пурпурных мембран 50%-ным этанолом при 4 0С, являлась рутинным, но обязательным этапом, несмотря на значительные потери хромопротеина. Использовалось не менее пяти обработок 50%-ным этанолом, чтобы получить спектр поглощения суспензии очищенных от каротиноидов (4) и (5) пурпурных мембран (степень хроматографической чистоты 8085 %), показанного на рис. 4 на различных стадиях обработки (б) и (в) относительно природного бактериородопсина (а). Образование 13ретинальпротеинового комплекса в молекуле бактериородопсина приводит к батохромному сдвигу в спектре поглощения пурпурных мембран (рис. 4, в). Основная полоса (1) при максимуме поглощения = 568 нм, вызванная световой изомеризацией хромофора по С13=С14-кратной связи определяется наличием 13-транс-ретинального остатка в основной спектральной форме БР568, а дополнительная малоинтенсивная полоса (2) при =412 нм характеризует незначительную примесь образующейся на свету спектральной формы метабактериородопсина M412 c депротонированной альдиминной связью между остатком 13транс-ретиналя и белком (рис. 4, а–в). Общая полоса (3) при =280 нм определяется поглощением ароматических аминокислот (фенилаланин, тирозин, триптофан) в полипептидной цепи белка (для чистого бактериородопсина соотношение поглощений D280/D568 равно 1,5 : 1). Данный метод биосинтеза бактериородопсина позволяет для лучшего результата контролировать содержание ароматических аминокислот – фенилаланина, тирозина и триптофана в ростовой среде штамма-продуцента, добавляемых в количествах 0,26, 0,2 и 0,5 г/л.
Интернет-журнал «НАУКОВЕДЕНИЕ» Выпуск 2, март – апрель 2014 Опубликовать статью в журнале - http://publ.naukovedenie.ru Институт Государственного управления, права и инновационных технологий (ИГУПИТ) Связаться с редакцией: publishing@naukovedenie.ru 10 http://naukovedenie.ru 13TVN214 Рис. 4. Спектры поглощения суспензии пурпурных мембран (в 50%-м растворе этанола (в Н2О)) на различных стадиях обработки: природный бактериородопсин (а); пурпурные мембраны после промежуточной обработки (б); очищенные от посторонних каротиноидов пурпурные мембраны (в). Полоса (1) – основная спектральная форма бактериородопсина БР568, (2) – примесь спектральной формы мета-бактериородопина М412, (3) – общая полоса поглощения ароматических аминокислот, (4) и (5) – посторонние каротиноиды. Контроль – природный бактериородопсин. Вертикальная ось (D) означает поглощение (отн. ед.), горизонтальная ось – диапазон длин волн (нм) при сканировании спектрофотометром Фракционирование и тщательная хроматографическая очистка белка являлись следующим необходимым этапом. Поскольку бактериородопсин, будучи трансмембранным белком, пронизывает билипидный слой в виде семи α-сегментов, применение сульфата аммония и других традиционных высаливающих агентов не дает положительного результата при выделении белка. Решение проблемы заключалось в переводе белка в растворимую форму за счет коллоидного растворения (солюбилизацией) полученной фракции пурпурных мембран в 0,5%-ном растворе ДДС-Na с последующим низкотемпературным осаждением из них белка метанолом. Использование в качестве ионного детергента ДДС-Na диктовалось необходимостью максимальной солюбилизации белка с комбинированием стадии делипидизации и осаждения в нативном (с сохранением природной конфигурации) виде, поскольку солюбилизированный бактериородопсин сохраняет спиральную α-конфигурацию [12]. Поэтому отпала необходимость использования органических растворителей — ацетона, метанола и хлороформа для очистки от липидов, а делипидизация и осаждение белка совмещались в одну единственную стадию, существенно упрощающую фракционирование